전사적인 휴식 및 재충전 캠페인의 일환으로, 전 세계 모든 Schrödinger 사무실은 8월 17일부터 21일까지 한 주 동안 휴무합니다. 이 기간에는 회신이 지연될 수 있는 점 양해 부탁드립니다. 과학 및 기술 지원 팀은 긴급 지원 요청에 한하여 대응할 예정입니다.

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패널 및 워크플로우를 다루는 포괄적인 참조 문서.

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튜토리얼

Schrödinger 도구에 익숙해질 수 있도록 예제 파일을 포함한 다양한 워크플로우에 대한 단계별 자율 학습 안내서입니다.

  • 튜토리얼
화학자를 위한 가이드 Maestro

의약 화학자들이 아이디어를 구상하고 lead optimization 하는 과정에서 유용한 기본 Maestro 작업들.

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  • 튜토리얼
자유 에너지 섭동을 이용한 BACE1 억제제 설계

FEP+ 를 사용하여 일련의 BACE1 억제제에 대한 자유 에너지 섭동(FEP) 시뮬레이션을 준비하고, 실행하며, 분석합니다.

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  • 튜토리얼
다중 서열 뷰어/에디터를 이용한 키메라 상동성 모델링

다중 서열 뷰어/에디터(MSV)를 사용하여 키메라 상동성 모델을 구축하십시오.

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  • 튜토리얼
구조 준비 및 시각화 개론

Maestro 에서 리간드 및 단백질 구조의 생성 및 시각화.

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  • 튜토리얼
BioLuminate 및 다중 서열 뷰어/에디터 소개

효소를 준비하고 시각화한 다음, 서열을 분석하여 잔기 보존성을 확인하고, MSV를 사용하여 상동성 모델을 구축하십시오.

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  • 튜토리얼
다중 서열 뷰어/에디터를 사용하여 상동 모델 구축하기

MSV를 사용하여 상동 모델을 구축하고 정교화하십시오.

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  • 튜토리얼
다중 서열 뷰어/에디터를 이용한 배치 호모로지 모델링

MSV를 사용하여 단일 템플릿으로 여러 개의 상동 모델을 구축합니다.

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  • 튜토리얼
Ligand Designer를 활용한 WaterMap 기반 Lead Optimization

Ligand Designer를 사용하여 불안정한 물 분자를 대체하고 표적 분자를 최적화하세요.

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  • 튜토리얼
리간드 디자이너를 이용한 단백질-리간드 상호작용 형성

Ligand Designer를 사용하여 단백질-리간드 상호작용을 형성하고 유망 분자를 최적화하세요.

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  • 튜토리얼
DeepAutoQSAR를 활용한 ADMET 모델 훈련 및 평가

대규모 데이터셋을 활용하여 수성 환경에서의 용해도 를 예측하기 위한 두 가지 모델을 구축하고 테스트하십시오.

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  • 튜토리얼
막 결합 단백질에 IFD-MD 적용

IFD-MD를 위해 막 결합 단백질을 설정하고 결과를 시각화합니다.

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  • 튜토리얼
다음 방법을 이용한 구조 기반 가상 스크리닝 Glide

도킹을 위한 수용체 그리드를 준비하고, 도킹 분자를 도킹시킨 후 도킹된 자세를 검토합니다.

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  • 튜토리얼
MM-GBSA를 이용한 감점된 리간드의 재평가

결합 포즈를 최적화하고 소규모 가상 스크리닝 결과를 재평가한다.

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  • 튜토리얼
MacroModel 및 ConfGen을 이용한 소분자의 구조 분석

관련 소분자의 비틀림 프로파일을 조사하고, 구조가 분자 내 및 분자 간 상호작용에 어떤 영향을 미치는지 규명한다.

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  • 튜토리얼
SiteMap 및 WaterMap을 활용한 타겟 분석

수용체에서 잠재적인 활성 부위를 규명한다.

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  • 튜토리얼
WaterMap을 활용한 결합 부위 요건 및 결합 부위 주변 영역( Lead Optimization ) 파악

WaterMap 및 WM/MM 스코어링 결과를 분석하여 불안정한 결합수를 파악하고 리간드 결합을 평가합니다.

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  • 튜토리얼
A2A와 결합한 막 결합형 FEP+

FEP+ 를 사용하여 일련의 A2A 억제제에 대한 막 결합 단백질의 자유 에너지 섭동(FEP) 시뮬레이션을 준비, 실행 및 분석합니다.

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  • 튜토리얼
도서관 설계를 위한 열거 도구

열거 도구를 사용하여 CDK2 억제제의 lead optimization 를 위한 라이브러리를 설계하십시오.

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  • 튜토리얼
공유결합된 리간드에 IFD-MD 적용

공유결합된 리간드에 대해 IFD-MD를 설정하고 결과를 시각화하십시오.

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동영상

특정 입문 및 과학 주제에 대한 짧은 동영상 개요와 함께, 새로 출시된 기능에 대한 요약도 포함되어 있습니다.

  • 비디오
Maestro 프로젝트 설정하기

‘ Maestro 시작하기’ 동영상 시리즈의 첫 번째 영상: 작업 디렉터리, 프로젝트 저장, 마우스 동작 사용자 지정.

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  • 비디오
에서 구조체 가져오기 및 렌더링 Maestro

‘ Maestro 시작하기’ 동영상 시리즈의 두 번째 영상: 단백질 데이터 뱅크(PDB)에서 구조 가져오기, 선택 및 포함, 스타일 지정.

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  • 비디오
에서 객체 및 애플리케이션과 상호작용하기 Maestro

‘ Maestro 시작하기’ 동영상 시리즈의 세 번째 영상: Maestro 에서 마우스 오른쪽 버튼 사용법, 즐겨찾기 도구 모음, 작업 탐색 방법.

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  • 비디오
2D에서 리간드 수정 및 리간드 정렬 Maestro

‘ Maestro 시작하기’ 동영상 시리즈의 네 번째 동영상: 2D Sketcher, 리간드 정렬.

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  • 비디오
3D에서 화합물 수정하기 Maestro

‘ Maestro 시작하기’ 동영상 시리즈의 다섯 번째 영상: 3D Builder를 활용한 새로운 화합물 설계.

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  • 비디오
Workspace 켜기/끄기 Maestro

‘ Maestro 시작하기’ 동영상 시리즈의 여섯 번째 동영상: workspace 토글, 시퀀스 뷰어.

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  • 비디오
구조 계층 를 사용하여 표면 추가하기 Maestro

‘ Maestro 시작하기’ 동영상 시리즈의 일곱 번째 동영상: 구조 계층 표면 추가하기.

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  • 비디오
리간드 상호작용 다이어그램 및 이미지 생성 Maestro

‘ Maestro 시작하기’ 동영상 시리즈의 여덟 번째 동영상: 리간드 상호작용 다이어그램 이미지 공유.

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  • 비디오
리간드 준비 그리고 Job Monitor 에서 Maestro

‘ Maestro 시작하기’ 동영상 시리즈의 아홉 번째 동영상: LigPrep 의 ‘ 리간드 준비 ’, Job Monitor, 리간드 정렬.

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  • 비디오
단백질 구조의 준비 Maestro

‘ Maestro 시작하기’ 동영상 시리즈의 열 번째 영상: Protein Preparation Workflow 를 이용한 단백질 전처리, Glide 도킹 계산 설정.

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  • 비디오
Ligand Designer를 활용한 표적화된 R-그룹 열거 Maestro

‘ Maestro 시작하기’ 동영상 시리즈의 11번째 동영상: R-그룹 리간드 디자이너를 활용한 열거 및 도킹, MPO 사용자 정의, 리간드 디자이너 출력 결과 후처리.

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  • 비디오
BioLuminate 프로젝트 설정하기

‘ Maestro BioLuminate 시작하기’ 동영상 시리즈의 첫 번째 영상: 작업 디렉터리 변경, 프로젝트 저장 등.

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  • 비디오
BioLuminate에서 구조체 가져오기 및 렌더링

‘ Maestro BioLuminate 시작하기’ 동영상 시리즈의 두 번째 영상: 단백질 데이터 뱅크(PDB)에서 구조 가져오기, 선택 및 포함, 그리고 ‘ workspace ’ 스타일링 옵션에 대해 다룹니다.

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  • 비디오
BioLuminate에서 객체 및 애플리케이션과 상호작용하기

‘ Maestro BioLuminate 시작하기’ 동영상 시리즈의 세 번째 영상: BioLuminate에서 마우스 오른쪽 버튼을 사용하는 방법, 표면 관리.

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  • 비디오
BioLuminate에서 애플리케이션과 상호작용하고 즐겨찾기에 추가하기

‘ Maestro BioLuminate 시작하기’ 동영상 시리즈의 네 번째 영상: 즐겨찾기 도구 모음, 작업 메뉴 탐색하기.

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  • 비디오
BioLuminate의 ‘ Workspace ’ 토글 및 ‘ 구조 계층 ’ 소개

‘ Maestro 시작하기’ BioLuminate 동영상 시리즈의 다섯 번째 영상: workspace 토글, 구조 계층, 구조 계층 에 항체 주석 추가, 그리고 측정 수행.

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  • 비디오
BioLuminate의 잔기 번호 재지정 및 프로젝트 테이블 미리 살펴보기

‘ Maestro BioLuminate 시작하기’ 동영상 시리즈의 여섯 번째 영상: 사슬 및 잔기 이름 변경, 프로젝트 테이블.

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간편 참조 자료

패널이나 워크플로우를 시각적으로 설명하는 1페이지 분량의 PDF 파일.

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222개의 결과가 검색되었습니다.
  • 튜토리얼
소분자의 막 투과성

일련의 소분자들의 막 투과성을 예측하십시오.

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  • 튜토리얼
가상 스크리닝 및 자세 예측을 위한 공유결합 도킹

도킹 사전 정의된 또는 맞춤형 반응 화학을 이용하여 수용체에 공유 결합하는 일련의 리간드.

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  • 튜토리얼
GPU를 활용한 화학 라이브러리의 신속 스크리닝 Shape

GPU를 활용하여 20,000개 화합물로 구성된 화학 라이브러리에 대해 형상 기반의 신속한 스크리닝을 수행합니다. Shape.

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  • 튜토리얼
다중 서열 뷰어/에디터를 이용한 키메라 상동성 모델링

다중 서열 뷰어/에디터(MSV)를 사용하여 키메라 상동성 모델을 구축하십시오.

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  • 튜토리얼
다중 서열 뷰어/에디터를 이용한 항체의 서열 주석 달기

다중 서열 뷰어/에디터(MSV)를 사용하여 항체 서열에 잔기 수준의 속성을 주석으로 추가할 수 있습니다.

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  • 튜토리얼
다중 서열 뷰어/에디터를 사용하여 상동 모델 구축하기

MSV를 사용하여 상동 모델을 구축하고 정교화하십시오.

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  • 튜토리얼
BioLuminate 및 다중 서열 뷰어/에디터 소개

효소를 준비하고 시각화한 다음, 서열을 분석하여 잔기 보존성을 확인하고, MSV를 사용하여 상동성 모델을 구축하십시오.

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  • 튜토리얼
다중 서열 뷰어/에디터를 이용한 배치 호모로지 모델링

MSV를 사용하여 단일 템플릿으로 여러 개의 상동 모델을 구축합니다.

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  • 튜토리얼
IFD-MD를 활용한 크로스도킹

IFD-MD를 사용하여, 다른 리간드로 해결된 홀로 구조를 출발점으로 삼아 알려진 활성 화합물의 예측 결합 자세를 생성합니다.

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  • 튜토리얼
리간드 디자이너를 이용한 단백질-리간드 상호작용 형성

Ligand Designer를 사용하여 단백질-리간드 상호작용을 형성하고 유망 분자를 최적화하세요.

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  • 튜토리얼
기하 최적화, 함수식 및 기저 집합 개론

간단한 유기 분자에 대해 기하 최적화를 수행하고, 함수식과 기저 집합에 관한 기초를 학습합니다.

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  • 튜토리얼
전환 상태 찾기: 1부

표준 TS 탐색, 좌표 스캔, AutoTS 등 세 가지 방법을 통해 전형적인 유기금속 반응의 전이 상태(TS)를 찾아냅니다.

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온라인 자격증 과정

실습 중심의 온라인 ‘ 분자모델링 ’ 과정을 통해 여러분의 역량을 한 단계 높여보세요. 이 자기 주도형 과정은 다양한 과학 주제를 다루며, ‘ Schrödinger ’ 소프트웨어 이용 권한과 지원 서비스가 포함되어 있습니다.

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Schrödinger를 활용한 교육

웹 기반 플랫폼을 통해 학생들에게 업계 최고의 ‘ 분자모델링 ’ 소프트웨어를 접할 기회를 제공하세요. 교실 수업에 ‘ 분자모델링 ’를 활용하세요.

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