전 세계 모든 슈뢰딩거 사무소는 휴식과 재충전을 위한 전사적 조치의 일환으로 8월 17일부터 21일까지 일주일간 휴무합니다. 이 기간 동안 문의에 대한 답변이 제한될 수 있으니 양해 부탁드립니다. 과학 및 기술 지원팀 직원들은 긴급 지원 문의에 한해 대응할 예정입니다.

펩타이드 발굴

컴퓨터 시뮬레이션을 이용한 구조 기반 기법을 활용하여 펩타이드 약물을 설계한다

펩타이드 발굴
배경 패턴

계산 기반 펩타이드 설계의 이점을 살펴보세요

초기 천연 펩타이드를 넘어 대규모로 열거하고 아이디어를 도출한다

표준 및 비표준 아미노산으로의 치환, 맞춤형 백본 변형, 그리고 다양한 고리화 반응을 탐구하여 원하는 특성을 지닌 새로운 천연 펩타이드 또는 펩타이드 모방체를 합성해 보세요.

구조적 경관 탐구

3D 구조를 예측하고, 구조적으로 다양한 컨포메이션의 상대적 결합 자유 에너지를 계산하며, 가장 타당한 결합 방식을 선정합니다.

펩타이드의 주요 특성을 예측한다

원하는 특성과 막 투과성, 용해도 등 관련 물리화학적 특성을 지닌 펩타이드 구조의 설계 및 최적화를 촉진함으로써 펩타이드 발굴을 주도한다.

펩타이드-표적 상호작용 이해하기

전문적인 도킹 도구, 분자 동역학 및 첨단 자유 에너지 섭동 계산을 활용하여, 실험 수준에 근접한 정확도로 결합 친화도, 선택성, 열안정성 및 pH 의존성을 예측합니다.

 

슈뢰딩거의 최첨단 소프트웨어를 활용하여 고품질 생물학적 제제를 설계하세요

BioLuminate


생물학적 제제 발굴을 위한 모델링 환경

LiveDesign


디지털 생물학적 제제 공동 설계 및 신약 발굴 연구소

당신은 훌륭한 분들과 함께하고 계십니다

“LiveDesign은 모든 것을 바꿔 놓았습니다. 저희는 화합물 설계의 일상적인 업무에 이 도구를 활용하고 있습니다. 전체 팀이 함께 협업하여 화합물을 모델링하고, 소분자 및 펩타이드 모델링에 유용한 다양한 슈뢰딩거(Schrodinger) 앱도 활용하고 있습니다. FEP는 펩타이드에 대한 친화도를 매우 정확하게 예측할 수 있으며, 특히 용매에 노출되거나 단백질과 상호작용할 수 있는 위치 유형에 대해 뛰어난 예측 능력을 보여줍니다. 펩타이드 모델링에 FEP를 활용하는 것이 우리 팀에 매우 효과적이었습니다.”

–도냐 오하디(Donya Ohadi)
J&J Innovative Medicine

간행물

관련 응용 분야에서 슈뢰딩거 기술을 활용한 동료 심사를 거친 논문 목록을 살펴보세요.

생명과학 간행물

α-코노톡신 LvIA의 11번 위치에 있는 기본 잔기는 정전기적 기전을 통해 α3β2 및 α3β4 니코틴성 수용체 간의 아형 선택성에 영향을 미친다

생명과학 간행물

단백질-단백질 상호작용 부위의 구조 기반 평가 및 약물화 가능성 분류

생명과학 간행물

PCSK9 및 HMG-CoAR 이중 억제 활성을 지닌 루핀 펩타이드 P5 유사체의 전산 설계 및 생물학적 평가

생명과학 간행물

소마토스타틴 수용체에서 리간드 인식의 가소성

생명과학 간행물

니코틴성 아세틸콜린 수용체에 대한 코노톡신의 효능 및 선택성을 향상시키는 돌연변이는 정확한 자유 에너지 계산을 통해 예측할 수 있다

생명과학 간행물

전압 의존성 나트륨 채널 NaV1.7에 대한 게이트 조절 독소의 효능 강화 돌연변이는 정확한 자유 에너지 계산을 통해 예측할 수 있다

생명과학 간행물

이온 채널상의 펩타이드 독소 결합 부위의 수열역학

생명과학 간행물

치료용 거대고리 화합물의 자동 설계: 소분자에서 펩타이드 및 단백질까지

생명과학 간행물

포괄적인 전산 및 생물물리학적 특성 분석을 통한 치료용 단백질 발굴 및 개발 촉진

생명과학 간행물

다중 그라눌린 도메인 펩타이드는 프로카텝신 D에 결합하며, 시험관 내에서 프로그라눌린보다 더 효과적으로 그 효소 활성을 촉진한다

문서 및 튜토리얼

Schrödinger 소프트웨어 사용과 관련된 자주 묻는 질문에 대한 답변을 확인하고, 모범 사례를 알아보세요.

생명과학 튜토리얼

학습 과정: 순환 펩타이드 모델링

신약 개발 분야에서 순환 펩타이드를 다루는 도구와 워크플로우에 대한 체계적인 개요.

생명과학 튜토리얼

비표준 아미노산의 취급

비표준 아미노산(NSAA)을 설계하고, 해당 NSAA를 데이터베이스에 추가한 뒤, 설계된 NSAA를 반영한 MM-GBSA 잔기 스캐닝을 실행하고 분석한다.

생명과학 튜토리얼

사이클릭 펩타이드의 합성 및 기준 구조에 대한 정렬

LigPrep을 사용하여 모델링에 활용할 순환 펩타이드를 합성하고, tug_align 스크립트를 통해 이를 기준 구조에 정렬합니다.

생명과학 튜토리얼

펩타이드 고리화

명령줄 인터페이스를 통해 macrocyclize.py 스크립트를 사용하여 펩타이드를 고리화시키고, Prime MM-GBSA를 사용하여 고리화된 구조들을 순위별로 정렬합니다.

생명과학 문서화

LiveDesign ML

LiveDesign 내에서 지도 학습 모델링 파이프라인을 배포하기 위한 고도로 자동화된 시스템을 제공하는 LiveDesign 플러그인입니다.

생명과학 문서화

프라임

상동성 모델링과 폴드 인식 기능을 하나의 솔루션에 통합한 완전 통합형 단백질 구조 예측 솔루션입니다.

생명과학 문서화

FEP+

실험적 방법과 동등한 정확도를 지닌 물리 기반 자유 에너지 섭동 기술을 활용한 단백질-리간드 결합의 전산적 예측.

생명과학 문서화

포스 필드 빌더

OPLS4 또는 OPLS5 힘장에 명시적으로 포함되지 않은 토션은, 일련의 분자에 대한 양자역학적 계산 결과에 맞춰 조정함으로써 사용자 정의할 수 있습니다.

생명과학 문서화

Desmond

GPU 기반의 고성능 분자 동역학(MD) 엔진을 활용하여 생물학적 시스템을 시뮬레이션합니다.

생명과학 문서화

BioLuminate

생물학적 제제 신약 개발을 위한 슈뢰딩거의 종합 모델링 플랫폼.

주요 제품

연구 프로젝트의 진전을 도모하는 데 활용할 수 있는 주요 컴퓨팅 기술에 대해 자세히 알아보세요.

BioLuminate

생물학적 제제 신약 개발을 위한 종합 모델링 플랫폼

LiveDesign

완벽한 디지털 분자 설계 실험실

프라임

정확한 단백질 구조 예측을 위한 강력하고 혁신적인 솔루션

MacroModel

다용도로 활용 가능하며 다양한 기능을 갖춘 분자 모델링 프로그램

Glide

업계 최고의 리간드-수용체 도킹 솔루션

PIPER

최첨단 단백질-단백질 도킹 프로그램

FEP+

신약 개발을 위한 고성능 자유 에너지 계산

조직의 요구 사항을 충족시키는 소프트웨어 및 서비스

소프트웨어 플랫폼

분자 모델링, 설계 및 협업을 위한 포괄적이고 사용자 친화적인 플랫폼을 활용하여 디지털 신약 개발 워크플로를 구축하십시오.

모델링 서비스

슈뢰딩거의 방대한 계산 전문 지식과 기술을 활용하여 신약 개발 과정의 주요 단계를 성공적으로 통과하고 프로젝트를 발전시켜 나가십시오.

지원 및 교육

초보자와 숙련된 사용자 모두를 위해 마련된 전문가 지원, 교육 자료 및 교육 리소스를 이용하세요.