FEP+를 활용한 신약 설계용 자유 에너지 계산

FEP+를 활용한 신약 설계용 자유 에너지 계산


소분자 선도 화합물 최적화를 위한 상대 결합 FEP+ 계산의 실행, 분석 및 문제 해결

상세 정보
지원 언어
중국어, 영어, 일본어, 한국어
기간
완료까지 3주 / 약 15시간 소요
레벨
고급
비용
비학생 이용자의 경우 1,510달러
학생 및 박사후 연구원: 915달러
과정 기간
강좌 등록 시, 원하시는 시작일과 종료일을 선택하실 수 있습니다. 해당 기간 내에서는 비동기 방식으로 강좌에 접속하여 본인의 일정에 맞춰 학습하실 수 있습니다.

개요

계산적 방법은 소분자와 단백질 표적 간의 결합 친화도를 예측함으로써 신약 개발 프로젝트를 촉진하는 데 도움이 될 수 있습니다. 슈뢰딩거의 FEP+와 같은 자유 에너지 섭동 기법은 신약 설계 과정에서 결합 친화도에 대한 정확한 예측을 제공할 수 있습니다. 그러나 이러한 계산은 전문 지식이 필요한 고도의 계산입니다. 전산 화학자 및 신약 설계자들은 FEP+ 실행에 대한 실습 교육을 통해 모범 사례를 적용하고 결과에 대한 철저한 분석을 수행할 수 있습니다. 이 과정에서는 슈뢰딩거의 FEP+ 작동 원리에 대한 개요를 파악하고, 상대적 결합 친화도 FEP+ 기술을 여러 데이터 세트에 적용하며, 일반적인 분석 기법을 수행하는 방법을 배우게 됩니다.

이 과정은 자격증과 배지를 취득하여 전문성을 키우고 이력서를 더욱 알차게 만들고자 하는 분들에게 이상적입니다.

  • 업계 최고의 슈뢰딩거 FEP+를 직접 체험해 보세요
  • 진행 중인 프로젝트에 바로 적용할 수 있는 방법을 익혀 연구 프로그램을 빠르게 시작하세요
  • FEP+ 맵 생성부터 pKa 보정에 이르기까지 다양한 주제를 배워보세요
  • 새로운 화합물을 설계하고 전향적 FEP+를 수행하여 사례 연구를 완료함으로써, 본 강좌의 내용을 숙지했음을 입증하십시오.
  • 강좌 과제 및 강좌 관련 문의 사항에 대해 슈뢰딩거 교육팀 전문가들의 검토와 피드백을 받아보세요
  • 강좌 기간 중 본인의 일정에 맞춰 편한 시간에 학습 자료를 학습하십시오.

 

이 과정에는 과정 수강에 필요한 라이선스와 컴퓨팅 리소스가 포함된 웹 기반 슈뢰딩거(Schrödinger) 소프트웨어 이용 권한이 제공됩니다:

요구 사항
  • 안정적인 고속 인터넷 접속(8 Mbps 이상)이 가능한 컴퓨터
  • 마우스 및/또는 외장 모니터 (권장되나 필수는 아님)
  • 일반 화학에 대한 실무 지식
  • Maestro에 대한 실무 지식. 이 과정에서는 슈뢰딩거의 그래픽 사용자 인터페이스인 Maestro의 사용법을 다루지 않습니다. Maestro 사용법에 익숙해지려면 ‘Maestro 시작하기’ 자료를 참고하여 학습해 주시기 바랍니다.
인증
  • 슈뢰딩거 과정 책임자가 서명한 수료증
  • LinkedIn과 같은 소셜 미디어에 게시할 수 있는 배지
배경 무늬

배울 내용

자유 에너지 섭동의 기초

자유 에너지 섭동 기법의 역사 및 이론을 이해하고, 이러한 기법이 신약 개발 프로그램에 이미 어떤 영향을 미치고 있는지 파악한다.

FEP+용 구조물 준비

상대적 결합 FEP+ 작업을 위한 단백질 및 리간드 준비 모범 사례

일반적인 문제 해결 방법

FEP+ 성능을 향상시키기 위해 시뮬레이션 시간 연장, pKa 보정, 사용자 정의 코어(Custom Cores) 활용, REST 영역에 단백질 잔기 추가 등을 탐구함 

프로젝트에 FEP+ 적용하기

실무 중심의 사례 연구를 통해 여러분의 역량을 발휘하여, 새로운 비장 티로신 키나제(Syk) 억제제를 설계하고 FEP+를 활용하여 그 특성을 전향적으로 분석해 보십시오.

모듈

모듈 1
2시간

자유 에너지 섭동의 소개 및 배경 설명

동영상
동영상

강좌 개요: FEP+를 활용한 신약 설계용 자유 에너지 계산

체크포인트
체크포인트

명예 규약 동의서

동영상
동영상

자유 에너지 섭동 및 FEP+ 방법 소개

체크포인트 종료
모듈 종료 점검점
모듈 2
4시간 + 연산 시간

FEP+용 구조물 준비

동영상
동영상

FEP+ 모범 사례 및 구조물 전처리 작업의 중요성

동영상 튜토리얼
동영상 튜토리얼
  • 단백질의 정제 및 검증
  • 리간드 합성 및 정렬
체크포인트 종료
모듈 종료 점검점
모듈 3
3시간 + 연산 시간

상대 결합 FEP+: 계산 설정 및 실행

동영상 튜토리얼
동영상 튜토리얼
  • FEP+ 패널 소개
  • 맵 생성 및 회고적 상대 결합 친화도 FEP+ 계산 실행 
체크포인트 종료
모듈 종료 점검점
모듈 4
4시간 + 연산 시간

FEP+ 작업 분석 및 문제 해결

동영상 튜토리얼
동영상 튜토리얼

FEP+ 결과 분석 

과제
과제

상관도 그래프 생성

튜토리얼
튜토리얼

FEP+ 결과 문제 해결

체크포인트 종료
모듈 종료 점검점
모듈 5
2시간 + 연산 시간

소분자 약물 설계: FEP+ 기반 사례 연구

튜토리얼
튜토리얼
  • 새로운 화합물 설계 및 전향적 상대 결합 친화도 FEP+ 계산 수행
  • FEP+ 맵 병합: 신규 및 기존에 검증된 화합물 분석
과제
과제

사례 연구 결과를 검토하고 논의한다

수강 완료
과정 수료 및 수료증 발급

슈뢰딩거 온라인 강좌 자금 조달에 도움이 필요하신가요?

저희는 차세대 과학자들을 자랑스럽게 지원하며, 경제적 여건이 어려운 분들에게 기회를 제공하기 위해 최선을 다하고 있습니다. 학생, 박사후 연구원 또는 산업계 과학자로서 온라인 인증 과정에 대한 다양한 지원 옵션을 확인하고, 지금 바로 등록하세요!

졸업생들의 소감

“이 과정은 FEP+ 계산의 기본 원리와 작업 흐름을 명확하게 설명해 주었습니다. 약물 설계를 위해 전산 모델링을 활용하고자 하는 분들께 이 과정을 적극 추천합니다.”
케이트 코스테노바 박사후연구원
“과정 초반에 구조 품질 평가에 중점을 둔 점에 기분 좋게 놀랐습니다. 이는 실제로 프로젝트를 서둘러 시작하다 보면 간과되기 쉬운 부분이지만, 제 생각에는 정말로 중요한 요소라고 생각합니다.”
이반 세르게예프, ROME 테라퓨틱스 계산화학 부문 수석 연구원
“구조 기반 신약 설계에 컴퓨터 화학을 적용하는 방법에 대해 더 깊이 배우고 싶은 분이라면 누구에게나 슈뢰딩거 온라인 강좌를 적극 추천합니다.”
계산화학 분야 대학원생
“명확한 설명 덕분에 […] 어려운 작업도 아주 쉽게 해낼 수 있었습니다. 이번에 얻은 지식을 바탕으로 현재 진행 중인 프로젝트의 실험을 설계하고, 관련 논문을 예전보다 훨씬 더 빠르게 이해할 수 있게 되었습니다.”
안나 두덱, 장공의료재단 박사후 연구원
“실습 과제와 실제 사례 연구는 특히 유익했으며, 이를 통해 FEP+에 대한 이해와 리드 최적화를 위한 계산 워크플로우에 이를 통합하는 방법을 더욱 확실히 다질 수 있었습니다. 이 과정은 합리적 신약 설계를 위해 FEP+를 활용하는 데 대한 저의 자신감을 한층 더 키워준 훌륭한 학습 경험이었습니다.”
헤일 하스데미르일리노이 대학교
“FEP+를 통해 자유 에너지 계산에 대한 지식과 기술을 다시 다질 수 있어 기뻤습니다. 이 과정은 앞으로 제가 진행할 프로젝트에 분명 큰 도움이 될 것입니다.”
니콜라이 쿠즈미치, 바이츠만 과학 연구소
“이 과정을 수강하면서 제 연구에 상대적 결합 FEP를 적용해 볼 기회를 얻었으며, 기준 화합물의 실험적 결합 친화도를 바탕으로 한 제 새로운 설계에 대해 더 정확한 결합 친화도 예측 결과를 얻을 수 있을 것이라고 확신합니다.”
아니루드 마노즈와 신두 탕가라지, 주빌런트 바이오시스(주)

코스 배지와 수료증을 통해 새로 습득한 기술을 뽐내 보세요

저희 기관에서 분자 모델링 과정을 수료하고, 배운 내용을 동료나 고용주와 공유할 준비가 되셨다면, LinkedIn 프로필에 수료증과 배지를 게시하실 수 있습니다.

자주 묻는 질문

온라인 강좌 수강료는 얼마인가요?

수강료는 각 과정 및 수강생 유형에 따라 다릅니다. 해당 과정을 수강하고자 하는 학생을 대상으로, 입문 과정은 150달러, 재료과학 번들 과정은 305달러, 심화 과정은 870달러의 학생 할인 요금을 제공합니다. 일반 수강생의 경우, 입문 과정은 575달러, 심화 과정 및 번들 과정은 1,435달러입니다.

강좌는 언제 시작하나요?

강좌는 세션 단위로 운영되며, 각 세션은 3~6주 기간으로 진행됩니다. 이 기간 동안 수강생들은 강좌를 수강하고 소프트웨어를 이용할 수 있습니다. 각 강좌 페이지에서 세션 일정과 시작일을 확인하실 수 있습니다.

강의는 몇 시에 시작하나요?

강좌가 시작되면 모든 강의는 비동기식으로 진행되며, 수강생은 본인의 일정에 맞춰 동영상, 튜토리얼 및 과제를 자유롭게 시청할 수 있습니다.

이 수강료는 어떻게 내야 하나요?

관심 있는 참가자분들은 등록 절차를 완료하고 신용카드 결제 포털을 통해 즉시 수강 신청을 하시면 수강료를 결제하실 수 있습니다. 당사는 직불카드를 받지 않으므로 신용카드가 반드시 필요하다는 점을 유의해 주시기 바랍니다. 또한, 요청 시 구매 주문서를 발급해 드릴 수 있으니, 이 옵션에 관심이 있으신 분은 online-learning@schrodinger.com으로 이메일을 보내 주시기 바랍니다. 수강료 결제 방법에 대해 궁금한 점이 있으시면, 당사의 결제 옵션 페이지를 방문해 주시기 바랍니다.

등록하기 전에 강좌를 미리 살펴볼 수 있나요?
학생들을 위한 장학금 기회가 있나요?

슈뢰딩거는 경제적 여건이 어려운 학생들을 지원하기 위해 최선을 다하고 있습니다. 슈뢰딩거의 사명은 치료제 및 신소재 발굴 방식을 혁신함으로써 인류의 건강과 삶의 질을 향상시키는 것입니다. 슈뢰딩거는 차세대 과학자들을 자랑스럽게 후원합니다. 당사는 재정적 지원이 필요함을 입증하고 지도교수로부터 추천서를 받은 정규 재학생 또는 박사후 연구원을 대상으로 하는 장학금 프로그램을 마련했습니다. 저희 장학금 프로그램 지원 자격이 되신다면, 신청서를 작성해 주시기 바랍니다!

강좌가 끝난 후에도 학습 자료는 계속 이용할 수 있나요?

강좌가 종료되면 소프트웨어 이용 권한은 종료되지만, 강좌 내 일부 자료(슬라이드, 논문, 튜토리얼)는 다운로드할 수 있으므로 강좌가 끝난 후에도 다시 참고할 수 있습니다. 동영상, 퀴즈, 소프트웨어 이용 권한과 같은 다른 자료들은 강좌 기간 동안에만 이용할 수 있습니다.

이 강좌를 수강하려면 해당 소프트웨어에 접속할 수 있어야 하나요? 소프트웨어를 별도로 구매해야 하나요?

과정 기간 동안, 수강생 여러분은 (과정에 따라) Maestro, Bioluminate, Materials Science Maestro 및/또는 LiveDesign의 웹 기반 버전을 이용할 수 있습니다. 별도의 소프트웨어 이용권을 구매하실 필요는 없습니다. 과정 종료 시 소프트웨어 이용 권한은 종료되지만, 과정 내 일부 자료(슬라이드, 논문, 튜토리얼)는 다운로드가 가능하므로 과정 종료 후에도 다시 참고하실 수 있습니다. 동영상, 퀴즈, 소프트웨어 이용 권한과 같은 기타 자료는 과정 진행 기간 동안에만 이용 가능합니다. 슈뢰딩거(Schrödinger) 소프트웨어는 과정과 관련된 목적으로만 사용해야 함을 유의해 주시기 바랍니다.

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