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JAN 25, 2024

대규모 데 노보 설계를 통한 신약 개발 프로그램에 미치는 영향

고품질 화학 물질의데 노보(de novo) 설계를 보다 포괄적이고 효과적으로 가능하게 하는 기술을 개발하는 것은 신약 개발 분야에서 오랫동안 추구해 온 목표였다.

이를 위해 Schrödinger 는 최근 소분자의 효능 및 선택성 최적화를 위해 대규모 합성 친화적드 노보(de novo)설계 방법(AutoDesigner)과 엄격한 자유 에너지 기반 스코어링 방법(액티브 러닝 FEP+)을 결합하여 소분자의 효능 및 선택성을 최적화하는 워크플로우 개발을 주도해 왔습니다. 이 기술의 최근 발전은 ‘ R-그룹 ’ 설계 단계를 넘어 코어 탐색 단계로 확장되어, 초기 단계의 ‘ hit identification ’ 연구 및 백업 계열 발굴에 대한 적용 범위를 넓히고 있습니다.

이번 웨비나에서는 Schrödinger의 치료제 개발 그룹에서 수행한 최근 사례 연구 몇 가지를 소개할 예정입니다. 이 사례들에서 팀들은 이러한 ‘데 노보(de novo)’ 설계 기술을 활용하여 중대한 설계 과제를 극복하고 프로그램 진행을 가속화할 수 있었습니다.

주요 내용

  • AutoDesigner와 기타 일반적인 설계 방법 간의 실제 비교:탐색된 화학적 공간, 소요 시간, 설계 목표 달성 능력에 대한 평가를 포함
  • AutoDesigner를 활용한 hit identification 의 새로운 코어 설계
  • AutoDesigner를 활용한 히트-투-리드(hit-to-lead) 및 구조-활성 상관관계( lead optimization ) 분석 과정에서의 R-기 그룹 설계
  • 분자 접착제의 효능 및 선택성을 향상시키고,데 노보설계를 활용하여 지적재산권을 강화하는 사례
  • 신약 개발 프로그램에 해당 기술을 적용하기 위한 요건 및 모범 사례

연사 소개

피터 보스, 박사

2급 수석 연구원, Schrödinger

피터 보스(Pieter Bos)는 AutoDesigner 및 De Novo Design 워크플로우의 수석 과학자이자 제품 관리자입니다. Schrödinger 에서 그는 자동화된 화합물 설계 알고리즘의 연구, 개발 및 최적화에 주력하고 있습니다. 내부 및 협력적인 ‘ 약물 설계 ’ 프로젝트를 위한 열거형 약물 분자 라이브러리의 설계 및 실행을 총괄하는 수석 과학자입니다. 그는 흐로닝언 대학교(University of Groningen)의 벤 페링가(Ben Feringa) 교수 연구실에서 합성 유기화학 박사 학위를 취득했습니다. Schrödinger 에 합류하기 전에는 보스턴 대학교(John Porco 교수 및 Corey Stephenson 교수)에서 합성 방법론 개발 분야, 컬럼비아 대학교(Brent Stockwell 교수)에서 소분자 신약 개발 분야의 박사후 연구원으로 근무했습니다.

사테시 바트 박사

상임이사, Schrödinger

치료제 그룹의 전무 이사인 사테시 바트(Sathesh Bhat) 박사는 2011년에 아스트라제네카( Schrödinger )에 합류했습니다. 그는 Schrödinger 에서 사내 및 제휴 신약 개발 프로그램에 대한 전산 화학 업무를 총괄하고 있습니다. 이전에 사테시 박사는 머크(Merck)와 일라이 릴리(Eli Lilly)에서 근무하며 여러 신약 개발 프로그램의 전산 연구를 주도했습니다. 그는 맥길 대학교(McGill University)에서 박사 학위를 취득했으며, 이 과정에서 결합 자유 에너지를 예측하기 위한 구조 기반 방법론을 개발했습니다. 사테쉬는 다수의 특허와 논문을 공동 저술했으며, 현재도 전산 화학의 다양한 주제에 대해 지속적으로 연구 성과를 발표하고 있습니다.

제프 쾨스트 박사

2급 수석 연구원, Schrödinger

제프 쾨스트(Zef Könst)는 캘리포니아 바이오테크놀로지( Schrödinger )의 치료제 개발 그룹 소속 수석 연구원으로, 임상 개발 책임자( 의약 화학자)로서 신약 개발 프로젝트의 수행을 총괄하고 있습니다. 제프는 노바티스(Novartis)와 누릭스 테라퓨틱스(Nurix Therapeutics)에서 근무한 후 2020년에 캘리포니아 바이오테크놀로지( Schrödinger )에 합류했으며, 임상 개발 단계에 있는 4개의 화합물 개발에 기여했습니다. 그는 캘리포니아 대학교 어바인(University of California, Irvine)에서 밴더월(Vanderwal) 교수의 지도 아래 박사 학위를 취득했습니다.