MAY 29, 2024

가상 바이오테크 기업 – 의약화학 분야에서 ‘ Schrödinger ’Maestro 을 적용하여 강화된 학생 그룹 학습 프로젝트 코스

세인트루이스 대학교 화학학과는 매년 봄 학기에 3, 4학년 및 대학원생을 대상으로 의약화학 입문 과정( 코스 )을 개설합니다. 2019년에는 학기 중반( 코스 )에 걸쳐 ‘미충족 의료 수요( 액티브 러닝 )’ 그룹 프로젝트가 개발되었는데, 이때 ‘가상 생명공학’ 기업으로 구성된 학생 팀들이 가상 프로젝트를 통해 신약 개발 과정을 수행했습니다. 이는 2.5시간 동안 진행되는 야간 실험( 코스 )의 부담을 덜어주는 동시에, 학생들이 배운 내용을 제약 산업 현장에서 자연스럽게 발생하는 다양한 팀 협업 방식을 모방한 보다 ‘실제 현장’에 가까운 적용 사례에 활용할 수 있도록 돕기 위한 실험으로 도입되었습니다. 학생 그룹들은 미충족 의료 수요가 있는 질환을 파악하고, 표적 후보 프로필, 신약 개발을 위한 적합한 생물학적 표적, 구조 기반 표적 선정( hit identification) 과정을 수립하며, 최적화 전략을 제안하는 작업을 수행합니다. 이 그룹 프로젝트는 학생들의 피드백을 바탕으로 매년 지속적으로 발전하고 있습니다. 2022년에는 Schrödinger ,Maestro ,분자모델링 소프트웨어를 활용한 구조 기반 표적 선정( 약물 설계 )이 도입되었으며, 현재는 학생들이 수업에서 배운 내용을 프로젝트에 적용할 수 있도록 소프트웨어 사용법을 익히기 위한 주간 개별 과제와 그룹 프로젝트 전반에 걸쳐 통합되어 진행되고 있습니다. 프로젝트 팀은 상용 스크리닝 라이브러리를 사용하여 대상 물질에 대한 가상 스크리닝을 수행하고, 히트 물질을 평가한 뒤, Ligand Designer를 활용해 새로운 유사체를 제안합니다. 학기 말에는 프로젝트 팀들이 “가상 투자자”(동급생들)를 대상으로 10분간의 프로젝트 피치를 통해 자신의 연구 결과를 발표하고, “가상 투자”를 받을 프로젝트를 선정합니다.