전 세계 모든 Schrödinger 사무소는 휴식과 재충전을 위한 전사적 조치의 일환으로 8월 17일부터 21일까지 일주일간 휴무합니다. 이 기간 동안 문의에 대한 답변이 제한될 수 있으니 양해 부탁드립니다. 과학 및 기술 지원팀 직원들은 긴급 지원 문의에 한해 대응할 예정입니다.

QSite

고성능 QM/MM 프로그램

QSite

개요

QSite는 양자역학과 분자역학의 원리를 결합한 QM/MM 방법을 활용하는 다중 스케일 시뮬레이션 도구입니다. 이 도구는 원자에 대한 양자화학적 처리를 통해 반응성 계의 분자 구조, 에너지 상태 및 전자 구조를 정확하게 예측하도록 설계되어, 분자간 상호작용이 존재하는 상황에서 일어나는 화학적 변환을 이해하는 데 필수적인 반응 화학에 대한 중요한 통찰력을 제공합니다. 또한 QSite는 비반응성 화학 계를 설명하는 데에도 동일하게 적용될 수 있습니다.

주요 역량

고성능

오랫동안 QM 계산 분야의 업계 선두주자로 인정받아 온 ‘ Jaguar ’를 활용하기 때문에 다른 QM/MM 프로그램보다 뛰어난 성능을 발휘합니다.

첨단 기술

단백질 시스템과 양자역학(QM) 영역 및 분자역학(MM) 영역 간의 상호작용을 구체적으로 다루며, QM/MM 인터페이스에 대한 혁신적인 접근 방식을 제시합니다.

전이금속의 수렴 현상

Jaguar의 첨단 기능 덕분에 금속 단백질에 대해 높은 정확도를 달성하며, 전이 금속을 포함하는 계의 올바른 기저 상태로 안정적이고 효율적으로 수렴합니다.

파동함수의 선택

QM 영역을 평가하기 위해 하트리-포크(Hartree-Fock), 밀러-페르거( DFT), 국소 MP2 등 다양한 수준의 이론을 제공합니다. 이를 통해 사용자는 계산 비용과 정확도 사이에서 최적의 균형을 선택할 수 있습니다.

고급 계산 설정 및 분석

특정 인터페이스 매개변수를 자동으로 적용하여 계산을 간편하게 설정할 수 있습니다. 분자 궤도나 전자 밀도 등의 계산 결과는 ‘ Maestro ’ 내에서 시각화할 수 있습니다.

문서 및 튜토리얼

Schrödinger의 소프트웨어 사용과 관련된 자주 묻는 질문에 대한 답변을 확인하고, 모범 사례를 알아보세요.

생명과학 문서화

QSite

양자역학과 분자역학의 원리를 결합한 QM/MM 방법을 활용하는 다중 스케일 시뮬레이션 도구.

생명과학 튜토리얼

QSite에서 QM 및 MM 영역 정의하기

QSite 계산을 위해 QM 및 MM으로 처리할 영역을 정의합니다.

관련 상품

연구 프로젝트를 발전시키는 데 활용할 수 있는 관련 컴퓨팅 기술에 대해 자세히 알아보세요.

FEP+

신약 개발을 위한 고성능 자유 에너지 계산

Jaguar

분자 구조 및 성질을 신속하고 정확하게 예측하기 위한 양자역학적 해결책

Maestro

분자 연구에 필요한 완벽한 모델링 환경

MS 모빌리티

유기 반도체 고체 상태 박막의 전하 이동도에 대한 원자 수준 시뮬레이션 및 분석

간행물

관련 응용 분야에서 ‘ Schrödinger ’ 기술을 활용한 동료 심사를 거친 논문 목록을 살펴보세요.

재료과학 출판물

공학적으로 설계된 단백질 나노기공을 이용한 서브마이크로 및 나노 크기의 폴리에틸렌 테레프탈레이트 분해

생명과학 간행물

광합성 안테나 단백질에서 동등하게 기여하는 기전들에 의한 광수확

생명과학 간행물

d-아르기닌 탈수소효소의 티로신-페닐알라닌 환원 반반응 활성 부위 변이체에 대한 기전 및 전산 연구

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케토스테로이드 이소머라아제의 활성 부위에 있는 물

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메탄 및 톨루엔 모노옥시게나제 하이드록실라제의 서로 다른 이산소 활성화 경로에 대한 고찰

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일산화탄소 탈수소효소의 반응 기전: Ni-H 결합에 대한 비정상적인 CO₂ 삽입의 가능성이 높은 사례

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생명과학 간행물

Lead identification 아세틸콜린에스테라제 억제제-히스타민 H3 수용체 길항제 중 분자모델링

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구조 기반 사이클린 의존성 키나제 억제제 발굴

생명과학 간행물

메탄 모노옥시게나제에 의한 이산소 활성화의 중간체: QM/MM 연구

교육 및 자료

온라인 자격증 과정

실습 중심의 온라인 ‘ 분자모델링 ’ 과정을 통해 여러분의 역량을 한 단계 높여보세요. 이 자기 주도형 과정은 다양한 과학 주제를 다루며, ‘ Schrödinger ’ 소프트웨어 이용 권한과 지원 서비스가 포함되어 있습니다.

튜토리얼

프로젝트의 성공을 위해 ‘ Schrödinger ’ 소프트웨어의 기술과 모범 사례를 활용하는 방법을 알아보세요. 교육 자료, 튜토리얼, 빠른 시작 가이드, 동영상 등을 확인해 보세요.