APR 30, 2026

실습 워크숍: 리간드 기반 가상 스크리닝을 활용한 “화학적 핵심” 탐색 Phase

전통적인 의약화학 교육은 종종 2차원 루이스 구조와 분자 인식의 3차원적 현실 사이의 간극을 메우는 데 어려움을 겪습니다. 이 실습 워크숍은 교수진에게 ‘ Schrödinger’의 ‘ Phase ’ 패널을 소개하며, 이를 통해 학생들이 “분자 메시지”를 해독하도록 가르치는 교육적 가교 역할을 할 수 있도록 합니다. 참가자들은 학생들이 리간드를 3차원 약리활성기 가설로 추상화하고, 필수적인 수소 결합 공여체, 수용체 및 소수성 영역을 식별하여, 단백질이 화학명이 아닌 공간적 지도를 어떻게 “해독”하는지 시각화할 수 있도록 지도하는 방법을 배우게 됩니다.

이번 세션에서는 약물 내성과 특허 제한을 극복하기 위해 사용되는 핵심 산업 개념인 “스캐폴드 Hop”을 심도 있게 다룰 예정입니다. 참가자들은 학생들이 가상 스크리닝을 수행하여 동일한 생물학적 요건을 충족하는 구조적으로 다양한 분자인 ‘바이오이소스테르(bioisosteres)’를 식별하는 수업 과제를 설계하는 방법을 배우게 됩니다. 교수진은 ‘ Phase ’의 적합도 점수(Fitness Score)를 분석함으로써, 서로 다른 화학 골격이 정밀한 3D 정렬을 통해 어떻게 기능적 동등성을 달성할 수 있는지 학생들이 이해할 수 있도록 도울 것입니다.

마지막으로, 이번 워크숍은 모델 검증과 비판적 감사에 중점을 둡니다. 참가자들은 학생들이 알려진 활성 물질과 비활성 ‘미끼’ 물질이 모두 포함된 ‘블라인드’ 라이브러리를 선별하는 탐구 기반 실험을 진행하는 방법을 배우게 됩니다. 순위 지표를 활용하여 모델의 예측 능력을 평가함으로써, 학생들은 단순히 ‘버튼을 누르는’ 수준을 넘어, 컴퓨터 시뮬레이션 결과를 데이터에 기반해 엄격하게 평가하는 단계로 나아갈 수 있습니다. 참가자들은 현대적인 가상 스크리닝 워크플로우를 화학 및 생화학 교육 과정에 통합하기 위한 완벽한 프레임워크를 습득하고 돌아갈 것입니다.

학습 목표:

• “분자 메시지” 해독: 특징 식별과 추상화
• “스캐폴드 홉”의 정복: 화학적 다양성 탐구
• “인 실리코(In Silico)” 성공 평가: 검증 및 데이터 보강

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