2025년 4월 16일

단백질 분해 유도제(표적 단백질 분해 유도제)는 세포의 자연적인 분해 경로를 활용하여 단백질 기능을 조절하는 혁신적인 신약 개발 방식으로서 주목받고 있습니다. 그러나 이 분자의 이중 기능성 구조로 인해 여러 요소를 최적화해야 하므로 설계가 매우 복잡합니다.
Schrödinger는 기업 연구진과 협력하여, 두 개의 단백질과 이중 기능성 분자로 구성된 삼자 복합체의 구조를 정확하게 예측할 수 있는 계산 워크플로를 개발했습니다.

이번 웨비나에서는 단백질 간 도킹, 링커 샘플링, 메타다이나믹스, 자유 에너지 섭동 계산(FEP+)을 활용한 툴킷을 소개하고, 복합체 구조 예측부터 활성 최적화에 이르기까지 단백질 분해효소 설계를 가속화하는 방법을 설명합니다. 또한, LiveDesign 플랫폼을 통한 실시간 공동 연구의 가능성에 대해서도 소개합니다.

웨비나 하이라이트

• 단백질 분해효소 모델링의 최신 동향 및 과제 개요
• 슈뢰딩거의 계산 솔루션 소개: 출구 벡터 샘플링, HDX-MS 등의 실험 데이터를 활용한 삼자 복합체의 앙상블 예측 및 필터링, 복합체 스코어링, FEP+를 이용한 링커 최적화
• LiveDesign을 활용한 단백질 분해효소 설계 프로세스 효율화 워크플로우 시연
• 단백질 분해효소 모델링을 위한 Maestro의 새로운 패널을 가장 먼저 소개합니다