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고품질 리간드 라이브러리 설계


화학 공간 탐색, 리간드 라이브러리의 프로파일링 및 맞춤화, 도킹 모델 검증, 그리고 히트 발굴을 위한 열거 방법

상세 정보
지원 언어
중국어, 영어, 일본어, 한국어
기간
5주 / 주당 최대 20시간
레벨
중급
비용
비학생 이용자의 경우 715달러
학생 및 박사후 연구원 270달러
과정 기간
5주 동안 자기 주도형으로 진행됩니다. 수강 신청 시 시작일과 종료일을 선택하게 됩니다. 해당 기간 동안 수강생은 자신의 일정에 맞춰 언제든지 학습 자료와 가상 워크스테이션에 비동기식으로 접속하여 과정을 진행할 수 있습니다.

가상 및 물리적 리간드 라이브러리가 대폭 확대됨에 따라, 고처리량 가상 스크리닝과 같은 히트 발굴 워크플로우에 활용하기 전에 이러한 라이브러리를 표적 및 프로젝트별로 선별하고 프로파일링하는 데 대한 관심이 높아지고 있다.

슈뢰딩거의 온라인 강좌인 ‘고품질 리간드 라이브러리 설계’에서는 라이브러리 설계의 모범 사례는 물론, 모델 검증을 위한 리간드의 준비 및 활용 방법을 다룹니다. 

이 과정은 자격증과 배지를 취득하여 전문성을 키우고 이력서를 더욱 알차게 만들고자 하는 분들에게 이상적입니다.

  • 업계 최고의 슈뢰딩거(Schrödinger)의 ‘마에스트로(Maestro)’ 및 명령줄 인터페이스를 직접 사용해 보세요
  • 진행 중인 프로젝트에 바로 적용할 수 있는 방법을 익혀 연구 프로그램을 빠르게 시작하세요
  • 반응 기반 열거부터 라이브러리 프로파일링에 이르기까지 다양한 주제를 배워보세요
  • 수업 내용을 숙지했음을 입증하기 위해 독자적으로 사례 연구를 수행한다
  • 강좌 과제 및 강좌 관련 문의 사항에 대해 슈뢰딩거 교육팀 전문가들의 검토와 피드백을 받아보세요
  • 강좌 기간 중 본인의 일정에 맞춰 편한 시간에 학습 자료를 학습하십시오.

 

이 과정에는 과정 수강에 필요한 라이선스와 컴퓨팅 리소스가 포함된 웹 기반 슈뢰딩거(Schrödinger) 소프트웨어 이용 권한이 제공됩니다:

요구 사항
  • 안정적인 고속 인터넷 접속(8 Mbps 이상)이 가능한 컴퓨터
  • 마우스 및/또는 외장 모니터 (권장되나 필수는 아님)
  • 일반 화학에 대한 실무 지식
  • Maestro에 대한 실무 지식. 이 과정에서는 슈뢰딩거의 그래픽 사용자 인터페이스인 Maestro의 사용법을 다루지 않습니다. Maestro 사용법에 익숙해지려면 ‘Maestro 시작하기’ 자료를 참고하여 학습해 주시기 바랍니다.
인증
  • 슈뢰딩거 과정 책임자가 서명한 수료증
  • LinkedIn과 같은 소셜 미디어에 게시할 수 있는 배지
배경 무늬

배울 내용

실제 및 이론적 화학 공간의 기본 개념

벤더 라이브러리를 프로파일링하여 그 구성을 평가하고, 다양한 열거 작업을 수행하여 인실리코 열거 라이브러리를 생성한다

도서관 설계 과정

다양성을 유지하면서 명백한 결함을 제거하기 위해 리간드 라이브러리를 선별하는 전략과 고려 사항을 알아보세요

모델 검증을 위한 보정 계산

연구 프로젝트에 적합한 미끼/미지 리간드를 구축하기 위한 널리 사용되는 미끼 생성 도구와 다양한 대체 접근법을 배워보세요.

HTVS를 위한 도서관 설계의 향후 적용 분야

목표 및 프로젝트별 요구 사항을 충족하기 위해 리간드 라이브러리를 독자적으로 구축함으로써 자신의 역량을 발휘하십시오.

모듈

모듈 1
2시간

고속 가상 스크리닝을 위한 고품질 리간드 라이브러리의 가치

체크포인트
강의 계획서 및 명예 규약

학문적 정직성에 대한 기대

동영상
동영상
  • 과정 개요
  • 가상 스크리닝 개요 동영상 및 가상 스크리닝 워크플로우에서 고품질 리간드 라이브러리의 중요성
체크포인트 종료
모듈 종료 점검점
모듈 2
6시간

화학 공간 생성 및 상용 리간드 라이브러리 활용

동영상
동영상
  • 화학 공간 생성 방법
  • 상업용 도서관과 도서관 설계 과정 이해하기
튜토리얼
튜토리얼
  • R-그룹 및 반응 기반 열거법
  • 도서관 프로파일링
체크포인트 종료
모듈 종료 점검점
모듈 3
4시간

리간드 라이브러리의 선별 및 전처리

동영상
동영상
  • 리간드 라이브러리 선별 전략
  • 가상 스크리닝을 위한 리간드 합성 및 HTVS의 향후 계획
튜토리얼
튜토리얼
  • 하위 구조 및 책임 필터링 수행
  • LigPrep을 수행하고 형태 선별을 준비한다
체크포인트 종료
모듈 종료 점검점
모듈 4
4시간

모델 검증을 위한 리간드 라이브러리 구축

동영상
동영상
  • 모델 검증을 위한 리간드 라이브러리의 목적
  • 미끼 리간드 집합을 생성하는 다른 방법들
튜토리얼
튜토리얼

농축 분석을 위한 미끼 리간드 세트를 생성, 필터링, 전처리 및 적용

체크포인트 종료
모듈 종료 점검점
모듈 5
6시간

최종 사례 연구: 리간드 라이브러리를 독자적으로 설계하기

동영상
동영상
  • 사례 연구 개요
  • 사례 연구 결과 및 과정 마무리
튜토리얼
튜토리얼

새로운 프로젝트를 위한 리간드 라이브러리를 생성, 선별, 준비 및 평가한다

과제
과제

사례 연구 결과를 검토하고 논의한다

수강 완료
과정 수료 및 수료증 발급

슈뢰딩거 온라인 강좌 자금 조달에 도움이 필요하신가요?

저희는 차세대 과학자들을 자랑스럽게 지원하며, 경제적 여건이 어려운 분들에게 기회를 제공하기 위해 최선을 다하고 있습니다. 학생, 박사후 연구원 또는 산업계 과학자로서 온라인 인증 과정에 대한 다양한 지원 옵션을 확인하고, 지금 바로 등록하세요!

졸업생들의 소감

“이 과정은 프로파일링이나 리간드 필터링과 같이 입문 과정에서는 다루지 않았던 추가적인 개념들을 배울 수 있었을 뿐만 아니라…, 대규모 라이브러리에서 히트 물질을 선별하는 기준도 배울 수 있어서 유익했습니다.”
프리바운 르웨, 스탠퍼드 대학교 의과대학 강사
“이 과정은 HTVS를 실행하기 전에 가상 라이브러리를 준비하고 사전 선별하는 것이 왜 중요한지에 대한 훌륭한 입문 과정이었습니다. 이를 통해 우리 팀은 고객과 협업할 때 현장에서 어떤 일이 일어나고 있는지 이해하게 되었으며, 이는 더 나은 지원을 제공하는 데 도움이 될 것입니다. 또한, 우리만의 가상 라이브러리를 개발할 때 어떤 화합물을 포함해야 할지 고민하는 데에도 이 과정이 큰 도움이 됩니다.”
Deren_Koseoglu의 얼굴 사진
데렌 코세오글루, eMolecules 영업 부사장
“이 과정은 방대한 라이브러리에서 약물 유사 특성을 지닌 후보 물질을 선별하는 방법을 배우기에 아주 훌륭한 과정이었습니다. 사례 연구에서 배운 지식을 적용해 보는 과정이 즐거웠으며, 앞으로 제 연구에서도 이 지식을 활용할 수 있기를 기대합니다.”
케이트 코스텐코바, 미네소타 대학교 재학생
“우수한 교수진께서 계산 화학을 가르쳐 주시는 것은 정말 멋진 일입니다. 컴퓨터 시뮬레이션을 통해 리간드 라이브러리를 구축하는 능력은 다양한 상황에서 매우 유용한 기술이라고 생각합니다. 계산 생물학자로서 교육 과정에 이러한 기술을 배울 수 있어 큰 보람을 느낍니다. 전체 과정에 대해 깊이 감사드리며, 언제나 그렇듯 슈뢰딩거는 최고입니다.”
안드레스 R. Ch. 프라다, 생물학자. 생물통계학 석사. 전산생물학 석사. 안데스 대학교 분자생물학 석사
“솔직히 이 강좌가 정말 즐거웠고 많은 것을 배웠습니다. 다른 계산화학자들에게도 이 강좌를 꼭 추천하고 싶습니다.”
사라 베르호프, 에모리 대학교 박사 과정생
“소프트웨어 공학에 대한 전반적인 지식을 갖춘 데이터 엔지니어로서, 이 과정은 제가 계산 화학자들과 협업하는 능력에 지대한 긍정적 영향을 미쳤습니다. 이 과정은 이론과 실습의 균형을 훌륭하게 조화시켜, 동료들을 위해 파이프라인을 설계할 때 기술적 결정을 내리는 데 필요한 과학적 배경 지식을 제공해 주었습니다.”
릴리언 캠벨
릴리안 캠벨, 오디티 랩스 데이터 엔지니어
“이 과정은 리간드 라이브러리 설계에 대한 실용적이고 실습 중심의 교육을 제공하여, 가상 스크리닝을 위한 화합물 선별을 최적화하는 기술을 습득할 수 있게 해주었습니다. 사례 연구와 도구들은 제가 진행 중인 신약 개발 업무에 바로 적용할 수 있으며, 이제 화합물의 특성, 다양성, 표적 관련성을 기준으로 라이브러리를 선별하는 데 자신감을 갖게 되었습니다. 이 지식은 구조 기반 프로젝트에서 제 연구 효율성과 의사결정 능력을 높여줄 것입니다.”
류웨이량, 제남대학교 재학생
“물리화학적 특성, 구조적 다양성, 형태 기반 필터링에 대한 심도 있는 논의를 통해, 불필요한 복잡성을 최소화하면서 히트율을 극대화하는 화합물 라이브러리를 설계하는 방법에 대한 이해가 깊어졌습니다. 특히 이론적 개념을 실제 상황에 적용하는 데 중점을 둔 점이 매우 유익했습니다. 전반적으로 이 과정을 통해 초기 신약 개발 단계에 기여할 수 있는 제 역량이 크게 강화되었습니다.”
링키 싱, 퍼듀 대학교 박사후연구원
“이 과정을 통해 원시 리간드 라이브러리를 가상 스크리닝에 바로 활용할 수 있는 정제된, 약물 후보와 유사한 데이터셋으로 변환하는 방법을 이해할 수 있었습니다. 실습 위주의 강의 덕분에 이제 제 연구에서 LigPrep이나 canvasSearch 같은 도구를 더 자신 있게 사용할 수 있게 되었습니다. 전산 신약 개발 분야에 종사하는 모든 분께 이 과정을 적극 추천합니다.”
다니아 바와지르, 킹 압둘아지즈 대학교 유전학 석사 과정 학생

코스 배지와 수료증을 통해 새로 습득한 기술을 뽐내 보세요

저희 기관에서 분자 모델링 과정을 수료하고, 배운 내용을 동료나 고용주와 공유할 준비가 되셨다면, LinkedIn 프로필에 수료증과 배지를 게시하실 수 있습니다.

자주 묻는 질문

‘도서관 디자인’ 온라인 강좌 수강료는 얼마인가요?

수강료는 각 과정 및 수강생 유형에 따라 다릅니다. 이 과정을 수강하고자 하는 학생에게는 255달러의 학생 할인 요금을, 비학생에게는 680달러의 수강료를 적용합니다.

강의는 몇 시에 시작하나요?

강좌가 시작되면 모든 강의는 비동기식으로 진행되며, 수강생은 본인의 일정에 맞춰 동영상, 튜토리얼 및 과제를 자유롭게 시청할 수 있습니다.

이 수강료는 어떻게 내야 하나요?

관심 있는 참가자분들은 등록 절차를 완료하고 신용카드 결제 포털을 통해 즉시 수강 신청을 하시면 수강료를 결제하실 수 있습니다. 당사는 직불카드를 받지 않으므로 신용카드가 반드시 필요하다는 점을 유의해 주시기 바랍니다. 또한, 요청 시 구매 주문서를 발급해 드릴 수 있으니, 이 옵션에 관심이 있으신 분은 online-learning@schrodinger.com으로 이메일을 보내 주시기 바랍니다. 수강료 결제 방법에 대해 궁금한 점이 있으시면, 당사의 결제 옵션 페이지를 방문해 주시기 바랍니다.

등록하기 전에 강좌를 미리 살펴볼 수 있나요?
학생들을 위한 장학금 기회가 있나요?

슈뢰딩거는 경제적 여건이 어려운 학생들을 지원하기 위해 최선을 다하고 있습니다. 슈뢰딩거의 사명은 치료제 및 신소재 발굴 방식을 혁신함으로써 인류의 건강과 삶의 질을 향상시키는 것입니다. 슈뢰딩거는 차세대 과학자들을 자랑스럽게 후원합니다. 당사는 재정적 지원이 필요함을 입증하고 지도교수로부터 추천서를 받은 정규 재학생 또는 박사후 연구원을 대상으로 하는 장학금 프로그램을 마련했습니다. 저희 장학금 프로그램 지원 자격이 되신다면, 신청서를 작성해 주시기 바랍니다!

강좌가 끝난 후에도 학습 자료는 계속 이용할 수 있나요?

강좌가 종료되면 소프트웨어 이용 권한은 종료되지만, 강좌 내 일부 자료(슬라이드, 논문, 튜토리얼)는 다운로드할 수 있으므로 강좌가 끝난 후에도 다시 참고할 수 있습니다. 동영상, 퀴즈, 소프트웨어 이용 권한과 같은 다른 자료들은 강좌 기간 동안에만 이용할 수 있습니다.

이 강좌를 수강하려면 해당 소프트웨어에 접속할 수 있어야 하나요? 소프트웨어를 별도로 구매해야 하나요?

과정 기간 동안, 수강생 여러분은 (과정에 따라) Maestro, Bioluminate, Materials Science Maestro 및/또는 LiveDesign의 웹 기반 버전을 이용할 수 있습니다. 별도의 소프트웨어 이용권을 구매하실 필요는 없습니다. 과정 종료 시 소프트웨어 이용 권한은 종료되지만, 과정 내 일부 자료(슬라이드, 논문, 튜토리얼)는 다운로드가 가능하므로 과정 종료 후에도 다시 참고하실 수 있습니다. 동영상, 퀴즈, 소프트웨어 이용 권한과 같은 기타 자료는 과정 진행 기간 동안에만 이용 가능합니다. 슈뢰딩거(Schrödinger) 소프트웨어는 과정과 관련된 목적으로만 사용해야 함을 유의해 주시기 바랍니다.

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