단백질 분해제는 세포의 자연적인 분해 경로를 활용하여 단백질 기능을 조절하는 새로운 기전을 제공함으로써, 신약 개발 분야에서 유망한 치료 기법으로 부상하고 있습니다. 그러나 단백질 분해제는 이중 기능적 특성을 지니고 있어 여러 매개변수에 걸친 복잡한 최적화가 필요하기 때문에, 이를 설계하는 데에는 독특한 어려움이 따릅니다.

Schrödinger 는 산업계 과학자들과 공동 연구 프로젝트를 진행하여, 두 단백질 파트너와 이중 기능성 분자 간의 삼원 복합체 구조를 정확하게 예측할 수 있는 계산 워크플로우를 개발해 왔습니다. 이번 웨비나에서는 단백질-단백질 도킹 및 링커 샘플링을 통합하여 가능한 복합체 앙상블을 생성하고, 메타다이나믹스를 통해 이러한 복합체에 정확한 점수를 부여하며, 자유 에너지 섭동(FEP+) 계산을 통해 분해제의 효능을 최적화하는 ‘ Schrödinger’의 첨단 계산 툴킷을 소개할 예정입니다.

저희와 함께 이러한 워크플로가 삼원 복합체 예측부터 링커 특성 최적화에 이르기까지 단백질 분해제 설계 과정을 어떻게 가속화할 수 있는지, 그리고 ‘ Schrödinger’의 ‘ LiveDesign ’ 플랫폼을 통해 실시간 협업을 어떻게 강화할 수 있는지 알아보시기 바랍니다.

웨비나 주요 내용:

• 단백질 분해 효소 모델링 분야의 최신 동향 및 과제 요약
• Schrödinger 의 계산 기반 솔루션 개요. 여기에는 출구 벡터 샘플링, 3원 복합체 앙상블 예측, HDX-MS와 같은 실험 정보를 활용한 필터링, 3원 복합체 스코어링, 그리고 다음을 활용한 링커 최적화가 포함됩니다. FEP+
• LiveDesign 의 워크플로우 데모를 통해 디그레이더 설계 과정을 간소화하는 방법
• 단백질 분해효소 모델링을 주제로 한 다가오는 ‘ Maestro ’ 패널 세션 미리 보기