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MAR 26, 2025

加速蛋白质降解剂 的发现:降解剂 设计的计算策略以及优化

蛋白质降解剂已成为药物研发中一种极具前景的治疗手段,它利用细胞的天然降解途径,为调节蛋白质功能提供了新的机制。然而,由于蛋白质降解剂具有双功能特性,其设计面临着独特的挑战,需要对多个参数进行复杂的优化 。

Schrödinger 已与业界科学家开展合作研究项目,致力于开发能够准确预测两个蛋白质配体与一个双功能分子之间三元复合物结构的计算工作流。在本期网络研讨会中,我们将展示Schrödinger的先进计算工具包,该工具包整合了蛋白质-蛋白质分子对接 和连接子采样技术以生成一组可能的复合物,利用元动力学对这些复合物进行准确评分,并采用自由能微扰 (FEP+ )计算来优化降解剂 的活性。

欢迎加入我们,共同探索这些工作流程如何加速蛋白质降解剂的设计——从预测三元复合物到优化连接子特性——并如何通过Schrödinger的LiveDesign 平台实现实时协作。

网络研讨会亮点:

  • 蛋白质降解酶建模领域当前趋势与挑战综述
  • Schrödinger 计算解决方案概述,包括出口向量采样、三元复合体集合预测,以及利用HDX-MS等实验数据进行过滤、三元复合体评分,以及基于优化 的连接肽分析FEP+
  • LiveDesign 中用于简化降解剂 设计流程的工作流演示
  • 即将举行的Maestro 会议中关于蛋白质降解剂 建模的专题讨论会预览

我们的演讲嘉宾

阿古斯·罗德里格斯-格拉尼略

应用科学总监,Schrödinger

阿古斯领导位于马萨诸塞州剑桥市的应用科学团队,负责为美国东北地区的客户提供支持。除了客户支持工作外,阿古斯对作为新型治疗手段的双功能降解剂抱有浓厚兴趣,并一直积极致力于该领域的研究。阿古斯来自阿根廷,在德克萨斯州休斯顿的莱斯大学获得了生物化学博士学位。

索尼娅·尼古拉乌

应用科学部二级高级科学家,Schrödinger

索尼娅·尼古拉乌(Sonia Nicolaou)是Schrödinger 公司的一名全权应用科学家,常驻马萨诸塞州剑桥市。她拥有英国曼彻斯特大学化学博士学位。自加入Schrödinger 以来,她一直为客户提供科学支持 服务,并参与了LiveDesign 中新型模型的开发。她最近的工作重点是LiveDesign 中PROTAC工作流的实现。