
MAR 26, 2025
タンパク質分解剤の発見を加速する:分解剤の設計と最適化に向けた計算機科学的アプローチ
タンパク質分解剤は、細胞の自然な分解経路を活用してタンパク質の機能を調節する新たなメカニズムを提供する、創薬分野における有望な治療法として注目されています。しかし、タンパク質分解剤は二機能性を持つため、その設計には特有の課題があり、複数のパラメータにわたる複雑な最適化が必要となります。
Schrödinger 産業界の科学者らと共同研究を行い、2つのタンパク質パートナーと1つの二機能性分子からなる三元複合体の構造 を正確に予測できる計算ワークフローを開発してきました。本ウェビナーでは、Schrödingerの先進的な計算ツールキットをご紹介します。このツールキットは、タンパク質間ドッキングとリンカーサンプリングを統合して可能な複合体のアンサンブルを生成し、メタダイナミクスを用いてこれらの複合体を正確に評価し、自由エネルギー摂動(FEP+ )計算によってデグラダー活性 を最適化するものです。
ぜひご参加いただき、これらのワークフローが、三元複合体の予測からリンカー特性の最適化に至るまで、タンパク質分解酵素の設計をいかに加速させ、SchrödingerのLiveDesign プラットフォームを通じてリアルタイムのコラボレーションをいかに促進するかについて、一緒に探求しましょう。
ウェビナーの見どころ:
- タンパク質分解酵素のモデリングにおける現在の動向と課題の概要
- Schrödinger の計算ソリューションの概要。これには、出口ベクトルサンプリング、三元複合体アンサンブル予測、HDX-MSなどの実験情報を用いたフィルタリング、三元複合体スコアリング、および以下の手法を用いたリンカー最適化が含まれます。FEP+
- LiveDesign におけるワークフローのデモ:デグレーダーの設計プロセスを効率化
- タンパク質分解酵素のモデリングに関する、近日開催予定のMaestro パネルディスカッションの先行情報
登壇者

アグス・ロドリゲス=グラニージョ
アプリケーションサイエンス部門 ディレクター、Schrödinger
アグスは、マサチューセッツ州ケンブリッジにあるアプリケーションサイエンスチームを率い、米国北東部地域の顧客をサポートしています。顧客サポートに加え、アグスは新たな治療法として二機能性分解剤に強い関心を持ち、この分野で積極的に研究に取り組んでいます。アグスはアルゼンチン出身で、テキサス州ヒューストンのライス大学で生化学の博士号を取得しました。

ソニア・ニコラウ
アプリケーションサイエンス部門 上級研究員 II、Schrödinger
ソニア・ニコラウ氏は、マサチューセッツ州ケンブリッジに拠点を置くSchrödinger のオールアクセス・アプリケーション・サイエンティストです。英国マンチェスター大学で化学の博士号を取得しました。Schrödinger に入社して以来、顧客への科学的サポートを提供するとともに、LiveDesign における新モデルの開発に携わってきました。最近では、LiveDesign におけるPROTACsワークフローの実装に注力しています。