創薬における分子モデリング入門

創薬における分子モデリング入門


MaestroおよびLiveDesignを用いたタンパク質調製、リガンドドッキング、共同設計、および低分子創薬のその他の基礎

詳細
利用可能な言語
中国語、英語、日本語、韓国語
所要時間
所要時間:5週間/約20時間
レベル
はじめに
費用
学生以外のユーザーは600ドル
学生・ポスドク:160ドル
コースの期間
コースに登録する際、ご希望の開始日と終了日を選択することができます。その期間中は、ご自身の都合に合わせて、非同期形式でコースにアクセスし、学習を進めることができます。

概要

計算分子モデリングツールは、創薬においてその有効性が実証されており、製薬業界全体でその利用が拡大しています。現代の創薬研究者は、キャリアを通じて分子モデリングに継続的に関わるため、関連するツールや手法について基礎的な理解を持つことが極めて重要です。

このコースは、資格やバッジを取得することで、キャリアアップを図り、履歴書を充実させたい方に最適です。

  • コース期間中は、ご自身の都合に合わせて、いつでも自由にシュレーディンガーの「Maestro」と「LiveDesign」を実際に操作して学習することができます。
  • 進行中のプロジェクトに直接応用できる手法を学ぶことで、研究プログラムをスムーズにスタートさせましょう
  • タンパク質の構造決定からリガンドのドッキングに至るまで、幅広いトピックを学びます
  • コースの内容を完全に習得していることを示すため、完全に独立したケーススタディを実施する
  • コースの課題や質問について、シュレーディンガーの専門家によるレビューやフィードバックを活用しましょう

 

本コースでは、コース受講に必要なライセンスおよび計算リソースが備わった、Web版シュレーディンガー・ソフトウェアへのアクセス権が付与されます:

要件
  • 安定した高速インターネット接続(8 Mbps以上)が利用できるコンピュータ
  • マウスおよび/または外部モニター(推奨されますが、必須ではありません)
  • タンパク質の構造、化合物の効力、分子量、pKaといった概念について理解しておくこと
認証
  • シュレーディンガー講座の責任者が署名した証明書
  • LinkedInなどのソーシャルメディアに投稿できるバッジ
背景柄

学習内容

Maestroインターフェース

低分子モデリングには、業界をリードするグラフィカルユーザーインターフェースをご利用ください。なお、本コースではモデリングワークフローを実行するために、コーディングやスクリプトの作成は一切必要ありませんのでご注意ください。

計算機支援創薬の基礎

創薬プロジェクトにおいて、すでに計算ツールがどのように活用されているか、また、最も一般的なワークフローのいくつかにある基礎理論について学びましょう

構造およびリガンドに基づくモデリングワークフロー

タンパク質およびリガンドの調製、構造解析、リガンドベースのバーチャルスクリーニング、ならびに多パラメータによるリガンド最適化に関するベストプラクティス

プロジェクトへのワークフローの適用

共同企業向けインフォマティクス・プラットフォームを活用し、新規VEGR2阻害剤を設計する自由度の高いケーススタディにおいて、ご自身のスキルを活かしてください

モジュール

モジュール1
2時間

モデリングとシーン設定の基礎

チェックポイント
シラバスと学生行動規範

学術的誠実性に対する期待

動画
動画

分子モデリングの価値と事例紹介

チェックポイント終了
モジュール終了時のチェックポイント
モジュール2
3時間

Maestroユーザーインターフェースにおける基本的な操作

動画チュートリアル
動画チュートリアル

はじめに:低分子化合物の合成と修飾

チェックポイント終了
モジュール終了時のチェックポイント
モジュール3
4時間

タンパク質とリガンドの相互作用の観察

動画チュートリアル
動画チュートリアル
  • 構造階層の移動とサーフェスの追加
  • リガンド相互作用図と生成された画像の共有
  • LigPrep を用いたリガンドの調製、およびリガンドのアラインメント
チェックポイント終了
モジュール終了時のチェックポイント
モジュール4
4時間

構造に基づく仮想スクリーニング手法

動画チュートリアル
動画チュートリアル
  • 仮想スクリーニング手法の選定およびリガンドドッキングを用いた構造ベースの仮想スクリーニング
  • タンパク質構造の確認と準備、ドッキンググリッドの生成、およびドッキング解析
  • Ligand Designer を用いた列挙と解析
チェックポイント終了
モジュール終了時のチェックポイント
モジュール5
2時間

リガンドを用いたバーチャルスクリーニング手法

動画チュートリアル
動画チュートリアル

リガンドを用いたバーチャルスクリーニング法

チュートリアル
チュートリアル

リガンドデータベースの形状に基づくスクリーニング

チェックポイント終了
モジュール終了時のチェックポイント
モジュール6
4時間

LiveDesign のワークフローと演習

動画チュートリアル
動画チュートリアル
  • 創薬においてデータを整理し、効果的に連携する
  • 共同創薬のためのワークフロー
チュートリアル
チュートリアル

LiveDesign でのデータ構築および分析を含む、創薬プロジェクトのアイデア創出

チェックポイント終了
モジュール終了時のチェックポイント
モジュール7
6時間

VEGFR2に関する事例研究

動画
動画

キナーゼの構造と活性に関する背景

チュートリアル
チュートリアル
  • ドッキングを実行する
  • エンリッチメントを計算する
  • ヒットシリーズを分析する
  • アナログによるアイデア創出
課題
課題
  • エンリッチメントの提出
  • 最終的な化合物の提出
コース修了
コースの修了と認定

シュレーディンガー・オンライン講座の資金調達についてサポートが必要ですか?

私たちは次世代の科学者を誇りを持って支援しており、経済的な余裕のない方々にも機会を提供することに尽力しています。学生、ポスドク、あるいは産業界の科学者として、当社のオンライン認定コースを受講するための資金援助制度についてご確認の上、今すぐお申し込みください!

卒業生の声

「この分野に30年近く携わっていますが、新しい概念を学ぶことができました。特に、最後のLiveDesign演習は楽しく、目から鱗が落ちるような体験でした。このコースは、初心者から経験豊富な医薬品化学者まで、どなたにもお勧めします。」
マイケル・ウォルターズ ミネソタ大学 研究准教授
「親切な講師のおかげで、最も難しい概念でさえもわかりやすく感じられました。実例を交えた魅力的な説明に、私はすっかり引き込まれました。しかし、何と言っても最高だったのは、Maestroを使った実践的な演習でした。」
オルワセウン・アジャイ ジョージア大学大学院生
「コースの内容は綿密に構成されており、分子モデリングの手法とその応用について包括的な概要を提供していました。講師陣は複雑な概念を分かりやすいモジュールに整理し、専門知識のレベルが異なる参加者でも理解しやすいようにしていました。」
ムルサル・モハド インテグラル大学在籍の学生
「このコースは、構成がしっかりしており、簡潔で、情報量が豊富です。最終プロジェクトでは、ドッキングの知識を活用してリガンドのヒットシリーズを分析し、LiveDesignプラットフォームを用いてリガンドアナログのアイデア創出を行います。このように理解しやすく、包括的な入門コースを作成してくださったシュレーディンガー社に、心から感謝しています。」
スティタディ・マイティ アリゾナ州立大学博士課程学生
「医薬品化学者として、構造に基づく創薬設計の威力はよく理解していますが、これまでの職務では自分のワークフローに取り入れたことはありませんでした。このコースは、こうしたツールを自分のツールキットに加え始める上で、私にとって素晴らしい第一歩となりました。MaestroやLiveDesignをすぐに使い始められるのが、これほど簡単だとは思いもよらず、嬉しく思いました。」
ブルース・メランコン シニア・プリンシパル・サイエンティスト
「ここで得た知識は、間違いなく製薬業界における私のキャリアの展望を広げ、革新的な創薬に向けた新たな道を開いてくれるでしょう。」
メン・ワン ダナ・ファーバーがん研究所博士研究員
「医薬化学の分野で研究を行っている方、あるいはインシリコによる創薬モデリングについての理解を深めたい方には、このコースを強くお勧めします。」
ヴァシリ・クトゥラツァス セント・ジョンズ大学 研究助手(薬学博士課程在籍中)
「創薬における分子モデリングの学習を始めるのに最適なコースです。MaestroとLive Designは、ドッキングや、モデリング結果とADME特性との相関分析を行う上で、非常に優れており、強力なプラットフォームです。」
パオロ・リッチ Domainex主任研究員
「シュレーディンガーのオンラインコースは構成がしっかりしており、インタラクティブで段階的な解説を通じて、同社のCADDツールボックスを活用するための充実した学習体験を提供してくれます。このコースを強くお勧めします。」
Zhiwei Zhang グランド・ファーマ 革新医療研究所 医薬品化学部門長
「創薬における分子モデリング入門は、創薬における化合物スクリーニングのモデリング手法を探求する旅のようなものでした。これは、医薬化学者としての私のキャリア形成にとって、かけがえのない支えとなるでしょう。」
マリアンナ・ジラルディ(Ryvu TherapeuticsサイエンティストII)

コースのバッジと修了証で、新たに身につけたスキルをアピールしましょう

当社の分子モデリングコースを修了し、学んだことを同僚や雇用主に共有する準備が整ったら、LinkedInのプロフィールに修了証やバッジを掲載することができます。

よくある質問

オンライン講座の受講料はいくらですか?

受講料はコースごと、および受講者の種類によって異なります。これらのコースを受講希望の学生の方には、入門コースが150ドル、材料科学のセットコースが305ドル、上級コースが870ドルの学生割引価格をご用意しています。一般の受講者の場合、入門コースは575ドル、上級コースおよびセットコースは1435ドルとなります。

コースはいつから始まりますか?

コースはセッション制で運営されており、各セッションは3~6週間の期間で、その間、受講生はコースの受講やソフトウェアの利用が可能です。各コースのページで、セッション日程や開始日をご確認いただけます。

講義は何時からですか?

コースのセッションが始まると、すべての講義は非同期形式となり、自分のペースで視聴できる動画やチュートリアル、課題などを都合の良い時に利用することができます。

このコースの受講料はどうやって支払えばいいですか?

受講をご希望の方は、登録手続きを完了し、クレジットカード決済ポータルをご利用いただくことで、即座にコースのお支払いが可能です。デビットカードはご利用いただけませんので、クレジットカードが必要となります。なお、ご要望に応じて発注書を発行することも可能です。このオプションをご希望の場合は、online-learning@schrodinger.com までメールにてご連絡ください。コースのお支払い方法についてご質問がある場合は、当サイトの「支払い方法」ページをご覧ください。

登録する前に、コースの内容をどのように確認できますか?
学生向けの奨学金の制度はありますか?

シュレーディンガーは、経済的に恵まれない学生を支援することに尽力しています。シュレーディンガーの使命は、治療薬や材料の発見方法に変革をもたらすことで、人々の健康と生活の質を向上させることです。シュレーディンガーは、次世代の科学者を支援できることを誇りに思っています。当社は、経済的支援を必要としていることが証明でき、かつ指導教員からの推薦状を提出できる、フルタイムの学生またはポスドクを対象とした奨学金プログラムを設立しました。 当奨学金プログラムの応募資格を満たす方は、ぜひ申請フォームにご記入ください!

コース終了後も教材は引き続き利用できますか?

コースが終了するとソフトウェアへのアクセスは終了しますが、コース内の教材の一部(スライド、論文、チュートリアルなど)はダウンロード可能となっており、コース終了後も参照することができます。一方、動画、クイズ、ソフトウェアへのアクセス権などのその他の教材は、コース期間中のみ利用可能です。

このコースを受講するには、そのソフトウェアへのアクセス権が必要ですか? ソフトウェアは別途購入する必要がありますか?

コース期間中は、Maestro、Bioluminate、Materials Science Maestro、および/またはLiveDesign(コースによって異なります)のウェブ版をご利用いただけます。ソフトウェアの利用権を別途購入する必要はありません。コース終了とともにソフトウェアへのアクセスは終了しますが、コース内の資料の一部(スライド、論文、チュートリアルなど)はダウンロード可能となっており、コース終了後も参照することができます。 動画、クイズ、ソフトウェアへのアクセス権などのその他の教材は、コース期間中のみご利用いただけます。シュレーディンガー社のソフトウェアは、コースに関連する目的でのみご利用いただくようお願いいたします。

関連コース

「計算機を用いた抗体工学」入門講座 ライフサイエンス ライフサイエンス
計算機を用いた抗体工学入門

BioLuminateを用いた、抗体治療薬の開発性、安定性、親和性、および「ヒト由来性」を評価・改善するための構造ベースのワークフロー

材料科学のための分子モデリング:医薬品製剤 ライフサイエンス ライフサイエンス
医薬品の製剤

有効成分およびその製剤の研究に向けた、分子量子力学・周期量子力学、全原子分子動力学、および粗視化 アプローチ