「計算機を用いた抗体工学」入門講座

計算機を用いた抗体工学入門


BioLuminateを用いた抗体治療薬の安定性、親和性、および「ヒト由来性」の評価・改善に向けた構造ベースのワークフロー

詳細
利用可能な言語
中国語、英語、日本語、韓国語
所要時間
所要時間:5週間/約20時間
レベル
はじめに
費用
学生以外のユーザーは600ドル
学生・ポスドク:160ドル
コースの期間
コースに登録する際、ご希望の開始日と終了日を選択することができます。その期間中は、ご自身の都合に合わせて、非同期形式でコースにアクセスし、学習を進めることができます。
このコースはどのような方に適していますか?
抗体エンジニア、計算生物学者、構造生物学者、生物物理学的特性評価研究者

概要

計算分子モデリングツールは、抗体開発においてその有効性が実証されており、抗体創薬業界全体でその利用が拡大しています。現代の抗体エンジニアは、キャリアを通じて頻繁に分子モデリングに携わることになるため、関連するツールや手法について基礎的な理解を持つことが極めて重要です。

このコースは、資格やバッジを取得することで、キャリアアップを図り、履歴書を充実させたい方に最適です。

  • 業界をリードするシュレーディンガーの「BioLuminate」および「LiveDesign」を実際に操作してみましょう
  • 進行中のプロジェクトに直接応用できる手法を学ぶことで、研究プログラムをスムーズにスタートさせましょう
  • 抗体の構造予測から開発可能性解析に至るまで、幅広いトピックを学ぶ
  • コースの内容を確実に習得していることを示すため、独自にケーススタディを実施する
  • コースの課題やコースに関する質問について、シュレーディンガー・エデュケーション・チームの専門家によるレビューやフィードバックを活用できます
  • コース期間中は、ご自身の都合に合わせて、いつでも自由に教材に取り組んでください。

 

本コースでは、コース受講に必要なライセンスおよび計算リソースが備わった、Web版シュレーディンガー・ソフトウェアへのアクセス権が付与されます:

要件
  • 安定した高速インターネット接続(8 Mbps以上)が利用できるコンピュータ
  • マウスおよび/または外部モニター(推奨されますが、必須ではありません)
  • タンパク質の構造に関する基礎知識を身につけておく
認証
  • シュレーディンガー講座の責任者が署名した証明書
  • LinkedInなどのソーシャルメディアに投稿できるバッジ
背景柄

学習内容

BioLuminate インターフェース

バイオロジクスモデリングのための業界をリードするインターフェースの使い方を学びましょう。モデリングワークフローを実行するのに、コーディングやスクリプト作成は一切必要ありません。

構造および配列に基づくモデリング 

抗体の構造予測、PDBから読み込んだ抗体構造の処理、構造の信頼性解析、配列アラインメント、および配列アノテーション

抗体のモデリングワークフロー

開発可能性解析、ヒューマナイゼーション、計算機支援変異導入、および抗体・抗原ドッキングに関するベストプラクティス

プロジェクトへのワークフローの適用

IFNGR1を標的とする抗体について、さまざまなバリエーションを提案する自由形式のケーススタディにおいて、ご自身のスキルを活かしてください。

モジュール

モジュール1
3時間

はじめに・概要

動画
動画
  • コース概要
  • 計算機を用いた抗体工学入門
  • シュレーディンガー・ツールを用いたワークフロー入門
課題
必読文献

疾患の治療を目的とした治療用抗体の開発

チェックポイント終了
モジュール終了時のチェックポイント
モジュール2
3時間

BioLuminateにおける基本的なタスクとワークフロー

動画チュートリアル
動画チュートリアル
  • はじめに
  • 構造のインポート、選択、組み込み、およびスタイル設定
  • ワークスペースの切り替え機能、構造階層、および測定値について
  • チェーンの名称変更とプロジェクトテーブルとの連携
課題
必読文献

抗体プロファイリングのための計算機支援開発ガイドライン

チェックポイント終了
モジュール終了時のチェックポイント
モジュール3
4時間

構造ベースおよび配列ベースの設計に向けたツールボックスの活用

動画チュートリアル
動画チュートリアル
  • タンパク質調製ワークフローおよび信頼性解析
  • 抗体の構造予測と精緻化
  • タンパク質間相互作用解析
  • マルチプル配列ビューア/エディタの概要(第1部・第2部)
動画
動画
  • 抗体構造予測の概要
  • 新規・特殊な抗体フォーマットを用いた研究
課題
課題

FDA承認済みモノクローナル抗体の抗体構造予測

チェックポイント終了
モジュール終了時のチェックポイント
モジュール4
5時間

抗体のモデリングに関する事例研究

課題
課題

ヒトモノクローナル抗体の表面特性を設計することで、生体内での自己会合と急速なクリアランスを防止できる

動画チュートリアル
動画とチュートリアル
  • タンパク質表面解析 ― 凝集のホットスポットの特定
  • 抗体のヒト化およびバックミューテーション
  • タンパク質間ドッキングおよび解析
  • 残留物スキャン
  • 抗体発見のための統合情報科学
チェックポイント終了
モジュール終了時のチェックポイント
モジュール5
5時間

最後の事例研究

動画
動画

最後のケーススタディの概要

チュートリアル
チュートリアル
  • A6-IFNGR1界面の解析
  • アラニンスキャニング
  • IFNGR1のホモログ配列解析
  • IFNGR1に対する親和性を高めるための残基スキャン
課題
課題

最終課題

コース修了
コースの修了と認定

シュレーディンガー・オンライン講座の資金調達についてサポートが必要ですか?

私たちは次世代の科学者を誇りを持って支援しており、経済的な余裕のない方々にも機会を提供することに尽力しています。学生、ポスドク、あるいは産業界の科学者として、当社のオンライン認定コースを受講するための資金援助制度についてご確認の上、今すぐお申し込みください!

卒業生の声

「これは単なるソフトウェアの使い方を教える講座にとどまらず、抗体モデリングという分野そのものや、その分野の専門家が用いる手法について学ぶための素晴らしい入門講座です。」
ダスティン・ウッズ、エボテックSE上級研究員
「このコースはよく構成されており、変異のモデリングや、それらが抗体の開発可能性や親和性に及ぼす潜在的な影響を評価する上で役立つ、いくつかの計算ツールを順を追って学ぶことができました。」
ジェニファー・クン デナリ・セラピューティクス社 研究員
「経験が浅い人でも、計算機を用いた抗体工学の入門として最適です。」
ソフィー・コング EpiBiologics研究員
「この講座は、私たちの工学プログラムで活用できる強力なソフトウェアについて、非常に良い入門となりました。」
アレックス・キナ オートラス・セラピューティクス社 研究担当ディレクター
「このコースは大変参考になり、理解しやすかったです。ソフトウェアを使った実践的なアプローチやチュートリアルのおかげで、このプログラムのスキルを身につけることができました。」
ロバート・ジェームズ IDEXX 臨床検査技師 III
「ここで身につけたスキルが、今後の抗体工学や治療薬設計の業務に直接役立つと確信しています。」
ユスティナ・ヤブロンスカ Ryvu Therapeutics上級研究員
「ここで学んだことの少なくとも一部を、今後の抗体工学の研究に活かせることを期待しています。」
Yan Huang、Scholar Rock 主任研究員
「『計算機を用いた抗体工学』の講座は、素晴らしい学びの機会となりました。多くの新しい知識を得ることができ、内容も明確で理解しやすかったです。」
ハイメ・ギレン、Imcheckシニアサイエンティスト
「これは非常に有意義な学びの経験であり、今後、計算ソフトウェアを活用して、自分自身の抗体工学プロジェクトを進めることができるようになるでしょう。」
バート・アッカーショット、Smivet B.V.上級研究技術者

コースのバッジと修了証で、新たに身につけたスキルをアピールしましょう

当社の分子モデリングコースを修了し、学んだことを同僚や雇用主に共有する準備が整ったら、LinkedInのプロフィールに修了証やバッジを掲載することができます。

よくある質問

オンライン講座の受講料はいくらですか?

受講料はコースごと、および受講者の種類によって異なります。これらのコースを受講希望の学生の方には、入門コースが150ドル、材料科学のセットコースが305ドル、上級コースが870ドルの学生割引価格をご用意しています。一般の受講者の場合、入門コースは575ドル、上級コースおよびセットコースは1435ドルとなります。

コースはいつから始まりますか?

コースはセッション制で運営されており、各セッションは3~6週間の期間で、その間、受講生はコースの受講やソフトウェアの利用が可能です。各コースのページで、セッション日程や開始日をご確認いただけます。

講義は何時からですか?

コースのセッションが始まると、すべての講義は非同期形式となり、自分のペースで視聴できる動画やチュートリアル、課題などを都合の良い時に利用することができます。

このコースの受講料はどうやって支払えばいいですか?

受講をご希望の方は、登録手続きを完了し、クレジットカード決済ポータルをご利用いただくことで、即座にコースのお支払いが可能です。デビットカードはご利用いただけませんので、クレジットカードが必要となります。なお、ご要望に応じて発注書を発行することも可能です。このオプションをご希望の場合は、online-learning@schrodinger.com までメールにてご連絡ください。コースのお支払い方法についてご質問がある場合は、当サイトの「支払い方法」ページをご覧ください。

登録する前に、コースの内容をどのように確認できますか?
学生向けの奨学金の制度はありますか?

シュレーディンガーは、経済的に恵まれない学生を支援することに尽力しています。シュレーディンガーの使命は、治療薬や材料の発見方法に変革をもたらすことで、人々の健康と生活の質を向上させることです。シュレーディンガーは、次世代の科学者を支援できることを誇りに思っています。当社は、経済的支援を必要としていることが証明でき、かつ指導教員からの推薦状を提出できる、フルタイムの学生またはポスドクを対象とした奨学金プログラムを設立しました。 当奨学金プログラムの応募資格を満たす方は、ぜひ申請フォームにご記入ください!

コース終了後も教材は引き続き利用できますか?

コースが終了するとソフトウェアへのアクセスは終了しますが、コース内の教材の一部(スライド、論文、チュートリアルなど)はダウンロード可能となっており、コース終了後も参照することができます。一方、動画、クイズ、ソフトウェアへのアクセス権などのその他の教材は、コース期間中のみ利用可能です。

このコースを受講するには、そのソフトウェアへのアクセス権が必要ですか? ソフトウェアは別途購入する必要がありますか?

コース期間中は、Maestro、Bioluminate、Materials Science Maestro、および/またはLiveDesign(コースによって異なります)のウェブ版をご利用いただけます。ソフトウェアの利用権を別途購入する必要はありません。コース終了とともにソフトウェアへのアクセスは終了しますが、コース内の資料の一部(スライド、論文、チュートリアルなど)はダウンロード可能となっており、コース終了後も参照することができます。 動画、クイズ、ソフトウェアへのアクセス権などのその他の教材は、コース期間中のみご利用いただけます。シュレーディンガー社のソフトウェアは、コースに関連する目的でのみご利用いただくようお願いいたします。

関連コース

創薬のための分子モデリング入門 ライフサイエンス ライフサイエンス
創薬における分子モデリング入門

MaestroおよびLiveDesignを用いたタンパク質調製、リガンドドッキング、共同設計、および低分子創薬のその他の基礎

FEP+を用いた創薬のためのフリーエネルギー計算 ライフサイエンス ライフサイエンス
FEP+を用いた創薬のための自由エネルギー計算

低分子化合物のリード化合物最適化に向けた、相対結合FEP+計算の実行、解析、およびトラブルシューティング

協力団体

提携団体_抗体学会のロゴ