药物发现中的分子建模导论
使用 Maestro 和 LiveDesign 进行蛋白质制备、配体对接、协同设计以及小分子药物发现的其他基础工作
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可用语言
中文、英语、日语、韩语
时长
5周 / 约20小时完成
级别
简介
成本
非学生用户需支付 600 美元
学生/博士后 160美元
课程时间安排
报名课程时，您可以选择自己希望的开始和结束日期。在该时间段内，您可以异步访问课程，并根据自己的时间安排进行学习。
概述
计算分子建模工具已在药物发现领域证明其有效性，并在整个制药行业中的应用日益广泛。当今的药物研发人员在整个职业生涯中将持续接触分子建模，因此对相关工具和方法具备基础性的理解至关重要。
本课程非常适合希望通过获得证书和徽章来提升职业能力、丰富简历的人士。
- 在课程期间，您可以根据自己的时间安排，随时随地亲自动手操作Schrodinger的Maestro和LiveDesign软件
- 通过学习可直接应用于当前项目的研究方法，为您的研究计划开个好头
- 学习从蛋白质结构制备到配体对接等各类主题
- 完成一项完全独立的案例研究，以证明已掌握课程内容
- 在课程作业和疑问方面，可获得薛定谔专家的评审和反馈
本课程提供基于网页的薛定谔软件（Schrödinger）的使用权限，并配备了课程所需的许可和计算资源：
要求
- 一台配备可靠高速互联网连接（8 Mbps 或更高）的计算机
- 鼠标和/或外接显示器（推荐但非必需）
- 熟悉蛋白质结构、化合物效力、分子量和pKa等概念
认证
- 由薛定谔课程负责人签署的证书
- 一枚可以发布到社交媒体（例如领英）上的徽章
您将学到什么
Maestro 界面
使用业界领先的小分子建模图形用户界面。请注意，在本课程中运行建模工作流无需编写代码或脚本。
计算药物设计基础
了解计算工具如何已被应用于药物发现项目，以及一些最常见工作流程背后的基本理论
基于结构和配体的建模工作流
蛋白质和配体制备、结构分析、基于配体的虚拟筛选以及多参数配体优化的最佳实践
将工作流应用于项目
在一项开放式案例研究中运用您的技能，利用协作型企业信息学平台设计新型VEGR2抑制剂
模块
第1模块
2小时
建模与场景设置入门
课程大纲与荣誉守则
对学术诚信的期望
视频
介绍分子建模的价值及案例研究
模块结束检查点
第2模块
3小时
Maestro 用户界面的基本操作
视频教程
入门与小分子修饰
模块结束检查点
第3模块
4小时
查看蛋白质-配体相互作用
视频教程
- 浏览结构层次并添加曲面
- 配体相互作用图及共享生成的图像
- 使用LigPrep制备配体以及配体对齐
模块结束检查点
第4模块
4小时
基于结构的虚拟筛选技术
视频教程
- 选择虚拟筛选方法以及基于结构的虚拟筛选与配体对接
- 蛋白质结构检查与预处理、对接网格生成以及对接分析
- 使用“配体设计器”进行枚举与分析
模块结束检查点
第5模块
2小时
基于配体的虚拟筛选技术
视频教程
基于配体的虚拟筛选方法
教程
基于构象的配体数据库筛选
模块结束检查点
第6模块
4小时
LiveDesign 中的工作流程和练习
视频教程
- 在药物研发中有效组织数据并开展协作
- 协作药物设计的工作流程
教程
药物发现项目的构思，包括在 LiveDesign 中构建和分析数据
模块结束检查点
第7模块
6小时
VEGFR2案例研究
视频
激酶结构与活性的背景知识
教程
- 执行对接
- 计算富集度
- 分析热门剧集
- 模拟构思
作业
- 拓展活动提交
- 最终化合物提交
课程结业与证书
需要帮助申请施罗丁格在线课程的资金吗？
我们自豪地支持新一代科学家，并致力于为资源有限的人士提供机会。无论您是学生、博士后还是行业科学家，都可以了解我们在线认证课程的资助方案，并立即报名！
通过课程徽章和证书，展示你新掌握的技能
当您完成我们提供的分子建模课程，并准备将所学知识分享给同事和雇主时，可以在您的 LinkedIn 个人资料中展示您的证书和徽章。
常见问题
在线课程的费用是多少？
课程价格因课程类型和学员类别而异。对于希望参加这些课程的学生，我们提供以下学生专享价格：入门课程150美元，材料科学课程套餐305美元，高级课程870美元。对于商业学员，入门课程价格为575美元，高级课程及课程套餐价格为1435美元。
课程什么时候开始？
课程以期为单位进行，每期为期3至6周，在此期间，学员可访问课程内容并使用相关软件。您可以在各课程页面上查看课程期次及开课日期。
讲座是什么时候？
课程开始后，所有课程均为异步进行，您可以根据自己的时间安排，随时观看自主学习的视频、教程并完成作业。
我该如何支付这门课程的费用？
有兴趣的参与者可通过完成注册并使用信用卡支付通道进行即时报名来支付课程费用。请注意，您必须使用信用卡支付，因为我们不接受借记卡。此外，我们可根据要求提供采购订单，如需此选项，请发送电子邮件至 online-learning@schrodinger.com。如果您对课程付款方式有任何疑问，请访问我们的“付款方式”页面。
如何在注册前预览课程？
是否有面向学生的奖学金机会？
施罗丁格致力于为资源有限的学生提供支持。施罗丁格的使命是通过革新药物和材料的发现方式，改善人类健康和生活质量。施罗丁格自豪地支持新一代科学家。我们设立了一项奖学金计划，面向能够证明有经济困难并获得学术导师支持声明的全日制学生或博士后研究人员。 如果您符合我们的奖学金计划申请条件，请填写申请表！
课程结束后，学习资料还能继续使用吗？
虽然课程结束时将无法再访问该软件，但课程中的部分资料（幻灯片、论文和教程）可供下载，以便您在课程结束后随时查阅。其他资料，例如视频、测验以及软件访问权限，仅在课程期间内可用。
我需要使用该软件才能参加这门课程吗？我需要另外购买该软件吗？
在课程期间，您将能够使用Maestro、Bioluminate、Materials Science Maestro和/或LiveDesign的网络版（具体取决于课程内容）。您无需单独购买任何软件的使用权限。虽然课程结束时软件使用权限将终止，但课程中的部分资料（幻灯片、论文和教程）可供下载，以便您在课程结束后查阅。 其他材料，例如视频、测验以及软件使用权限，仅在课程期间内有效。请注意，Schrödinger软件仅限用于与课程相关的目的。
校友心声