自信地、准确地生成、评分和优化您的蛋白质降解剂 复合物
利用Schrödinger的全面工作流程,开始对蛋白质降解剂进行理性设计
蛋白质降解剂通过利用细胞的天然降解途径,为调节蛋白质功能提供了一种新型机制。目标蛋白、E3连接酶和降解剂 之间形成的三元复合物,对于靶点 的降解至关重要,尽管这并非充分条件。 因此,了解该三元复合物的结构对于理性设计更高效的降解剂至关重要。Schrödinger的双功能降解剂 Solutions 可预测可能的三元复合物,并对其进行准确评分,从而缩小待考虑的模型范围,用于连接子设计;降解剂 优化 。
借助基于结构的计算机模拟工作流程,对您的蛋白质降解剂 设计充满信心
利用最先进的评分函数对三元复合体进行精准评分,从而将资源集中于少数几个模型上
通过采用基于计算的 优化 方法设计更优异的蛋白质降解剂,以提高其结合能力亲和力 和降解剂 活性
通过预测建模 结合计算工作流,实现基于结构的理性设计,从而从一开始就受益于假设驱动的设计策略
这是您更新的结构预测 三元复合工具箱
PROTAC(蛋白降解靶向嵌合体) 的其他应用及最佳实践
Schrödinger的FEP+ 可用于靶点 和E3连接酶活性头优化 ,在优化性质或探索连接子连接点及可能的出靶向量时,仍能保持活性。我们的分子动力学(MD)工作流程(Desmond )还探索了降解剂 的可能出靶向量,并能进行精确采样。

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