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酶工程

利用基于结构的设计高效优化酶

利用基于结构的设计高效优化酶

计算机辅助酶设计的能力

可直接根据序列轻松构建3D酶结构,并了解底物与活性位点的结合情况

  • 导入、分析和编辑蛋白质序列,包括使用“多序列查看器”进行快速序列比对和注释
  • 利用全自动工作流程,根据序列构建高质量的同源模型
  • 使用 Prime 进行结构精修,或使用 Desmond 通过分子动力学进行平衡计算
  • 利用先进的、完全灵活的对接技术预测高保真度的实验结合构象

理解底物与活性位点的结合

  • 执行快速对接
  • 利用先进的、完全灵活的对接技术预测高保真度的实验结合构象

提高动力学性能和反应性

  • 通过量子力学(QM)计算,深入了解反应机理
  • 理解过渡态和反应能垒
  • 将量子力学的精度与分子力学的速度相结合(QM/MM)

提高特异性、选择性和底物范围

  • 利用恒pH模拟,对复杂界面或活性位点中可滴定蛋白质残基进行准确且高效的pKa预测
  • 使用残基扫描功能快速高效地扫描残基突变
  • 利用 FEP+ 技术对酶进行工程改造,以提高其热稳定性、底物选择性和特异性

设计具有更佳化学和物理稳定性的酶

  • 鉴定蛋白质表面上的化学不稳定残基
  • 准确预测突变体在高温下的相对热稳定性
  • 预测最适合减轻化学风险的残基突变
  • 预测该酶表面残基的聚集倾向
 

利用薛定谔(Schrödinger)的尖端软件设计高质量的生物制剂

BioLuminate


生物制剂发现的建模环境

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协作式数字生物制剂设计与发现实验室

背景图案

精选网络研讨会

文档与教程

了解常见问题的解答,并掌握使用Schrödinger软件的最佳实践。

生命科学 教程

蛋白质表征:第2部分

通过进行和分析分子动力学模拟,探讨牛β-乳球蛋白在不同pH值条件下的性质特征。

生命科学 教程

利用BioLuminate进行酶工程

研究OYE家族中一种烯烃还原酶的突变对酶稳定性和配体结合的影响。

生命科学 教程

基于解离动力学模拟预测药物在体停留时间

在某个激酶系统上运行解离动力学工作流,并分析结果。

生命科学 文档

德斯蒙德

利用基于GPU的高性能分子动力学(MD)引擎对生物系统进行模拟。

生命科学 文档

BioLuminate

Schrödinger 用于生物制剂发现的综合建模平台。

生命科学 文档

文档

涵盖面板和工作流的全面参考文档。

生命科学 文档

学习路径:计算结构预测

对用于预测生物大分子整体或部分结构的工具和工作流的系统性概述。

生命科学 教程

基于恒定pH值分子动力学的蛋白质pKa预测

确定蛋白质残基的pKa值和质子化状态。

生命科学 教程

利用蛋白质FEP+引导设计提高T4溶菌酶的热稳定性

通过利用蛋白质FEP+的突变填补埋藏空腔,提高蛋白质的热稳定性。

生命科学 教程

二硫键工程

进行半胱氨酸扫描,以识别可突变为半胱氨酸的残基,从而提高热稳定性并促进结晶。

主要产品

进一步了解可用于推进您研究项目的关键计算技术。

BioLuminate

用于生物制剂发现的综合建模平台

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Prime

一种用于精确预测蛋白质结构的强大且创新的解决方案

滑行

业界领先的配体-受体对接解决方案

IFD-MD

针对新型化学物质,对靶点和非靶点进行精确的配体结合模式预测

捷豹

利用量子力学快速、准确地预测分子结构和性质的解决方案

德斯蒙德

一款高性能分子动力学(MD)引擎,具备高可扩展性、高吞吐量和科学精度

出版物

浏览相关应用领域中采用薛定谔技术的经同行评审的出版物列表。

生命科学 出版物

靶点-蛋白质结构预测中的模板关系及其对热稳定性计算准确性的影响

生命科学 出版物

通过工程改造Penicillium verruculosum内切葡聚糖酶的二硫键以提高其热稳定性

满足您组织需求的软件和服务

软件平台

利用一个功能全面且易于使用的分子建模、设计和协作平台,部署数字化药物发现工作流程。

模特服务

充分利用施罗丁格(Schrödinger)的计算专业知识和技术优势,助力您的项目顺利通过药物发现过程中的关键阶段。

支持与培训

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