8月17日から21日までの1週間、シュレーディンガーの全世界のオフィスは、社員全員が休息を取り、リフレッシュするための全社的な取り組みの一環として休業いたします。この期間中は、お問い合わせへの対応が制限される場合がございますので、あらかじめご了承ください。科学・技術サポートチームのメンバーは、緊急のサポート案件のみに対応いたします。

酵素工学

構造に基づく設計を用いて酵素を効率的に最適化する

構造に基づく設計を用いて酵素を効率的に最適化する

インシリコ酵素設計のための機能

配列から直接、3D酵素構造を簡単に構築し、活性部位への基質結合のメカニズムを理解できます

  • Multiple Sequence Viewer を使用して、タンパク質配列のインポート、解析、編集を行うほか、迅速な配列アラインメントやアノテーションも可能です。
  • 完全に自動化されたワークフローを用いて、配列から高品質なホモロジーモデルを生成する
  • Prime を使用して構造の精緻化を行うか、Desmond を使用して分子動力学による平衡化を行う
  • 高度で完全に柔軟なドッキング手法を用いて、高精度な実験的結合姿勢を予測する

活性部位への基質結合の理解

  • クイックドッキングを実行する
  • 高度で完全に柔軟なドッキング手法を用いて、高精度な実験的結合姿勢を予測する

運動能力と反応性を向上させる

  • 量子力学(QM)計算を通じて、反応メカニズムに関する貴重な知見を得る
  • 遷移状態と反応障壁を理解する
  • 量子力学の精度と分子力学の計算速度を組み合わせる(QM/MM)

特異性、選択性、および基質範囲の向上

  • 定pHシミュレーションを用いて、複雑な界面や活性部位にある滴定可能なタンパク質残基について、正確かつ効率的なpKa予測を行う
  • 「残基スキャン」機能を使用して、残基の変異を迅速かつ素早くスキャンします
  • FEP+を用いて、熱安定性、基質選択性、および特異性を備えた酵素を設計する

化学的および物理的安定性が向上した酵素の設計

  • タンパク質表面にある化学的に不安定な残基を特定する
  • 高温下における変異体の相対的な熱安定性を正確に予測する
  • 化学的リスクを軽減するのに最も適した残基変異を予測する
  • 酵素の表面残基の凝集傾向を予測する
 

シュレーディンガーの最先端ソフトウェアを活用して、高品質なバイオ医薬品を設計する

BioLuminate


バイオ医薬品創薬のためのモデリング環境

LiveDesign


デジタルバイオロジクスに関する共同設計・創薬研究所

ドキュメントとチュートリアル

シュレーディンガーのソフトウェアに関するよくある質問への回答や、その活用におけるベストプラクティスをご確認ください。

ライフサイエンス チュートリアル

タンパク質の特性解析:第2部

分子動力学シミュレーションの実施および解析を通じて、さまざまなpH条件下におけるウシβ-ラクトグロブリンタンパク質の特性解明を行う。

ライフサイエンス チュートリアル

BioLuminateを用いた酵素工学

OYEファミリーに属するアルケンレダクターゼの変異が、酵素の安定性およびリガンド結合に及ぼす影響を調査する。

ライフサイエンス チュートリアル

解離動力学シミュレーションに基づく薬物の滞留時間の予測

キナーゼ系に対して解離速度論ワークフローを実行し、その結果を分析する。

ライフサイエンス ドキュメント

デズモンド

GPUを活用した高性能分子動力学(MD)エンジンを用いて、生物学的システムをシミュレーションします。

ライフサイエンス ドキュメント

BioLuminate

バイオ医薬品創薬のためのシュレーディンガーの包括的なモデリングプラットフォーム。

ライフサイエンス ドキュメント

ドキュメント

パネルやワークフローに関する包括的なリファレンス資料。

ライフサイエンス ドキュメント

学習パス:計算による構造予測

生体高分子の構造全体またはその一部を予測するためのツールとワークフローに関する体系的な概要。

ライフサイエンス チュートリアル

定pH分子動力学法を用いたタンパク質のpKa予測

タンパク質残基のpKa値およびプロトン化状態を決定する。

ライフサイエンス チュートリアル

タンパク質FEP+に基づく設計を用いたT4リゾチームの熱安定性の向上

タンパク質FEP+を用いた突然変異により、埋没した空洞を埋めることで、タンパク質の熱安定性を高める。

ライフサイエンス チュートリアル

ジスルフィド結合の設計

システインスキャニングを実施し、熱安定性を向上させ、結晶化を促進するためにシステインへ置換可能な残基を特定する。

主力製品

研究プロジェクトを前進させるために活用できる主要な計算技術について、詳しくご覧ください。

BioLuminate

バイオ医薬品創薬のための包括的なモデリングプラットフォーム

LiveDesign

デジタル分子設計のための総合ラボ

プライム

タンパク質構造を正確に予測するための、強力かつ革新的なソリューション

グライド

業界をリードするリガンド・受容体ドッキングソリューション

IFD-MD

新規化合物における、オンターゲットおよびオフターゲットに対する正確なリガンド結合様式の予測

ジャガー

分子構造および物性を迅速かつ正確に予測するための量子力学に基づく手法

デズモンド

高いスケーラビリティ、スループット、および科学的精度を備えた高性能分子動力学(MD)エンジン

出版物

シュレーディンガー技術を活用した、関連応用分野における査読付き論文の一覧をご覧ください。

ライフサイエンス 出版物

タンパク質構造予測におけるターゲット・テンプレートの関係と、それが熱安定性計算の精度に及ぼす影響

ライフサイエンス 出版物

Penicillium verruculosum由来のエンドグルカナーゼの熱安定性を向上させるためのジスルフィド結合の改変

組織のニーズに応えるソフトウェアとサービス

ソフトウェアプラットフォーム

分子モデリング、設計、およびコラボレーションのための包括的で使いやすいプラットフォームを活用し、デジタル創薬ワークフローを導入しましょう。

モデリングサービス

シュレーディンガーの計算に関する専門知識と技術を大規模に活用し、創薬プロセスの重要な段階において、お客様のプロジェクトを前進させましょう。

サポートとトレーニング

初心者から経験豊富なユーザーまでを対象に設計された、専門家のサポート、学習教材、およびトレーニングリソースをご利用いただけます。