- de novoによるCDRループの立体構造予測を組み込んだ、完全にガイドされたホモロジーモデリングワークフローを用いて、抗体の構造を予測する
- 親配列とその変異体に対するモデル構築を加速するために、バッチホモロジーモデリングを実行する
- 構造特性評価のための予測ツールを用いて抗体配列のモデリングと選別を行い、有望なリードを特定し、優先順位を付ける
抗体の設計
抗体の構造に基づく設計に関する技術
従来のIgG形式、またはその他の形式で
配列情報から直接、抗体の信頼性の高い3D構造モデルを構築する
合理的な抗体のヒト化プロセスを効率化する
- 標的残基の変異と組み合わせたCDRグラフト法によるヒト化抗体の作製
- 得られた構成体の「人間らしさ」の割合を評価する
抗体と抗原の相互作用を理解し、予測する
- アンサンブルタンパク質間ドッキングによる抗体-抗原複合体の構造予測
- 実験によるエピトープマッピングデータ（例：変異導入や質量分析）の解像度を、ペプチドレベルから残基レベルの詳細まで高める
- 高速なタンパク質間ドッキングによる、好ましい抗体-抗原相互作用の特定
- 使いやすいグラフィカルユーザーインターフェースを用いて、予測されたタンパク質間相互作用を調査・分析する
潜在的な法的責任を早期に特定することで、開発リスクを軽減する
- 構造特性評価のための予測ツールを用いて抗体配列のモデリングと選別を行い、有望なリードを特定し、優先順位を付ける
- 翻訳後修飾および化学反応性が見込まれる表面部位を特定する
- 計算機を用いたタンパク質表面解析により、集合の発生が予想される箇所を特定する
インシリコによる抗体の設計
- 残基置換が結合親和性、選択性、および熱安定性に及ぼす影響を正確に予測する
- ラムダダイナミクスを用いたResidue Scan FEP+により、高品質なタンパク質バリアントを迅速に同定する
- 「Protein Mutation FEP+」を用いて、実験的に決定された相対自由エネルギーを約1 kcal/mol以内の精度で再現し、抗体候補の選定を精緻化する
- 扱いやすい計算ワークフローを用いて、多パラメータ最適化を実行します。例えば、安定性、親和性、交差反応性、凝集傾向、および翻訳後修飾のリスクを同時に最適化します。
シュレーディンガーの最先端ソフトウェアを活用して、高品質なバイオ医薬品を設計する
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バイオ医薬品創薬のためのモデリング環境
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バイオ医薬品向けの新たな計算機支援設計手法を用いたタンパク質の安定性の最適化
計算モデルを用いた抗体医薬品の創薬の加速
計算機モデリングに基づく抗体のヒト化
ドキュメントとチュートリアル
シュレーディンガーのソフトウェアに関するよくある質問への回答や、その活用におけるベストプラクティスをご確認ください。
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出版物
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