타겟 활용 과정: 리간드와 단백질의 이미지

대상 활성화, 준비 및 검증


X선 결정학, 극저온 전자현미경(cryo-EM), 기계학습(ML) 기법 및 상동 모델링을 통해 얻은 단백질 구조를 구조 기반 전산 워크플로우에 활용

상세 정보
지원 언어
중국어, 영어, 일본어, 한국어
기간
선택한 시작일로부터 5주 동안 최대 20시간
레벨
중급
비용
비학생 이용자의 경우 715달러
학생 및 박사후 연구원 270달러
이 강좌는 어떤 분들에게 적합할까요?
의약화학자, 화학정보학자, 기계학습 연구자, 신진 계산화학자, 구조생물학자

개요

X선 결정학, 극저온 전자현미경(cryo-EM), 그리고 최근에는 기계 학습(ML) 기법을 통해 이용 가능한 구조 데이터가 폭발적으로 증가함에 따라, 구조 기반 계산 워크플로우를 위해 구조를 준비, 정제 및 검증하는 데 필요한 도구와 워크플로우에 대한 필요성이 점점 더 커지고 있다.

슈뢰딩거의 온라인 과정인 ‘타깃 활성화, 준비 및 검증(Target Enablement, Preparation, and Validation)’은 가상 스크리닝, 분자 동역학 시뮬레이션, 자유 에너지 섭동 계산 등 향후 구조 기반 전산 모델링 워크플로우를 위한 프로젝트를 성공적으로 수행할 수 있도록 전문적인 지침과 모범 사례를 제공합니다.

이 과정은 자격증과 배지를 취득하여 전문성을 키우고 이력서를 더욱 알차게 만들고자 하는 분들에게 이상적입니다.

  • 업계 최고의 슈뢰딩거(Schrödinger)의 ‘마에스트로(Maestro)’ 및 명령줄 인터페이스를 직접 사용해 보세요
  • 진행 중인 프로젝트에 바로 적용할 수 있는 방법을 익혀 연구 프로그램을 빠르게 시작하세요
  • AlphaFold 구조 정교화부터 난해한 포켓 식별에 이르기까지 다양한 주제를 배워보세요
  • 수업 내용을 숙지했음을 입증하기 위해 독자적으로 사례 연구를 수행한다
  • 강좌 과제 및 강좌 관련 문의 사항에 대해 슈뢰딩거 교육팀 전문가들의 검토와 피드백을 받아보세요
  • 강좌 기간 중 본인의 일정에 맞춰 편한 시간에 학습 자료를 학습하십시오.

 

이 과정에는 과정 수강에 필요한 라이선스와 컴퓨팅 리소스가 포함된 웹 기반 슈뢰딩거(Schrödinger) 소프트웨어 이용 권한이 제공됩니다:

요구 사항
  • 안정적인 고속 인터넷 접속(8 Mbps 이상)이 가능한 컴퓨터
  • 마우스 및/또는 외장 모니터 (권장되나 필수는 아님)
  • 일반 화학 및 구조 생물학에 대한 실무 지식
  • Maestro에 대한 실무 지식. 이 과정에서는 슈뢰딩거의 그래픽 사용자 인터페이스인 Maestro의 사용법을 다루지 않습니다. Maestro 사용법에 익숙해지려면 ‘Maestro 시작하기’ 자료를 참고하여 학습해 주시기 바랍니다.
인증
  • 이력서나 CV에 첨부할 수 있는, 슈뢰딩거 과정 책임자가 서명한 수료증
  • LinkedIn과 같은 소셜 미디어에 게시할 수 있는 배지
배경 무늬

배울 내용

X선 및 극저온 전자현미경 구조

다양한 품질의 실험적 구조를 준비하고 정교화하는 데 필요한 모범 사례를 알아보세요

ML을 통해 예측된 구조와 상동 모델링

AlphaFold 등에서 도출된 ML 예측 구조 및 상동 모델의 활용 및 정교화 방법에 대한 모범 사례를 알아보세요.

결합 부위 규명

소분자 결합 부위의 약물화 가능성을 평가하는 방법과, 잠재적인 숨겨진 포켓을 탐색하고 특성화하는 방법을 알아보세요.

대상에 대한 향후 활성화

사용 가능한 구조를 철저히 점검하고, 분석 및 개선 과정을 거쳐 대상 시스템을 독자적으로 가동함으로써 자신의 기술을 적용하십시오.

모듈

모듈 1
2시간

대상 활성화 방법 및 구조적 검증의 가치

동영상
동영상

과정 개요

체크포인트
강의 계획서 및 명예 규약

학문적 정직성에 대한 기대

동영상 튜토리얼
동영상
  • 신약 개발 분야의 전산 실험에서 구조 검증의 중요성
  • 일반적인 타겟 활성화 방법 비교
체크포인트 종료
모듈 종료 점검점
모듈 2
5시간

출발점: X선 결정 구조 및 극저온 전자 현미경 구조

동영상
동영상

구조의 가용성 및 실험적 고려 사항

튜토리얼
튜토리얼:
  • 구조 품질 지표
  • 검사 워크플로우
  • 단백질 정제
  • 기본 정제
체크포인트 종료
모듈 종료 점검점
모듈 3
4시간

출발점: AlphaFold 구조 및 상동 모델

동영상
동영상

AlphaFold 및 상동 모델의 생성, 검사 및 검증

튜토리얼
튜토리얼
  • AlphaFold 구조 확보 및 검토
  • 상동 모델링
  • 모델 정교화 기법
체크포인트 종료
모듈 종료 점검점
모듈 4
5시간

다음 단계: 구조에 대한 심층적인 준비, 정교화 및 검증

동영상
동영상

더 까다로운 표적에 대한 정제 및 검증 방법

튜토리얼
튜토리얼
  • 수동 단백질 정제
  • 사이트맵
  • 혼합 용매 분자 동역학
  • WaterMap
체크포인트 종료
모듈 종료 점검점
모듈 5
4시간

사례 연구: 전산 기반 신약 개발을 위한 구조 설계 및 검증

동영상
동영상
  • 사례 연구 개요
  • 사례 연구 결과 및 과정 마무리
튜토리얼
튜토리얼

구조 검사, 준비 및 검증

과제
과제

사례 연구 결과를 검토하고 논의한다

수강 완료
과정 수료 및 수료증 발급

슈뢰딩거 온라인 강좌 자금 조달에 도움이 필요하신가요?

저희는 차세대 과학자들을 자랑스럽게 지원하며, 경제적 여건이 어려운 분들에게 기회를 제공하기 위해 최선을 다하고 있습니다. 학생, 박사후 연구원 또는 산업계 과학자로서 온라인 인증 과정에 대한 다양한 지원 옵션을 확인하고, 지금 바로 등록하세요!

졸업생들의 소감

“이 과정은 고정밀 단백질 예측 방법이 널리 보급된 상황에서 신약 개발 속도를 높여야 하는 시급한 필요성을 해결하기 위해 마련되었습니다. 이 과정을 적극 추천합니다.”
웨이 왕, 아이칸 의과대학 조교수

코스 배지와 수료증을 통해 새로 습득한 기술을 뽐내 보세요

저희 기관에서 분자 모델링 과정을 수료하고, 배운 내용을 동료나 고용주와 공유할 준비가 되셨다면, LinkedIn 프로필에 수료증과 배지를 게시하실 수 있습니다.

자주 묻는 질문

Target 역량 강화, 준비 및 검증 온라인 과정 수강료는 얼마인가요?

수강료는 각 과정 및 수강생 유형에 따라 다릅니다. 이 과정을 수강하고자 하는 학생에게는 240달러의 학생 할인가를, 비학생에게는 645달러의 수강료를 적용합니다.

강의는 몇 시에 시작하나요?

강좌가 시작되면 모든 강의는 비동기식으로 진행되며, 수강생은 본인의 일정에 맞춰 동영상, 튜토리얼 및 과제를 자유롭게 시청할 수 있습니다.

이 수강료는 어떻게 내야 하나요?

관심 있는 참가자분들은 등록 절차를 완료하고 신용카드 결제 포털을 통해 즉시 수강 신청을 하시면 수강료를 결제하실 수 있습니다. 당사는 직불카드를 받지 않으므로 신용카드가 반드시 필요하다는 점을 유의해 주시기 바랍니다. 또한, 요청 시 구매 주문서를 발급해 드릴 수 있으니, 이 옵션에 관심이 있으신 분은 online-learning@schrodinger.com으로 이메일을 보내 주시기 바랍니다. 수강료 결제 방법에 대해 궁금한 점이 있으시면, 당사의 결제 옵션 페이지를 방문해 주시기 바랍니다.

등록하기 전에 강좌를 미리 살펴볼 수 있나요?
학생들을 위한 장학금 기회가 있나요?

슈뢰딩거는 경제적 여건이 어려운 학생들을 지원하기 위해 최선을 다하고 있습니다. 슈뢰딩거의 사명은 치료제 및 신소재 발굴 방식을 혁신함으로써 인류의 건강과 삶의 질을 향상시키는 것입니다. 슈뢰딩거는 차세대 과학자들을 자랑스럽게 후원합니다. 당사는 재정적 지원이 필요함을 입증하고 지도교수로부터 추천서를 받은 정규 재학생 또는 박사후 연구원을 대상으로 하는 장학금 프로그램을 마련했습니다. 저희 장학금 프로그램 지원 자격이 되신다면, 신청서를 작성해 주시기 바랍니다!

강좌가 끝난 후에도 학습 자료는 계속 이용할 수 있나요?

강좌가 종료되면 소프트웨어 이용 권한은 종료되지만, 강좌 내 일부 자료(슬라이드, 논문, 튜토리얼)는 다운로드할 수 있으므로 강좌가 끝난 후에도 다시 참고할 수 있습니다. 동영상, 퀴즈, 소프트웨어 이용 권한과 같은 다른 자료들은 강좌 기간 동안에만 이용할 수 있습니다.

이 강좌를 수강하려면 해당 소프트웨어에 접속할 수 있어야 하나요? 소프트웨어를 별도로 구매해야 하나요?

과정 기간 동안, 수강생 여러분은 (과정에 따라) Maestro, Bioluminate, Materials Science Maestro 및/또는 LiveDesign의 웹 기반 버전을 이용할 수 있습니다. 별도의 소프트웨어 이용권을 구매하실 필요는 없습니다. 과정 종료 시 소프트웨어 이용 권한은 종료되지만, 과정 내 일부 자료(슬라이드, 논문, 튜토리얼)는 다운로드가 가능하므로 과정 종료 후에도 다시 참고하실 수 있습니다. 동영상, 퀴즈, 소프트웨어 이용 권한과 같은 기타 자료는 과정 진행 기간 동안에만 이용 가능합니다. 슈뢰딩거(Schrödinger) 소프트웨어는 과정과 관련된 목적으로만 사용해야 함을 유의해 주시기 바랍니다.

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