APR 28, 2026

BMS-8 파생상품 설계

노팅엄 트렌트 대학교에서는 학사 과정 2학년 학생들이 모의 제약 계약 연구 기관(CRO)을 구성합니다. 학생들은 1년 동안 BMS-8의 유도체에 대한 전산 및 합성 연구를 수행합니다. [1]

계산 실습은 학생들이 합성 실험실에 들어가기 전에 진행됩니다. 논문 [1]을 참고하여, 학생들은 단백질 데이터 뱅크(Protein Data Bank)에서 리간드가 도킹된 단백질 구조를 다운로드하고, 주요 리간드-단백질 상호작용을 파악합니다. 그런 다음 학생들은 해당 구조를 GaussView로 불러와 리간드와 상호작용하는 잔기 외의 모든 잔기를 제거합니다. 이 결합 포켓 구조를 활용하여, 학생들은 일련의 계산을 수행하여 전체 결합 에너지와 특정 수소 결합 및 파이 스태킹 상호작용의 에너지를 산출합니다. 리간드와 단백질 잔기 간의 다양한 상호작용에 대한 이러한 이해를 바탕으로, 학생들은 BMS-8의 유도체를 고려하고, 이전에 확인된 리간드-단백질 상호작용 중 리간드의 각 변형에 의해 변경될 가능성이 높은 것이 무엇인지 파악한 뒤, 이를 합성 계획에 반영하여 실험실로 가져갑니다. 저희 학생용 워크시트를 공유해 드리겠습니다.

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