전 세계 모든 Schrödinger 사무소는 휴식과 재충전을 위한 전사적 조치의 일환으로 8월 17일부터 21일까지 일주일간 휴무합니다. 이 기간 동안 문의에 대한 답변이 제한될 수 있으니 양해 부탁드립니다. 과학 및 기술 지원팀 직원들은 긴급 지원 문의에 한해 대응할 예정입니다.

FEP+ 생물학적 제제용

신약 개발 위한 고성능 자유 에너지 계산

FEP+ 생물학적 제제용

다음과 함께 더 나은 단백질을 더 빠르게 개발하세요 FEP+

FEP+ 이는 Schrödinger의 독자적인 물리학 기반 자유 에너지 섭동 기술입니다. 생물학적 제제 신약 개발 프로젝트에서 ‘ FEP+ ’를 활용하면, 실험적 방법과 ~1 kcal/mol 이내의 오차 범위에서 일치하는 정확도로 단백질 돌연변이의 영향을 컴퓨터 시뮬레이션을 통해 예측할 수 있습니다.

관련 없는 변이들을 조기에 걸러내고 , 새로운 아이디어와 후속 설계를 신속하게 도출함으로써 결과 도출까지 걸리는 시간을 몇 개월에서 몇 주로 단축합니다 .

사이클 수를 줄이고 분석하는 변이체 수를 줄임으로써, 기존의 유도 진화 습식 실험실 프로토콜에 비해 단백질 최적화 비용을 절감합니다.

여러 매개변수를 동시에 최적화하여 더 우수한 후보를 선별함으로써, 아이디어에 대한 테스트 및 선별 과정을 더욱 신속하게 진행할 수 있도록 한다

주요 적용 분야

친화성 공학

단백질과 그 표적 간의 결합 친화도를 높이거나 낮추다

선택성 공학

단백질이 한 표적에 대해 다른 표적보다 우선적으로 결합하도록 조절하기

교차반응 공학

여러 표적에 걸친 결합 범위의 확대

pH에 따른 결합

두 단백질 간의 pH에 따른 결합 또는 해리를 유도한다

안정성 공학

단백질 기반 생물학적 제제의 물리적 특성 안정성 을 개선한다

개발 가능성 평가

용해도, 화학적 안정성 및 물리적 특성과 같은 속성을 최적화합니다. 안정성

Schrödinger의 검증된 단백질 공학 기술을 활용하세요

단백질 FEP+

항체, 항원, 펩타이드, 효소 및 기타 생물학적 제제의 최적화 과정에서 돌연변이가 단백질 안정성 와 단백질-단백질 결합 친화도에 미치는 영향을 정확하게 정량화합니다.

FEP+ 잔류물 스캔

여러 위치에서 발생하는 단일 돌연변이를 동시에 신속하게 모델링하여, 돌연변이 효과에 대한 일관되고 신뢰할 수 있는 예측을 도출하고, FEP+ 계산의 효율성을 획기적으로 향상시킵니다.

Schrödinger’의 맞춤형 단백질 공학 워크플로우

당사의 워크플로는 ‘ FEP+ ’의 Residue Scan 및 ‘Protein’ FEP+ 기술을 활용하여, 단백질 돌연변이를 정밀하고 효율적으로 탐색함으로써 안정성, 결합 친화도, 특이성, pH 의존적 결합 및 교차반응성을 동시에 최적화할 수 있도록 합니다.

FEP+ Residue Scan은 MM/GBSA에 비해 정확도가 7배 향상되었으며, Protein에 비해 처리 속도가 최대 20배 빨라졌습니다. FEP+

MM/GBSA, FEP+ 잔기 스캔 및 단백질 FEP+ 계산 결과(y축)와 kcal/mol 단위로 표시된 상대적 실험적 친화도 측정값(x축) 간의 상관관계 그래프입니다. 모든 계산은 동일한 시스템에서 수행되었으며, 현재 FEP+ 잔기 스캔 결과에서는 프롤린으로의 돌연변이 및 프롤린에서 다른 아미노산으로의 돌연변이가 제외되어 있습니다. 각 그래프의 왼쪽 상단에는 피어슨 상관계수(R²)가 표시되어 있습니다.

단백질 기반 치료제 발굴 분야에 걸쳐 폭넓게 적용

다양한 생물학적 모달리티에 걸쳐 정교한 워크플로우를 활용하세요

항체 설계

효능이 뛰어나고 안전하며, 개발이 가능한 단일클론 항체를 합리적으로 설계한다

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펩타이드 발굴

컴퓨터 시뮬레이션을 이용한 구조 기반 기법을 활용하여 펩타이드 약물을 설계한다

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효소 공학

구조 기반 설계 기법을 활용하여 효소를 효율적으로 최적화한다

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간행물

자유 에너지 섭동(FEP)이란 무엇인가?

FEP+ 를 처음 사용하시는 분이라면, 상대 결합 자유 에너지 섭동(FEP) 계산의 기본 개념을 다시 한 번 복습해 보시기 바랍니다.

문서 및 튜토리얼

Schrödinger의 소프트웨어 사용과 관련된 자주 묻는 질문에 대한 답변을 확인하고, 모범 사례를 알아보세요.

생명과학 튜토리얼

단백질-단백질 복합체의 컴퓨터 시뮬레이션을 이용한 다중 매개변수 최적화

단백질-단백질 복합체를 최적화하기 위해 여러 계산 기법을 간소화된 순차적 인 실리코 워크플로우에 통합한다.

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다음과 같은 거대고리의 친화도 최적화 FEP+

거대고리형 리간드에 대한 FEP+ 분석 수행 시 모범 사례를 알아보세요.

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학습 과정: 순환 펩타이드 모델링

신약 개발 분야에서 순환 펩타이드를 다루는 도구와 워크플로우에 대한 체계적인 개요.

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FEP+

실험적 방법과 동등한 정확도를 지닌 물리 기반 자유 에너지 섭동 기술을 활용한 단백질-리간드 결합의 전산적 예측.

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일정한 pH 조건 하에서의 단백질 pKa 예측 분자동역학

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FEP+ 잔기 스캐닝을 이용한 영향력 있는 돌연변이 식별

단백질-단백질 상호작용( FEP+ ) 잔기 스캔을 수행하여, 돌연변이가 단백질-단백질 시스템의 결합 부위( 안정성 ) 및 결합 친화도(affinity)에 미치는 영향을 파악합니다.

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단일 점 돌연변이에 대한 열안정성 예측을 위한 단백질 자유 에너지 섭동 모델의 타당성 검증

T4 리소자임의 단일 점 돌연변이에 대한 열안정성 예측치를 얻기 위해 단백질 FEP 시뮬레이션을 준비, 실행 및 분석한다.

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Schrödinger의 대규모 전산 전문 지식과 기술을 활용하여 신약 개발 과정의 주요 단계를 거쳐 프로젝트를 발전시켜 나가십시오.

지원 및 교육

초보자와 숙련된 사용자 모두를 위해 마련된 전문가 지원, 교육 자료 및 교육 리소스를 이용하세요.