FEP+ 생물학적 제제용
신약 개발 위한 고성능 자유 에너지 계산
신약 개발 위한 고성능 자유 에너지 계산
FEP+ 이는 Schrödinger의 독자적인 물리학 기반 자유 에너지 섭동 기술입니다. 생물학적 제제 신약 개발 프로젝트에서 ‘ FEP+ ’를 활용하면, 실험적 방법과 ~1 kcal/mol 이내의 오차 범위에서 일치하는 정확도로 단백질 돌연변이의 영향을 컴퓨터 시뮬레이션을 통해 예측할 수 있습니다.
단백질과 그 표적 간의 결합 친화도를 높이거나 낮추다
단백질이 한 표적에 대해 다른 표적보다 우선적으로 결합하도록 조절하기
여러 표적에 걸친 결합 범위의 확대
두 단백질 간의 pH에 따른 결합 또는 해리를 유도한다
단백질 기반 생물학적 제제의 물리적 특성 안정성 을 개선한다
용해도, 화학적 안정성 및 물리적 특성과 같은 속성을 최적화합니다. 안정성
항체, 항원, 펩타이드, 효소 및 기타 생물학적 제제의 최적화 과정에서 돌연변이가 단백질 안정성 와 단백질-단백질 결합 친화도에 미치는 영향을 정확하게 정량화합니다.
여러 위치에서 발생하는 단일 돌연변이를 동시에 신속하게 모델링하여, 돌연변이 효과에 대한 일관되고 신뢰할 수 있는 예측을 도출하고, FEP+ 계산의 효율성을 획기적으로 향상시킵니다.
당사의 워크플로는 ‘ FEP+ ’의 Residue Scan 및 ‘Protein’ FEP+ 기술을 활용하여, 단백질 돌연변이를 정밀하고 효율적으로 탐색함으로써 안정성, 결합 친화도, 특이성, pH 의존적 결합 및 교차반응성을 동시에 최적화할 수 있도록 합니다.
MM/GBSA, FEP+ 잔기 스캔 및 단백질 FEP+ 계산 결과(y축)와 kcal/mol 단위로 표시된 상대적 실험적 친화도 측정값(x축) 간의 상관관계 그래프입니다. 모든 계산은 동일한 시스템에서 수행되었으며, 현재 FEP+ 잔기 스캔 결과에서는 프롤린으로의 돌연변이 및 프롤린에서 다른 아미노산으로의 돌연변이가 제외되어 있습니다. 각 그래프의 왼쪽 상단에는 피어슨 상관계수(R²)가 표시되어 있습니다.
Sampson 외. J Mol Biol. 2024, 436, 16.
Scarabelli G 외. J Mol Biol. 2022, 434, 2.
Katz D 외. Mar. Drugs 2021, 19(7), 367.
Haufe Y 외. ACS Chem Neurosci. 2023, 14, 24, 4311–4322.
FEP+ 를 처음 사용하시는 분이라면, 상대 결합 자유 에너지 섭동(FEP) 계산의 기본 개념을 다시 한 번 복습해 보시기 바랍니다.
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