FEP+ 用于生物制品
针对……的高性能自由能计算生物制剂发现
借助……，更快地设计出更优质的蛋白质FEP+
FEP+ 这是Schrödinger的专有技术，基于物理理论 自由能微扰 。在您的生物制剂发现 项目中使用FEP+ ，可通过计算预测蛋白质突变的影响，其准确度与实验方法相当，误差在~1 kcal/mol以内。
通过 尽早剔除无关的突变，并快速产生新思路和后续设计方案，将获得结果所需的时间从数月缩短至数周
与传统的定向进化湿实验室方案相比， 优化 通过减少循环次数和检测的变异体数量，降低了成本
通过对多个参数进行同步优化 ，筛选出更优质的候选方案，从而加快创意的测试和筛选进程
主要应用领域
亲和力 工程学
增强或减弱蛋白质与其靶标之间的结合亲和力 靶点
选择性 工程学
调整一种蛋白质对靶点 中某一亚型的优先结合，而非另一亚型
交叉反应工程
扩展针对多个靶点的结合范围
pH依赖性结合
设计两种蛋白质之间pH依赖性的结合或解离
稳定性工程
提高基于蛋白质的生物制剂的物理稳定性
可开发性评估
优化溶解度、化学稳定性和物理稳定性等性质
充分利用Schrödinger久经考验的蛋白质工程 技术
蛋白质FEP+
在抗体、抗原、肽、酶及其他生物制品的优化 过程中，准确量化突变对蛋白质稳定性及蛋白质-蛋白质结合亲和力的影响。
FEP+ 残留物扫描
快速对多个位点上的单点突变进行同时建模，从而对突变效应进行一致且可靠的预测，并显著提高FEP+ 计算的效率。
Schrödinger的可自定义蛋白质工程 工作流
我们的工作流程利用FEP+ 的残基扫描和蛋白质FEP+ 技术，能够对蛋白质突变进行精准、高效的探索，从而同时优化稳定性、结合能力亲和力 、特异性 、pH依赖性结合以及交叉反应性。
FEP+ Residue Scan 的准确度比 MM/GBSA 提高了 7 倍，速度比 Protein 快了多达 20 倍。FEP+
MM/GBSA、FEP+ 残基扫描以及蛋白质FEP+ 计算结果（y轴）与相对实验亲和力 测量值（x轴）之间的相关性图，单位为kcal/mol。所有计算均在同一系统上进行，目前FEP+ 残基扫描结果中排除了与脯氨酸相关的突变。每个图的左上角显示了皮尔逊相关系数（R²）。
出版物
α-锥蚈毒素LvIA第11位点的基本氨基酸残基通过静电作用机制，影响α3β2型和α3β4型烟碱受体之间的选择性 亚型。
Haufe Y 等。《ACS Chem Neurosci》2023 年，第 14 卷，第 24 期，第 4311–4322 页。
什么是自由能微扰 （FEP）？
如果您是初次使用FEP+ ，请重新温习一下相对结合力（自由能微扰 ，FEP）计算的基本概念。
文档与教程
了解常见问题的解答，并掌握使用Schrödinger软件的最佳实践。