MS CG

장시간 척도에서 대규모 시스템을 대상으로 한 효율적인 컴퓨터 그래픽( coarse-grained , CG) 및 분자 동역학( 분자동역학 , MD) 시뮬레이션

복잡한 시스템을 규명하기 위한 대규모 구조적 평형 및 진화 모델링

phase 분리 및 액체 구조화 등 제형 및 화학 개발에 중요한 현상은, 전원자(AA) 분자동역학 시뮬레이션으로는 파악하기 어려운 시간 및 길이 규모에서 발생할 수 있다.

MS CG(재료과학 Coarse-Grained 모델링)는 AA 모델보다 더 긴 기간에 걸쳐 대규모 벌크 시스템의 분자동역학 시뮬레이션을 수행하기 위해 고안되었습니다. MS CG는 coarse-grained 분자를 그리며 , 전원자 구조에서 coarse-grained 구조로 자동 매핑할 수 있는 인프라를 제공할 뿐만 아니라 , coarse-grained 힘장을 적합시키고 할당할수 있는 기능을 갖추고 있습니다. 또한, MS CG는 진화한 coarse-grained 시스템을 AA 표현으로 역매핑하여, coarse-grained 진화 효율성과 AA 특성 분석의 상세한 정확성을 결합함으로써 모델링 루프를 완성합니다.

주요 역량

유연하고 직관적인 워크플로를 통해 관심 있는 대규모 시스템을 손쉽게 구축할 수 있습니다.

분자 구조를 CG로 직접 스케치하기
MARTINI 나 소산 입자 역학(DPD)을 위해, 또는 사용자 지정에 따라 모든 원자 분자를 CG 모델에 자동으로 매핑합니다 .
CG 폴리머를 효율적으로 합성하기
대량 시스템 내 분자의 가교 결합
비드당 10여 개의 원자로 구성된 간단한 모델부터 비드당 2~10개의 원자로 구성된 더 세밀한 모델에 이르기까지 다양한 수준의 모델을 제공하십시오.
다양한 빌더를 활용하여 CG 분자로 복잡한 구조물을 구축합니다.

분자동역학 시뮬레이션 속도 향상하기

대개 원자 수준에 가까운 정밀도로 더 빠른 시뮬레이션을 수행할 수 있습니다
일반적인 원자 수준 시뮬레이션 시간을 넘어서는 대규모 분자 집단의 거동을 연구한다

상세한 분석을 위해 원자 시스템으로 되돌리기

coarse-grained 시뮬레이션이 선행 시스템을 신속하게 진화시키는 효율성과 특성 분석을 위한 원자 모델의 정확성이 결합되었습니다.

고급 구조 특성 분석 수행: 구조와 그 변화를 이해하기 위해 고안된 다양한 도구를 활용하여 ‘ coarse-grained ’ 시뮬레이션에서 통찰력을 도출합니다.

기하학적 특징을 신속하게 측정할 수 있는 기능을 갖춘 CG 궤적 보기
응집 분석
방사형 분포 함수
밀도 분포
자유 부피 분석
막 지질 경사도 분석

시스템의 주요 특성을 예측한다

열물리적, 기계적 및 확산 특성을 예측하기 위한 고급 워크플로우를 활용하세요

널리 사용되는 coarse-grained 힘장 모델에 대한 유연한 지원과 즉시 사용 가능한 자동화 기능을 활용하세요.

AA-CG 자동 매핑 및 CG 매개변수화를 지원하는 DPD
MARTINI 특수 화학물질 및 폴리머를 위한 자동 AA-CG 매핑 및 CG 매개변수화를 지원하는 2.x 비극성화 가능 힘장
쿨롱 상호작용을 포함한 일반화된 레나드-존스 포텐셜

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