MS CG
大規模系における長時間スケールでの効率的な粗視化(CG)分子動力学(MD)シミュレーション
大規模系における長時間スケールでの効率的な粗視化(CG)分子動力学(MD)シミュレーション
phase の分離や液体の構造化など、製剤開発や化学開発において重要な現象は、全原子(AA)分子動力学シミュレーションでは把握が困難な時間スケールや長さスケールで発生することがある。
MS CG(Materials Science Coarse-Grained Modeling)は、AAモデルよりも長期間にわたる、より大規模なバルク系の分子動力学シミュレーションを目的としています。MS CGは、粗視化分子を描画し、全原子構造から粗視化構造へのマッピングを自動的に行うためのインフラストラクチャを提供するほか、粗視化力場のフィッティングや割り当ても行います。 さらに、MS CG では、進化した粗視化系を全原子表現へと逆マッピングすることが可能であり、これによりモデリングのループを閉じて、粗視化による進化の効率性と、全原子による特性評価の詳細な精度を両立させることができます。
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