MS CG简体中文（大陆）
针对大型系统在长时间尺度上的高效粗粒化（CG）分子动力学（分子动力学 (MD) , MD）模拟
- 直接绘制CG分子
- 自动将全原子分子映射到 MARTINI 或耗散粒子动力学（DPD）的CG模型上，或根据用户指定进行映射
- 高效构建CG聚合物
- 体相体系中的交联分子
- 提供不同层次的模型，从每个珠子包含数十个原子的简单模型，到每个珠子包含2至10个原子的更精细模型
- 利用一套多样化的构建模块，通过CG分子构建复杂结构
通过建模大规模结构平衡与演化来表征复杂系统
对于配方和化学开发而言，诸如phase 分离和液体取向等关键现象，可能发生在全原子（AA）模拟难以覆盖的时间和长度尺度上分子动力学 (MD) 模拟 。
MS CG（材料科学粗粒化建模）旨在用于分子动力学 (MD) 对较大体积体系的模拟，其模拟时间跨度比全原子（AA）模型更长。MS CG提供了一套基础设施，用于绘制粗粒化分子，自动将全原子结构映射到粗粒化结构，以及拟合和分配粗粒化力场。 此外，MS CG 还支持将演化后的粗粒化系统反向映射回其全原子表示形式，从而闭合建模循环，将粗粒化演化的效率与全原子表征的精细精度相结合。
核心能力
借助灵活、直观的工作流程，轻松构建您感兴趣的大型系统
提升您的分子动力学 (MD) 模拟 访问速度
- 实现更快的仿真，且通常能达到接近原子级别的细节
- 研究大规模分子集合体的行为，其时间尺度超出了典型的原子级模拟 时间尺度
映射回原子系统以进行详细分析
- 将粗粒化模拟在快速演化初始系统方面的效率，与原子模型在表征方面的精度相结合
进行高级结构表征：利用一系列旨在理解结构及其演化的工具，从粗粒度模拟中提取有价值的见解
- 支持快速测量几何特征的CG轨迹查看功能
- 聚类分析
- 径向分布函数
- 密度分布曲线
- 自由体积分析
- 膜脂质倾斜度分析
预测系统的关键性质
- 使用先进的工作流程来预测热物理、力学和扩散性能
借助灵活的支持和开箱即用的自动化功能，充分利用广泛使用的粗粒度力场
- 支持自动将AA映射到CG以及CG参数化的DPD
- MARTINI 2.x 非极化力场，支持针对特种化学品和聚合物的自动氨基酸到碳基映射以及碳基参数化
- 具有库仑相互作用的广义伦纳德-琼斯势
案例研究与网络研讨会
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文档与教程
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出版物
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