摘要：

全球范围内抗菌药物耐药性的上升，再次引发了人们对鼠疫杆菌（Yersinia pestis）等卷土重来的病原体的担忧。鼠疫耶尔森菌（Y.pestis）的一个关键致病因子是III型分泌系统（T3SS），该系统能够将效应蛋白直接注入宿主细胞。负责转运的针状结构由YscF蛋白聚合形成，但其完整的寡聚体结构以及功能破坏性突变的影响仍知之甚少。

在本研究中，我们利用AlphaFold 3对YscF蛋白中关键突变体的寡聚体组装进行了建模。此前体外研究发现，所分析的突变体对针状结构的形成及其调控具有显著影响。这些突变体包括单点突变、R73A双点突变、D28A/D46A突变以及多点突变体。 具体而言，包括恒定分泌（CS）突变体（I13A、D17A、D28A、D46A）和非分泌（NS）突变体（N31A、V34A、D77A、I82A）。 构建了21亚基和24亚基寡聚体的模型，并利用PyMOL 及定量结构分析进行了评估。通过螺旋对齐、亚基间距和界面接触面积进行的比较评估表明，R73A和D28A/D46A突变体保留了伸长性和对称性，这与功能性分泌一致。 相比之下，CS和NS突变体形成了结构紧凑或畸变的组装体，这与异常的分泌表型相关。

这些数据揭示了T3SS组装的结构基础，并强调了特定的氨基酸替换如何会破坏高阶寡聚化。这项研究不仅加深了我们对分泌系统结构机制的理解，还证明了深度学习模型在预测复杂大分子行为方面的实用性，为未来的结构研究提供了支持。

演讲者：

斯蒂芬妮·贝利多，新东南大学

斯蒂芬妮·贝利多、卢卡·瓦尔盖斯和德夫·帕特尔是诺瓦东南大学的本科生，他们将就“基于深度学习的YscF突变体结构建模”进行报告。