摘要：

由于针对鼠疫耶尔森菌（即引发被称为“黑死病”的鼠疫疫情的病原体）的获批抗生素数量有限，发现针对该细菌必需酶的小分子抑制剂至关重要。其中一种酶是酮酰-酰基载体蛋白还原酶（FabG），它在维持细菌细胞包膜完整性的脂肪酸生物合成过程中起着关键作用。 本研究整合了计算和生化方法，以筛选潜在的FabG抑制剂。研究中既采用了靶点 蛋白的X射线晶体结构（PDB ID：5CEJ），也结合了通过ChimeraX和AlphaFold生成的人工预测模型。利用这两种结构，我们得以评估计算模型在药物发现中的实用性和准确性，特别是在未来缺乏实验结构的情况下。 5CEJ结构中缺乏天然底物，因此我们使用来自Bacillussp. FabG（PDB ID：4NBU）的配体乙酰乙酰辅酶A（CAA）对其进行了比对。在分子对接 （GOLD，CCDC）验证中，使用了来自LipPrep（Schrödinger ）的能量最小化配体对照库。 验证完成后，对化合物库进行了结合筛选亲和力 ，同时针对实验结构和预测结构进行了测试。GOLD评分在5CEJ模型中为60–102，在AlphaFold模型中为40–80。分子对接 的结果通过PyMOL （Schrödinger ）进行了可视化展示。利用标准生化技术，成功克隆、表达并纯化了FabG。后续工作将侧重于酶学检测，以评估得分最高的化合物是否能在体外抑制FabG的活性。

演讲者：

卡塔利娜·科林，德克萨斯大学奥斯汀分校

卡塔利娜·科林（Catalina Colling）将于2025年从德克萨斯大学奥斯汀分校毕业，并获得生物学理学与文学学士学位。她的独立研究项目专注于早期药物发现，通过将计算筛选 与生化验证相结合，更高效地识别靶点 蛋白的潜在抑制剂。