JUN 5, 2025

“教育工作者月”：强大的计算工具，帮助学生生动地了解蛋白质

在本次演讲中，亚瑟·西科拉将通过两个实例，展示技术如何让生物化学在学生眼中“活”起来。演讲将特别侧重于分享资源和推广课程体系，以支持学生开展计算机模拟学习。

迄今为止，我职业生涯中的亮点之一，就是参与开发并教授一门名为“生物化学真实科学探究实验室”（BASIL）的基于课程的本科生研究体验（CURE）项目。BASIL CURE项目采用计算与湿实验室相结合的方法，研究功能未知的蛋白质结构。 学生们在完成学位必修课程的过程中体验科研，对许多人而言，这可能是他们首次也是唯一一次科研经历。他们利用强大的计算工具寻找同源蛋白，并预测潜在的酶底物，随后通过分子分子对接 对预测结果进行优化。结合湿实验室实验，学生们致力于阐明酶的功能。该课程大纲可在basilbiochem.org上免费获取，我们可为新采用者提供两种支持方式：通过虚拟会议进行的同步支持，以及通过Slack进行的异步支持。

我很幸运，还能在我们的荣誉学院开设一门以蛋白质建模为核心的课程。这门课程围绕一个分子故事展开，学生们通过虚拟和3D打印的分子模型进行探索。每年，学生们都会发现并运用创新的生物信息学工具来丰富他们的分子故事。从肽模拟分子对接 到AlphaFold结构预测 ，在这个过程中，我总能学到新知识。 我将阐述引导学生进入创意空间的策略，让他们能够自由主导项目，并展示近年来几个特别独特且影响深远的项目案例。