
JUN 12, 2025
将L型钙通道阻滞剂转用于呼吸道病毒治疗:一种计算建模方法
摘要:
呼吸道病毒(如人类鼻病毒(HRV)、流感病毒和呼吸道合胞病毒(RSV))是导致全球疾病的主要原因,尤其对脆弱人群影响显著。尽管这些病毒对发病率和死亡率影响重大,但抗病毒治疗方案仍然有限,且耐药病毒株不断涌现。 研究表明,通常用于治疗心血管疾病的L型钙通道阻滞剂(CCBs)可能通过扰乱钙离子稳态来抑制病毒复制,而钙离子稳态是病毒复制周期中的关键过程。本本科毕业论文通过基于结构的虚拟筛选 (SBVS),探讨了CCBs(特别是氨氯地平及其衍生物——“AMP”化合物)作为抗病毒药物的转用潜力。
初步的phase (2024年1月至11月)专注于HRV-16,利用Schrödinger 软件针对VP1衣壳蛋白(PDB:1ND3)进行研究。基于已知的HRV抑制剂普莱科纳里尔(pleconaril),构建了受体网格。CCBs和AMP化合物在对接实验中获得的分数与普莱科纳里尔相当,并筛选出7个顶级候选化合物,可用于潜在的药物研发。
基于这些发现,第二届phase (2025年春季)将筛选 扩展至流感病毒的神经氨酸酶(NA)蛋白(PDB:2HT7、4KS5)以及RSV的融合(F)蛋白(PDB:6VKD、7KQD)。 AMP化合物在NA活性位点上的对接评分高于已知的活性配体,且在2HT7网格中,分子对接 评分与体外抑制率呈显著相关性(p=0.0011)。QSAR分析预测了AMP化合物良好的类药性 。 通过在2HT7网格上使用活性化合物和DUD-E生成的诱饵来评估富集性能,结果表明活性化合物与诱饵之间具有适度的区分能力(ROC AUC=0.61),且早期富集能力有限(RIE=0.54)。分子对接 与RSV F蛋白模型的对接结果未显示与生物活性存在显著相关性,然而,AMP配体的对接分数却可与已知活性配体相媲美。
该研究突显了将L型钙通道阻滞剂(CCBs)转为广谱抗病毒药物的潜力。这些发现支持了一种新型抗病毒策略,即利用现有的药物骨架来填补呼吸道病毒治疗领域的关键空白。
演讲者:
艾登·T·戴,缅因州圣约瑟夫学院
艾登·T·戴(Aiden T. Day)刚刚从缅因州圣约瑟夫学院毕业,获得医学生物学/预科医学理学学士学位,辅修化学。他是一名有志于成为外科医生兼科学家的青年,致力于通过转化研究推动患者护理的发展。他的学术和研究背景涵盖药物化学、公共卫生和神经外科等领域。