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QSite

一款高性能的QM/MM程序

QSite

概述

QSite 是一款基于多尺度 模拟 的工具,采用 QM/MM 方法,该方法融合了量子力学(QM) 和分子力学(MM) 的原理。它旨在通过对原子进行量子化学处理,准确预测反应体系的分子构型、能量及电子结构,从而为反应化学提供关键见解,这对理解存在分子间相互作用时的化学转化至关重要。QSite 同样适用于描述非反应性化学体系。

核心能力

高性能

该程序之所以优于其他质量管理(QM)/物料管理(MM)程序,是因为它采用了Jaguar ,该软件在质量管理计算领域长期以来被公认为业界翘楚。

先进技术

为量子力学(QM)与分子力学(MM)的接口提供了一种创新方法,专门针对蛋白质体系以及QM区域与MM区域之间的相互作用。

过渡金属的收敛性

得益于Jaguar的先进功能,该方法在金属蛋白研究中实现了极高的精度;它能够可靠且高效地收敛到含过渡金属体系的正确基态。

波函数的选择

提供了不同层次的理论模型来评估QM区域:哈特里-福克(Hartree Fock)、DFT 以及局部MP2。这使用户能够在计算成本与精度之间找到最佳平衡。

高级计算设置与分析

自动应用特殊的界面参数,使计算设置变得简单。计算结果(如分子轨道和电子密度)可在Maestro 中进行可视化展示。

文档与教程

了解常见问题的解答,并掌握使用Schrödinger软件的最佳实践。

材料科学 文献资料

QSite

一款基于多尺度 的模拟 工具,该工具采用QM/MM方法,该方法融合了量子力学(QM) 和分子力学(MM) 中的原理。

生命科学 文档

QSite

一款基于多尺度 的模拟 工具,该工具采用QM/MM方法,该方法融合了量子力学(QM) 和分子力学(MM) 中的原理。

生命科学 教程

在 QSite 中定义 QM 和 MM 区域

为 QSite 计算定义应采用 QM 和 MM 方法处理的区域。

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出版物

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培训与资源

在线认证课程

通过分子建模 的实践性在线课程,提升您的技能水平。这些可自主安排学习进度的课程涵盖了广泛的科学主题,并提供Schrödinger 软件的使用权限及技术支持。

教程

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