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SEP 11, 2024

利用自动化计算光谱预测对小分子药物样物质进行表征

摘要:

确定类药物分子和天然产物的立体构型,在药物发现过程中至关重要。由于手性会影响结合亲和力 、临床疗效和安全性,因此在药物开发过程中做出明智的决策,先导化合物 有助于节省时间和成本。

在本场网络研讨会中,我们将介绍“Jaguar 光谱学”——这是一种自动化的计算工作流,旨在无需对小分子进行结晶或使用X射线光谱学,即可预测其玻尔兹曼平均光谱。该工作流将MacroModel构象 搜索与基于Jaguar 的DFT 计算相结合,支持VCD/IR、ECD/UV-vis和NMR光谱预测。 该工作流可对 1H、13C、15N、19F 和 31P 等同位素进行 NMR 预测,还能模拟部分氘代化合物的光谱。在本报告中,我们将通过实例演示如何利用Jaguar Spectroscopy 处理涉及柔性类药物分子的典型建模场景。

网络研讨会亮点:

  • 计算VCD、ECD和NMR光谱预测简介
  • Jaguar 光谱学简介
  • 用户可用的计算设置概述——溶剂的选择与处理(通过显式或隐式溶剂化模型)、构象 采样、量子化学理论水平,以及理论光谱与实验光谱的自动比较
  • Jaguar 光谱法在涉及柔性类药物分子的典型建模场景中的应用

我们的演讲嘉宾

阿特·博切瓦罗夫

研究负责人,Schrödinger

阿特·博切瓦罗夫(Art Bochevarov)在乌克兰长大,并在佐治亚理工学院获得理论化学博士学位,导师为大卫·谢里尔(David Sherrill)。毕业后,阿特在哥伦比亚大学担任博士后研究员,师从理查德·弗里斯纳(Richard Friesner)。在此期间,阿特为量子化学代码Jaguar 做出了贡献,并在数年后加入位于纽约市的Schrödinger 公司后,开始负责该代码的管理工作。 在Schrödinger 公司,阿特过去14年来一直致力于量子化学代码的开发与应用。阿特的研究兴趣在于对质子化与溶剂化效应、共价反应性、光谱学以及量子化学工作流自动化的量子化学研究。在最近的研究项目中,他一直在探究构象 效应对计算得到的振动圆二色性(VCD)和核磁共振(NMR)光谱的影响。