
计算药物设计与化学信息学:安特卫普大学的一门实践课程
安特卫普大学是比利时荷兰语区第三大高校,每年招收学生超过20,000名。在生物化学与生物技术专业课程中,学生可选修一门关于计算药物设计与化学信息学的3学分(ECTS)课程。该课程采用模块化教学模式,内容涵盖理论与实践两个方面。
在理论课程中,学生将学习化学信息学和虚拟筛选 ,其中包括化学指纹、分子相似性、聚类、机器学习(ML) 模型以及虚拟筛选 性能指标等概念。本课程还涵盖分子分子对接 和药效团搜索。随后,学生将通过一系列实践课程,将理论课程中所学到的概念付诸实践。
在化学信息学任务中,学生使用搭载 RDKit 作为化学信息学工具包的 Google Colab;而在药效团和分子对接 相关方面,则使用Maestro 、Phase 以及Glide 。这些工具通过“Schrödinger教学”网络虚拟工作站提供,使学生能够随时随地访问。 最后,借助校内自主研发的虚拟现实系统,学生可以直观地研究配体与蛋白质之间的非键相互作用。
课程开始时,将根据本院正在进行的研究项目确定一个药物设计课题。该课题的目标是筛选出少量(5-10种)市售化合物,随后购入这些化合物并对其抑制特性进行生化表征。学生需提交一份书面报告作为课程结业成果,该报告将作为期末口试的基础。
我们的演讲嘉宾

汉斯·德·温特教授
安特卫普大学教授
汉斯·德·温特(Hans De Winter)在工业界拥有丰富的从业经验,先后担任过比利时贝尔塞市强生公司(Johnson & Johnson)的高级科学家,以及Silicos NV公司的联合创始人兼首席科学官(CSO),随后于2013年被任命为安特卫普大学(比利时)计算药物设计教授。 他拥有比利时鲁汶大学的博士学位,并在澳大利亚维多利亚药学院和比利时鲁汶的雷加研究所完成了博士后研究,随后开始在制药行业从事科研工作。 尽管在20多年的职业生涯中积累了丰富的工业背景,但他仍发表了60余篇科学论文,并作为发明人名列8项已授权专利中。汉斯的研究兴趣主要集中在计算药物化学和化学信息学领域。