Schrödinger の全世界のオフィスは、社員全員が休息を取り、リフレッシュするための全社的な取り組みの一環として、8月17日から21日までの1週間、休業いたします。この期間中は、お問い合わせへの対応が制限される場合がございますので、あらかじめご了承ください。科学・技術サポートチームのメンバーは、緊急のサポート案件への対応のみ行います。

計算機支援創薬とケモインフォマティクス:アントワープ大学での実践コース

アントワープ大学は、ベルギーのオランダ語圏において3番目に大きな大学であり、年間2万人以上の学生が在籍しています。生化学・バイオテクノロジーのカリキュラムでは、学生は計算機支援創薬およびケモインフォマティクスに関する3 ECTSの科目を選択することができます。この科目はモジュール形式で構成されており、理論と実践の両方のセッションが含まれています。

理論講義では、学生はケモインフォマティクスやバーチャルスクリーニングについて学びます。これには、化学フィンガープリント、分子の類似性、クラスタリング、機械学習モデル、バーチャルスクリーニングの性能評価指標といった概念が含まれます。また、本コースでは分子ドッキングやファーマコフォア検索についても扱います。理論講義で学んだ概念は、その後、一連の実習を通じて実践的に応用されます。

ケモインフォマティクスの課題では、学生たちはGoogle Colabと、ケモインフォマティクス用ツールキットとしてRDKitを使用しています。一方、ファーマコフォアやドッキングに関連する課題では、Maestro 、Phase 、およびGlide を利用しています。これらのツールは、「Teaching withSchrödinger」というWebベースの仮想ワークステーションを通じて提供されており、学生はいつでもどこからでもアクセスすることができます。 最後に、独自開発のバーチャルリアリティシステムを活用することで、学生はリガンド とタンパク質との間の非結合相互作用をグラフィカルに学習することができます。

コースの開始時に、本学部の進行中の研究プログラムに基づき、創薬プロジェクトが策定されます。このプロジェクトの目的は、市販されている化合物(5~10種)を同定 し、それらを購入した上で、その阻害特性について生化学的に解析することです。学生は、プログラムの修了時に報告書を提出し、これが最終的な口頭試験の基礎となります。

講演者

ハンス・デ・ウィンター教授

アントワープ大学 教授

ハンス・デ・ウィンター氏は、産業界で長年にわたりキャリアを積んだ後、2013年にアントワープ大学(ベルギー)の計算機支援創薬設計の教授に就任しました。産業界では、まずベルギーのビールセにあるジョンソン・エンド・ジョンソンで上級研究員を務め、その後、Silicos NVの共同創業者兼最高科学責任者(CSO)を務めました。 彼はルーヴェン大学(ベルギー)で博士号を取得し、製薬業界で科学者としてのキャリアをスタートさせる前に、ビクトリア薬科大学(オーストラリア)およびルーヴェンのレガ研究所(ベルギー)でポスドク研究員として研究に従事した。 20年以上にわたる豊富な産業界での経歴を持つ一方で、60件以上の科学論文を発表しており、8件の特許の発明者として名を連ねています。ハンスの研究関心は、主に計算薬理化学およびケミインフォマティクスの分野にあります。