为GPCR激动剂亲和力 构建稳定且精确的FEP模型
自由能微扰 (FEP) 已成为结合位点（亲和力 ）预测的金标准，而靶点 技术在结构导向药物设计中对该基于物理理论 方法的应用支持具有极高的价值。G蛋白偶联受体（GPCRs）作为约35%已获批药物的靶点 ，在FEP模拟中属于复杂的系统。 这些受体丰富的构象 空间，以及许多冷冻电镜结构中缺乏结构水，只是导致GPCR的FEP模拟复杂化并产生高度敏感模型的几个因素。此外，建模激动剂作用需要经济高效的解决方案，以纳入G蛋白的影响，同时避免导致计算成本过高的模拟。
在本期网络研讨会中，隆德贝克公司（Lundbeck）的研究科学家费兰·普拉纳斯（Ferran Planas）博士将探讨其团队如何常规使用FEP+ 来预测GPCR激动剂的结合亲和力。他将介绍该团队如何构建了一个稳定的系统，这一过程需要结合细致的手工操作、使用Schrödinger 工具以及应用文献中的解决方案。隆德贝克公司的这项工作凸显了GPCR激动作用建模面临的挑战，但也证明了即使在资源有限的情况下，仍可构建出稳定的FEP+ 模型。
网络研讨会亮点
- 关于实现复杂系统基于结构的设计所面临的挑战概述
- 案例研究：隆德贝克公司应用FEP+ 预测GPCR激动剂的结合亲和力
适合哪些人参加
- 科学家们正致力于在复杂系统中实现基于结构的设计
- 科学家们正在寻找策略，以最大限度地利用其FEP+ 资源
我们的演讲嘉宾
费兰·普拉纳斯
隆德贝克公司分子建模与结构生物学领域研究科学家
费兰·普拉纳斯（Ferran Planas）是丹麦伦德贝克公司（Lundbeck）的一名研究科学家。他拥有斯德哥尔摩大学有机化学博士学位，其研究主要聚焦于蛋白质的分子建模 。攻读博士期间，他利用DFT 研究了ThDP依赖性酶的反应机理。完成博士论文后，他前往丹麦，在丹麦技术大学（DTU）担任博士后研究员。 2022年，他加入了伦德贝克公司（Lundbeck）的药物发现与开发（分子建模 ）及结构生物学团队，负责支持从早期到晚期的临床前研发管线工作。费兰的职业生涯始终以跨学科研究为驱动力，他为推动药物化学家开展分子建模 研究做出了重要贡献。
史蒂文·杰罗姆
生命科学软件执行总监，Schrödinger
Schrödinger 生命科学软件执行总监史蒂文·杰罗姆（Steven Jerome）在理查德·弗里斯纳（Richard Friesner）的指导下，于哥伦比亚大学获得化学博士学位。在哥伦比亚大学求学期间，他为分子分子对接 和蛋白质结构优化 相关工具的开发做出了贡献。完成博士学业后，他加入Schrödinger ，担任Glide 团队的科学开发人员。 多年来，他在公司内历任多个职位，现任执行董事。作为苗头化合物 Discovery的科学先导化合物 ，他负责监督小分子苗头化合物 识别领域前沿计算工具组合的开发。此外，他还领导欧盟+应用科学团队，为Schrödinger在欧洲的商业客户指导先进的科学支持 。