GPCRに対するアゴニストの親和性を評価するための、安定かつ正確なFEPモデルの構築
自由エネルギー摂動法（FEP）は、結合親和性の予測におけるゴールドスタンダードとなっており、ターゲット イネーブルメント この物理学に基づくアプローチの活用は、構造 に基づく創薬において強く望まれている。承認済み医薬品の約35％のターゲット であるGタンパク質共役受容体（GPCR）は、FEPシミュレーションにおいて複雑な系を形成している。 これらの受容体の豊富なコンフォメーション空間や、多くの低温電子顕微鏡（cryo-EM）構造における構造水の欠如は、GPCRのFEPイネーブルメント を複雑にし、非常に感度の高いモデルを生み出す要因のほんの一部に過ぎない。さらに、アゴニズムのモデリングには、計算上実行不可能なシミュレーションを招くことなく、Gタンパク質の影響を取り入れるための費用対効果の高い解決策が求められる。
本ウェビナーでは、ルンドベック社の研究員であるフェラン・プラナス博士が、自身のチームがGPCRアゴニストの結合親和性を予測するために、FEP+ を日常的にどのように活用していたかについて解説します。また、入念な手作業、Schrödinger ツールの活用、および文献に示された手法の応用を組み合わせることで、安定したシステムを構築した経緯についても説明します。ルンドベック社でのこの取り組みは、GPCRアゴニズムのモデリングにおける課題を浮き彫りにする一方で、限られたリソースであっても安定したFEP+ モデルを構築することが可能であることを実証しています。
ウェビナーの見どころ
- 複雑なシステムにおける構造 を活用した設計の実現に伴う課題の概要
- 事例研究：GPCRアゴニストの結合親和性を予測するための、ルンドベック社によるFEP+ の活用
参加対象者
- 科学者たちは、複雑なシステムにおいて構造 を基盤とした設計を実現することを目指している
- FEP+ のリソースを最大限に活用する方法を模索している科学者たち
登壇者
フェラン・プラナス
ルンドベック社 分子モデリング・構造生物学部門 研究員
フェラン・プラナス氏は、デンマークのルンドベック社に所属する研究員です。ストックホルム大学で有機化学の博士号を取得しており、その研究はタンパク質の分子モデリングに焦点を当ててきました。博士課程在籍中は、DFT を用いて、ThDP依存性酵素の反応メカニズムを調査しました。博士論文を完成させた後、デンマーク工科大学（DTU）のポスドク研究員としてデンマークに移りました。 2022年、彼はルンドベック社の分子モデリング・構造生物学チームに加わり、前臨床パイプラインの初期段階から後期段階に至るまでの活動を支援している。フェランのキャリアは学際的な研究によって支えられており、医薬品化学者による分子モデリングの実現に貢献してきた。
スティーブン・ジェローム
ライフサイエンス・ソフトウェア部門 執行役員、Schrödinger
Schrödinger のライフサイエンスソフトウェア担当エグゼクティブディレクターであるスティーブン・ジェローム氏は、リチャード・フライズナー氏の指導の下、コロンビア大学で化学の博士号を取得しました。コロンビア大学在学中、分子ドッキングおよびタンパク質構造 の精製のためのツールの開発に貢献しました。 博士課程修了後、Schrödinger 社に入社し、Glide チームの科学開発者として勤務しました。長年にわたり社内でいくつかの役職を歴任し、現在はエグゼクティブ・ディレクターを務めています。現在の役職であるヒット発見部門のサイエンティフィック・リードとして、低分子ヒットの同定に向けた最先端の計算ツール群の開発を統括しています。さらに、EU+アプリケーション・サイエンス・チームを率い、欧州全域のSchrödingerの商用顧客に対する高度な科学的サポートを指揮しています。