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Schrödinger 数字药物研发研讨会 21:
基于MD模拟的化合物膜透过性预测

化合物的膜透过性是药物研发中的重要指标之一,人们殷切期待能够建立有助于提高其预测精度并阐明其作用机制的计算技术。在此背景下,近年来,以分子动力学(MD)计算为基础的各种计算方法备受关注。

关于决定膜通透性的物理机制,通常认为脂质膜的溶解性和扩散性是主要因素,为了处理这些问题,通常采用针对非均匀体系的溶解-扩散模型。

在本研讨会中,我们将介绍作为膜渗透性预测最新分子动力学(MD)方法的以下内容:

  • 一种利用对称化温和元动力学(SWTM)预测溶解性、利用广义朗日班方程预测扩散性的膜透过性评估方法
  • 将上述方法应用于小分子化合物,并通过与膜透过实验(Horizon-LBA)的比较进行了验证,结果显示
  • 通过将SWTM与复制品交换MD相结合,验证了其在宏观环化合物和PROTAC(蛋白降解靶向嵌合体) 化合物等复杂体系中的应用可能性,结果显示

演讲者

施莱丁格股份有限公司 首席科学家
井上 鉴孝