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从头设计 工作流程

集成式 ,一款基于云端的完整设计系统,用于超大规模化学空间 的探索与优化

通过针对苗头化合物 至先导化合物 以及先导化合物 的无偏化学空间 探索,拓展您的化合物设计策略

Schrödinger的从头设计 工作流是一个完全基于云端的集成式 设计系统,专用于超大规模化学空间 的探索与优化。该技术以苗头化合物 分子或先导化合物 系列为起点,通过结合多种化合物枚举策略与先进的级联过滤机制(AutoDesigner),以及基于自由能计算的严格活性评分(Active LearningFEP+ ),识别出符合关键项目标准且可合成实现的分子。

核心能力

显著提高已鉴定分子的合成可行性

通过内置的基于反应的枚举方法,结合先进的过滤机制,排除不需要的和不切实际的化学反应

在具有良好理化性质的空间内高效筛选出具有活性的先导化合物 化合物

通过利用准确的效力预测并结合主动学习

“快速通道”配体优化 与项目成功

通过高效评估多达数十亿个与项目相关的虚拟分子

对大型数据的加速、无缝探索化学空间

从头设计 工作流提供了一种可部署在云端的解决方案,具有高度的灵活性,可根据您项目的独特需求自定义设置和属性空间。

1. 通过项目特定的输入参数控制待探索的化学空间

在基于网页的企业级分子设计与协作平台LiveDesign 中,定义起始分子、待探索的分子部分、所需的理化性质空间,以及其他针对具体项目的筛选条件。

2. 拓展至药物化学家感兴趣的、可通过合成途径探索的空间

利用云原生的多阶段枚举策略,结合基于物理性质、FEP+ 、IP以及分子对接 的先进级联过滤机制,在目标化学空间 内自动执行多轮化合物生成和过滤。

3.利用高精度的计算机模拟结合 亲和力 测定法对候选分子进行评分

利用一个经过充分验证的自动化工作流,该工作流基于项目特定的FEP+ 数据对机器学习(ML) 模型进行训练,从而能够高效地处理多达数百万种化合物,并进行高度精确的FEP+ 计算。

4. 利用协作设计平台对目标分子进行分析和优先级排序

查看得分最高的化合物,并使用LiveDesign 中由FEP+ 训练的机器学习(ML) 模型——该项目团队可借此进行评估、交互式分析优化 以及优先级排序。

出版物

浏览采用Schrödinger 技术、发表在相关应用领域的经同行评审的出版物列表。

生命科学 出版物

SGR-1505的加速计算机辅助发现:一种用于治疗成熟B细胞恶性肿瘤的强效MALT1别构抑制剂

生命科学 出版物

利用自由能计算在药物发现项目中实现全激酶组选择性 :Wee1案例研究

生命科学 出版物

利用基于计算机模拟的药物发现平台发现了一种新型突变体选择性表皮生长因子受体抑制剂

生命科学 出版物

AutoDesigner – Core Design:一种用于化学骨架设计的从头设计 算法:在新型选择性Wee1抑制剂的设计与合成中的应用

生命科学 出版物

利用薛定谔计算平台发现一类新型d-氨基酸氧化酶抑制剂

生命科学 出版物

AutoDesigner:一种用于快速探索大规模化学空间 的从头设计 算法,用于先导化合物 优化 :应用于D-氨基酸氧化酶抑制剂的设计与合成

精选苗头化合物 10个月内成为研发候选药物:快速发现一种新型、强效的MALT1抑制剂

苗头化合物 10个月内成为研发候选药物:快速发现一种新型、强效的MALT1抑制剂

在由Schrödinger的治疗学小组主导的一项近期MALT1药物发现项目中,从头设计 工作流有效提升了团队的设计效率。

查看案例研究

培训与资源

在线认证课程

通过分子建模 的实践性在线课程,提升您的技能水平。这些可自主安排学习进度的课程涵盖了广泛的科学主题,并提供Schrödinger 软件的使用权限及技术支持。

教程

了解如何将Schrödinger 软件的技术和最佳实践应用于您的项目,以确保项目成功。查找培训资源、教程、快速入门指南、视频等内容。