릴리스 노트

저분자 약물 발굴

플랫폼 환경

Maestro 그래픽 사용자 인터페이스

• Bunsen–Maestro 연동: 서로의 인터페이스에서 Maestro 및 Bunsen 을 실행하고 활성 세션을 연결합니다.
• Bunsen-Maestro 통합: 새로운 자동화된 모달 대화상자 처리 기능을 통해 Maestro 에서 실행되는 에이전트 워크플로가 팝업 대화상자로 인해 차단되는 일이 없도록 보장합니다.
• Maestro 에서 LiveDesign 로의 대규모 내보내기 성능: 대용량 데이터셋에 대해 Maestro 에서 LiveDesign 로의 내보내기 성능이 대폭 향상되었으며, 약 75,000개의 화합물을 처리하는 데 소요되는 시간이 약 1시간에서 4분 미만으로 단축되었습니다.
• 구조 계층 에서의 고분자 특성에 따른 잔기 그룹화: 고분자 사슬 내의 비표준 및 변형된 잔기들이 이제 모체 생체고분자 사슬(단백질, DNA 또는 RNA) 내에서 서열 순서대로 그룹화됩니다.
• 시작 화면에 즐겨찾는 프로젝트 및 구조 고정하기: 시작 화면에서 최근 항목에 별표를 표시하면, 세션이 바뀌어도 즐겨찾는 프로젝트와 구조가 상단에 고정되어 표시됩니다.
• UI를 기본 설정으로 재설정: ‘환경 설정’ → ‘일반’에 새로 추가된 “환경 설정 재설정” 섹션에서 “UI를 기본 설정으로 재설정” 기능을 사용하면, 프로젝트 파일이나 과학적 옵션을 변경하지 않고도 창 레이아웃, 도구 모음, 색상, 글꼴 및 사전 설정을 복원할 수 있습니다.
• Coarse-Grained 시스템에서 원자 부분 전하 비활성화: 원자 전하가 관련이 없는 Coarse-Grained (CG) 모델의 경우, Maestro 에서 원자 부분 전하 옵션을 비활성화합니다.
• 2D 뷰어 설정 및 수소 제어 기능 분리: 전역 환경 설정과 별도로 2D 뷰어의 톱니바퀴 메뉴에 전용 “2D 설정…” 옵션(세션 간에 유지됨)을 추가하고, “모든 수소 표시” 토글 기능을 추가했습니다.
• 2D 구조 기본 설정의 적용 범위 명확화: ‘기본 설정’ → ‘2D 구조’에서는 프로젝트 테이블과 2D 오버레이 전반에 걸친 적용 범위를 명시적으로 지정하고, 리간드 탐지 설정으로 이동하는 바로가기를 제공하며, 2D 오버레이가 이러한 기본 설정을 따르도록 보장합니다.

인프라

• Apple Silicon 네이티브 지원 (macOS ARM64): macOS에서 전체 제품군에 걸쳐 x86_64 변환을 네이티브 ARM64 바이너리로 대체하여, Rosetta 2 없이도 Maestro 및 통합 백엔드가 Apple Silicon에서 네이티브로 실행될 수 있도록 했습니다.

표적 검증 및 구조 구현

단백질 정제

• 수소/결합 순서 지정 설정을 더 쉽게 사용자 정의할 수 있음
• 단백질 정제 과정에서 상호작용성 말단 봉합을 허용합니다
• 이제 입력 구조에서 누락된 터미널 산소 원자는 재구성될 수 있습니다.

예측 독성 패널

• 핵 호르몬 수용체(프로게스테론) 1개, GPCR(CB1) 1개, 프로테아제(MALT1) 1개 등 총 3개의 새로운 표적이 추가되었습니다.

결합 부위 및 구조 분석

Desmond 분자동역학

• 시뮬레이션 상호작용 다이어그램(SID)에서 뉴클레오티드 기반 수용체(DNA/RNA)에 대한 지원을 추가했습니다.
• POPE-POPG (3:1)용 새로운 막 이중층 템플릿

Desmond 분자동역학

• 수소 질량 재분배(HMR) 조정 기능을 지원하여 시뮬레이션 속도를 최대 약 66%까지 향상시킵니다.
• 이제 System Builder에서 7가지의 새로운 혼합 지질 이중층을 지원합니다.

리간드 준비

리간드 준비 및 형상 생성

• LigPrep 에 고리 창 감지 기능을 추가하여, 결합이 고리를 통과하는 매크로사이클 구조가 반환되지 않도록 했습니다.

실험적 및 양자역학(QM) 기반의 pKa 예측

• 이제 Macro-pKa 계산이 완료된 후, 개선된 HTML 보고서를 확인할 수 있습니다.

Hit Identification & 온라인 상영

Glide

• 생성형 AI 기반 도킹( Glide )을 활용하여 생성형 AI와 물리 기반 도킹을 결합해 수십억 개의 분자를 기존 스크리닝 방식보다 훨씬 짧은 시간 내에 선별함으로써, 다양하고 점수가 높은 후보 물질을 신속하게 발굴할 수 있습니다.

거대고리 화합물

• 매크로사이클 도킹 스크립트가 이제 극저온 전자 현미경(cryo-EM) 밀도 맵에 대한 도킹을 지원합니다.
• 이제 새로운 맵 입력 필드를 통해 ‘Macrocycle Docking’ 패널을 사용하여 리간드를 극저온 전자현미경(cryo-EM) 밀도 맵에 도킹( 도킹 )할 수 있습니다.
• 이제 매크로사이클 도킹 작업의 출력 포즈에는 원래의 입력 리간드 제목이 그대로 유지됩니다.

ABFEP

• 고속 처리 ABFEP 스캔 모드를 통해 구조적으로 다양한 화학형과 새로운 스캐폴드를 최대 5배 더 빠르게 효율적으로 선별할 수 있습니다.
• 이제 용매 계열을 대표하는 구조가 확보되었습니다.
• 선택적으로 대체 수문 모델을 적용할 수 있습니다.

Lead Optimization

리간드 정렬

• Tug Align 2는 이제 ‘ Maestro ’의 ‘Ligand Alignment’ 패널에서 기본 매크로사이클 리간드 정렬 알고리즘으로 사용됩니다.
• ‘리간드 정렬’ 패널에는 이제 매크로사이클의 정렬을 보다 정밀하게 제어할 수 있는 고급 정렬 옵션이 제공됩니다.

RetroSynth

• 업데이트된 RetroSynth 보고서에는 다음 내용이 포함됩니다:
• 개요와 벡터 이미지가 포함된 표지
• 더 빠른 결과 생성 및 더 작은 파일 크기
• 상위 30개 루트뿐만 아니라, 해결된 모든 루트
• RetroSynth를 출시하기 전에 맞춤형 공급업체를 선택하세요
• 새로운 입체화학적 점수 산정 방식은 맞춤형 재고 내 입체화학적 변이를 반영합니다.

FEP+

• 이제 용매 계열을 대표하는 구조가 확보되었습니다.
• 뉴클레오티드 기반 수용체(DNA/RNA)에 대한 지원이 추가되었습니다.

단백질 FEP

• 용매 계열의 대표적인 구조가 이제 이용 가능합니다.
• pH에 따른 친화도 예측을 설정하고 분석할 수 있도록 지원하는 새로운 인터페이스
• FEP+ ‘잔기 스캐닝’ 기능이 이제 비표준 아미노산을 포함한 단백질 돌연변이를 대규모로 지원합니다.

용해도 FEP

• 수화 단계의 대표적인 구조가 이제 공개되었습니다.

FEP+ 프로토콜 빌더

• 뉴클레오티드 기반 수용체(DNA/RNA)에 대한 지원이 추가되었습니다.

양자역학

• DFT 단일 점 에너지 계산 및 기하 구조 최적화는 GPU에서 동일성 근사법 내에서 수행할 수 있습니다.
• 파장에 따른 광회전 현상은 ‘ Jaguar ’ 패널의 새로운 특성입니다.

거대고리 화합물

• 표준 유연한 정렬 방식이 적합하지 않은 매크로사이클 및 기타 ‘5원칙’을 벗어난 화합물을 신속하게 정렬하기 위해 개선된 유연한 리간드 정렬 알고리즘인 ‘Tug Align 2’의 오픈 베타 버전이 출시되었습니다.
• Prime-MCS를 이용한 천연물과 유사한 거대고리 구조 이성질체의 농축 효율 향상
• Prime Macrocycle 샘플링 패널의 기본 암시적 용매 모델이 이제 표면 일반화 본(Born) 모델로 변경되었습니다.
• QM 스코어링 작업을 실행할 때 매크로사이클 스코어링 스크립트의 메모리 활용도 개선

교육 콘텐츠

• 새로운 튜토리얼: AutoTS를 활용한 물 와이어가 반응 장벽에 미치는 영향 탐구
• 새로운 튜토리얼: 다음을 이용한 거대고리의 친화도 최적화 FEP+
• 새로운 튜토리얼: 단백질-단백질 복합체의 컴퓨터 시뮬레이션을 이용한 다중 매개변수 최적화
• 새로운 튜토리얼: 크라이오-EM 모델에서 리간드 자세를 정교화하여 FEP+
• 업데이트된 학습 경로: 전산 표적 분석

다음에 대한 GUI Quantum ESPRESSO

제품: Quantum ESPRESSO (QE) 인터페이스

• Quantum ESPRESSO 7.6으로 업그레이드하기
• POSCAR 파일을 입력으로 사용할 때 VASP 제약 조건이 유지됨 (명령줄)
• NEB 계산에서 Broyden 최적화 지원 (명령줄)
• (+MATSCI_QE_SOLVATION) 3D-RISM 지원
• 표면 에너지: 슬래브 표면 종결 그룹을 선택할 수 있는 옵션

결함 특성

제품: MS DefectPro

• 결함 보정: 모든 OS에서 Freysoldt 보정 지원

마이크로키네틱스

제품: MS Microkinetics

• 전기촉매를 위한 다단계 워크플로우

액티브 러닝 광전자공학

제품: 액티브 러닝 광전자 제품

• 액티브 러닝 광전자공학: 형상 최적화를 위한 MLFF 옵션

반응성

제품: MS 반응성

• Reaction Network Viewer: 에너지 관련 속성 목록 확장

KMC 차지 모빌리티

제품: MS Mobility

• KMC 전하 이동도 계산: 무자기장 이동도에 대한 예측 정확도 향상

반응형 인터페이스 시뮬레이터

제품: MS RIS

• 고체 전해질 계면: 개선된 알고리즘을 통해 처리 속도 향상 (최대 4배)

고급 힘장 응용 분야

제품: MS FF 애플리케이션

• MLFF 계산: 최적화 경로를 따라 반환되는 출력 구조
• MLFF 미세 조정: 여러 데이터셋을 활용한 훈련 지원
• MLFF 미세 조정: 사용자 정의 MPNICE 모델을 기반으로 미세 조정을 시작하는 옵션
• MLFF 미세 조정: 검증 집합의 비율을 사용자 정의할 수 있는 옵션
• MLFF 미세 조정: 다른 MLFF 시뮬레이션의 데이터를 사용하여 학습할 수 있는 옵션

분자 동역학(MD) 시뮬레이션을 통한 수송 계산

제품: MS Transport

• 이온 전도도: 입력값으로 고체 상태 구조 지원

Coarse-Grained (CG) 분자동역학

제품: MS CG

• 백매핑: 단백질 구조에서 2차 구조가 유지됨
• 백매핑: 중간 구조 및 궤적 기록 옵션
• 백매핑: 항체 지원
• Coarse-Grained Sketcher: 편집을 위한 CG 구조체 불러오기 지원
• CG FF Builder: NPT 앙상블이 기본값으로 설정됨
• CG FF Builder: RDF 계산의 속도와 메모리 사용 효율 개선
• CG FF Builder: 올-아톰 궤적과 CG 궤적의 학습 비율 제어
• Coarse-Grained 매핑: 명령줄을 통한 매핑 지원

재료 정보학

제품: MS Informatics

• 머신러닝 물성: 무기 결정의 물성에 관한 5가지 새로운 모델
• MPNICE 임베딩: 파일 시스템에서 결과를 불러오는 옵션
• MPNICE 임베딩: 선택할 수 있는 6가지 새로운 머신러닝 모델
• MLFF 계산: 병렬 시뮬레이션 지원
• 용해도 ML: 비수성 용매에서 분자 용해도 의 예측

처방 ML

제품명: MS Formulation ML

• 모델 학습 최적화: CSV 출력 반환
• 제형 ML: 개별 제형에 대해 보고된 특징 중요도

Denovo ML

제품: MS Denovo ML

• REINVENT: 사전 학습된 ML 모델 이용
• 역분자 설계: 목표 특성을 지닌 유기 분자를 생성하기 위한 AI 기반 워크플로우

MS Maestro 빌더 및 도구

• 에이전트 기반 워크플로우: 메타 워크플로우 구축을 위한 AI 에이전트
• 공간 그룹 할당: 대칭에 대한 허용 오차를 설정하는 옵션
• 무질서한 시스템: 구성 요소의 제목을 원자 수준의 속성으로 유지
• 슬래브 임포트: 반도체 용도로 사용되는 추가 슬래브 표면 모델 (49개)
• 인프라: 입력 SMARTS 패턴의 시각화
• 인터페이스 빌더: 비기본 슬래브 표면 생성 옵션 (명령줄)
• 메타 워크플로우: (+META_WORKFLOW_QE) 다음 기능 지원 Quantum ESPRESSO
• 메타 워크플로우: 열전도도 지원
• 부분 농도: 원래 항목 제목 뒤에 표기된 혼합물 성분
• 주기적 열거: 에발트 순위에 대한 산화수 설정 옵션
• 주기적 열거: 출력 구조체의 수를 제한하는 옵션
• 주기적 열거: 속도 향상을 위해 공간군 할당을 비활성화하는 옵션
• 주기적 열거: 속도 향상을 위해 원자 연결을 비활성화하는 옵션
• 반응 경로 뷰어: MLFF 지원
• 반결정성 고분자: 반복 단위 내 헤드/테일 위치를 지정하기 위한 사용자 인터페이스
• 반결정성 고분자: 비결정 영역에 여러 종류의 단량체가 존재함
• 반결정성 고분자: 처리 속도를 최대 20배까지 향상시키는 개선된 알고리즘
• 솔베이트 시스템: MLFF 지원
• 솔베이트 시스템: 성분 명칭을 원자 수준 속성으로 유지
• 구조화된 리퀴드: 구성 요소 제목을 원자 수준 속성으로 유지
• 구조화된 리퀴드: MLFF 지원
• Sugar Builder: 당화 패턴을 사용하여 생성하는 옵션

고전 역학

• Droplet: MLFF 지원
• 혼합 엔탈피: (+MATSCI_MIXING_ENERGY) 다중 GPU를 활용한 병렬 연산 지원
• 혼합 엔탈피: (+MATSCI_MIXING_ENERGY) 다성분 고분자 재료의 혼합 에너지 및 플로리-허긴스 χ 매개변수를 계산하기 위한 워크플로우 솔루션
• 고분자 가교: 처리 속도 향상을 위한 개선된 구조 스캔 알고리즘
• 엄브렐라 샘플링: 작업 재개/연장 지원
• RNA의 3차원 분자 구조를 수정하기 위한 스크립트 (명령줄)

양자역학

• QM Multistage: 단일점 에너지 및 기하 구조 최적화를 위한 GPU 지원
• QM 다단계: 파장의 함수로서 광회전각을 계산하는 옵션
• 흡착 에너지: 0.01 atm 미만의 압력을 적용할 수 있도록 지원
• 흡착 에너지: 기체 상태의 분자에 대한 PBC 내 진공도 증가 phase
• 흡착 에너지: 쌍극자 보정을 포함하는 옵션
• 결합 및 리간드 해리: 해리할 결합을 지정하는 옵션
• CREST: MS Maestro 라이선스에서 실행 가능
• 광전자 필름 특성: 모든 입력 분자에 대해 쌍극자 계산 옵션
• 광전자 필름의 특성: 거대 표면 전위(GSP)
• 광전자 필름의 특성: 자발적 배향 분극(SOP)
• 광전자 필름의 특성: 전기 쌍극자 모멘트에 대한 질서 매개변수
• 광전자공학: MLFF를 통한 기하학적 최적화 지원
• Phase 도표: 표시 단위에 대한 사용자 제어
• 프로브 그리드 스캔: 케이지형 분자의 내부 탐색 지원

교육 콘텐츠

• 새로운 튜토리얼: 에이전틱 AI 모델을 활용한 워크플로 설계
• 새로운 튜토리얼: 박막의 자발적 배향 분극 및 거대 표면 전위
• 새로운 튜토리얼: 전기촉매 반응의 미세동역학 모델링
• 새로운 튜토리얼: 단백질 특성 분석: 3부
• 새로운 튜토리얼: 경로 유도 확산 모델을 활용한 신규 화합물의 드 노보 설계
• 새로운 튜토리얼: Sugar Builder를 이용한 당쇄 만들기
• 새로운 튜토리얼: 머신러닝 용해도 예측
• 새로운 튜토리얼: 무기 결정의 머신러닝 특성 예측
• 업데이트된 튜토리얼: 운동론적 몬테카를로(KMC) 전하 이동도

교육 콘텐츠

생명과학

• 새로운 튜토리얼: AutoTS를 활용한 물 와이어가 반응 장벽에 미치는 영향 탐구
• 새로운 튜토리얼: 다음을 이용한 거대고리의 친화도 최적화 FEP+
• 새로운 튜토리얼: 단백질-단백질 복합체의 컴퓨터 시뮬레이션을 이용한 다중 매개변수 최적화
• 새로운 튜토리얼: 크라이오-EM 모델에서 리간드 자세를 정교화하여 FEP+
• 업데이트된 학습 경로: 전산 표적 분석

재료 과학

• 새로운 튜토리얼: 에이전틱 AI 모델을 활용한 워크플로 설계
• 새로운 튜토리얼: 박막의 자발적 배향 분극 및 거대 표면 전위
• 새로운 튜토리얼: 전기촉매 반응의 미세동역학 모델링
• 새로운 튜토리얼: 단백질 특성 분석: 3부
• 새로운 튜토리얼: 경로 유도 확산 모델을 활용한 신규 화합물의 드 노보 설계
• 새로운 튜토리얼: Sugar Builder를 이용한 당쇄 만들기
• 새로운 튜토리얼: 머신러닝 용해도 예측
• 새로운 튜토리얼: 무기 결정의 머신러닝 특성 예측
• 업데이트된 튜토리얼: 운동론적 몬테카를로(KMC) 전하 이동도

LiveDesign

2026-4년에 예정된 일들

• 생물제제

  • ‘다중 단량체 붙여넣기…’ 기능을 사용하여 잔기 치환 도구에서 여러 단량체를 한 번에 붙여넣을 수 있습니다. 단량체 데이터베이스에서 찾을 수 없는 기호는 유효하지 않은 것으로 표시되므로, 이를 수정하거나 제거할 수 있습니다. 목록을 생성하려면 단량체 데이터베이스의 ‘기호’ 열 머리글에 있는 ‘복사’를 클릭하여 나열된 단량체 기호를 한 줄에 하나씩 클립보드에 복사하십시오.

  • 생성된 가상 생물학적 제제의 ‘엔티티 등록 담당 연구원’ 및 ‘엔티티 등록일’ 열에 누가 언제 잔류물 치환을 수행했는지 기록하십시오.

  • 잔류물 치환 결과를 새로운 LiveReport에 저장할지, 기존 LiveReport에 저장할지 선택할 수 있으며, 결과가 추가될 때 대상 LiveReport를 열 수 있는 옵션도 제공됩니다.

  • 일반적인 오류 메시지 대신, 배너에서 잔기 치환이 실패한 구체적인 이유를 확인하세요. 선택된 각 단량체에 대해 서열에 연결하는 데 필요한 결합 지점이 확인되며, 이 확인 과정에서 실패하거나 알려지지 않은 단량체는 보고됩니다.

  • 잔기 치환 결과를 더 쉽게 비교할 수 있습니다. 각 셀 내에서 사슬, 위치, 원본 및 대상 잔기 값이 정렬되어 각 치환 항목이 열별로 일렬로 정렬되며, 업그레이드 시 기존 결과 열이 자동으로 변환되므로 이전 실행에서 생성된 정수형 돌연변이 위치 값에 더 이상 소수점 이하 자릿수(예: 5.0)가 표시되지 않습니다.

  • Entity Builder에서 PDC (펩타이드 | 페이로드), PDC (펩타이드 | 스페이서 | 페이로드), PDC (펩타이드 | 링커 | 페이로드), PDC (펩타이드 | 스페이서 | 링커 | 페이로드) 등 4가지 새로운 템플릿을 사용하여 펩타이드 약물 접합체를 생성할 수 있습니다.

  • 유연한 템플릿을 사용하여 항체-약물 접합체(ADC) 등록하기: 새로운 ADC(항체 | 링커-페이로드) Flexible 및 ADC(항체 | 링커 | 페이로드) Flexible 템플릿은 단일 특이성 또는 이중 특이성 항체와 하나 이상의 링커-페이로드를 지원하며, 각 구성 요소에 대해 선택적으로 접합 메타데이터를 지정할 수 있습니다.

  • 2-Part 및 3-Part ADC 템플릿에서는 단일 특이성 항체 또는 이중 특이성 항체를 사용해야 하며, 각 하위 구성 요소에 대해 허용되는 엔티티 유형이 나열되어 있습니다.

  • ‘추가’ 버튼을 사용하여 링커-페이로드와 같은 반복 가능한 구성 요소를 추가하고, 삭제 아이콘을 사용하여 불필요한 인스턴스를 제거하되, 항상 최소 한 개의 인스턴스는 유지됩니다.

  • 엔티티 빌더 상단에 있는 내장 지침에 따라 템플릿 유형을 선택하고 ‘선택 항목에서 가져오기’를 통해 하위 구성 요소를 추가하십시오. 템플릿은 서버에서 관리자가 관리하며, 템플릿이 설정되어 있지 않은 경우 관리자에게 문의하라는 메시지가 표시됩니다.

  • 모노머 데이터베이스 테이블과 모노머 상세 보기에서 모노머의 R-기를 확인하고, 모노머의 총 개수와 현재 필터 조건에 해당하는 모노머의 개수를 함께 확인하세요.

  • 모노머 스케쳐에서 사용자 정의 모노머 데이터베이스를 사용하세요. 사용자 정의 모노머는 천연 유사체에 따라 색상이 지정되며, 모노머 선택기에서 모노머를 길게 클릭하면 천연 유사체가 표시됩니다.

  • 서열 뷰어의 로고 그래프에서 비표준 단량체는 해당 잔기 표시 형식이 선택된 경우 단량체 DB 기호(최대 6자)로 별도로 표시되며, 로고의 높이와 단량체 빈도를 연관 짓기 쉽도록 미묘한 배경 색상이 적용됩니다.

  • 시퀀스 뷰어에서 시퀀스를 알파벳 순서대로 정렬하거나, 하나 이상의 정렬된 위치에서 아미노산 잔기 유사도에 따라 정렬하여 관련 변이체를 빠르게 그룹화할 수 있습니다. 정렬 기준은 도구를 다시 열 때 저장 및 복원되며(이전 버전에서 LiveReport 열로 저장된 정렬은 다시 적용해야 함), 정렬이 진행되는 동안 배너가 표시됩니다.

  • 새로운 ‘환형 펩타이드 정렬(Cyclic Peptide Alignment)’ 옵션을 사용하여 환형 펩타이드를 정렬하세요. 이 옵션은 정렬 전에 각 서열을 기준 서열과 가장 잘 일치하도록 회전시키므로, 결과가 각 고리의 선형화 위치에 좌우되지 않습니다. 이 기능은 out-of-phase 이며, 어느 정도 상동성을 지닌 환형 펩타이드에 가장 효과적입니다.

  • 정렬된 순환 펩타이드의 시작 아미노산 잔기를 설정하려면, 눈금자에서 아미노산 잔기를 마우스 오른쪽 버튼으로 클릭한 다음 ‘첫 번째 아미노산 잔기로 설정’을 선택하면 됩니다. 이때 현재 정렬 상태가 유지된다는 내용을 설명하는 일회성 대화 상자가 표시됩니다.

  • 시퀀스 뷰어의 툴팁에서 더 자세한 내용을 확인할 수 있습니다. 여기에는 비표준 잔기에 대한 전체 모노머 데이터베이스 기호와, 잔기 특성에 따라 색상을 지정할 때 각 잔기의 특성 값이 포함됩니다.

  • 이름이 변경된 ‘정렬 및 점수 산정 설정’ 섹션에서 유사도 행렬 설정을 찾을 수 있으며, 해당 섹션의 정보 툴팁에는 이 행렬이 쌍별 정렬, 순환 펩타이드 정렬 및 잔기 유사도 정렬에 사용된다고 설명되어 있습니다.

  • 시퀀스 뷰어에서 어떤 엔티티가 닫을 수 있는 배너를 통해 표시될 수 없는지 파악하세요. 예를 들어, 시퀀스가 없거나 HELM이 유효하지 않은 엔티티의 경우입니다.

  • Sequence Viewer의 CDR 필터링에서 중쇄와 경쇄 간을 전환할 때 도메인 선택 사항을 일관되게 유지합니다.

  • 서열 뷰어의 툴팁과 로고 플롯이 더 읽기 쉬워졌습니다. 툴팁 레이블 간격이 균일해졌으며, 사용자 지정 행렬 툴팁이 더 이상 아래에 있는 옵션을 가리지 않게 되었고, 참조 서열 위쪽에 여백이 추가되었습니다.

  • ‘생물학적 제제/기타’ 엔티티를 모든 사용자가 가져올 수 있음: 모든 사용자는 ‘생물학적 제제/기타’ 가져오기 탭에서 엔티티와 데이터를 가져올 수 있으며, 모든 사용자는 기존 엔티티에 데이터를 추가할 수 있고, 해당 엔티티의 생성자나 관리자만 메타데이터를 덮어쓸 수 있습니다.

  • 알림 표시줄에서 열어본 상세 수입 영수증에서 생물학적 제제/기타 항목의 수입 실패 내역을 확인하고, 이를 CSV 파일로 다운로드하십시오

• 저분자 화합물

  • 파일에서 게시된 어세이 데이터를 가져오기: 관리자가 이 기능을 활성화하면, LiveDesign UI를 통해 소분자 파일을 가져올 때(SDF, CSV, Maestro, Excel) ‘업로드된 데이터 게시’ 옵션이 표시되며, 이를 통해 가져온 데이터는 원본 LiveReport뿐만 아니라 모든 제한 없는 프로젝트에서 사용할 수 있게 됩니다.

  • 프로젝트 대시보드의 ‘프로젝트 관리(Project Administration)’ 탭에서 관리자 권한으로 프로젝트 스캐폴드를 재정렬할 수 있습니다. 확인을 완료하면, 새로운 순서에 따라 ‘프로젝트 스캐폴드( 스캐폴드 )’의 우선순위가 ‘프로젝트 스캐폴드 분해( R-그룹 Decomposition)’ 패널에서 설정되며, 프로젝트 스캐폴드를 사용하는 LiveReports에서 ‘프로젝트 스캐폴드 분해( R-그룹 decomposition)’가 다시 실행될 수 있습니다.

  • 대용량 서버에서 프로젝트 대시보드의 ‘엔티티’ 페이지를 더 빠르게 불러오려면, 각 섹션별로 부분 로더를 적용하고, ‘최근 엔티티’ 필터의 기본값을 ‘지난 달’로 설정하며, 엔티티 수를 가독성 있게 표시하도록 하세요.

  • LiveReport에서 소분자 일반 엔티티 구조를 드래그하여 ‘필터’ 패널, ‘고급 검색’ 구조 쿼리, 그리고 ‘디자인 및 검색’ 탭의 스케쳐로 이동시킵니다.

  • MDL SD(Mol V3000) 형식으로 일반 엔티티로 가져온 소분자 중, 일반 화합물과 일치하는 항목을 복사합니다.

• SAR 분석 대시보드

  • 새로운 SAR 분석 대시보드에서 SAR을 분석해 보세요. 도구 패널의 ‘구조-활성도 관계(SAR)’ 카테고리에서 이 대시보드를 열면, ‘구조-활성도 관계( R-그룹 )’ 분해 결과를 2D 히트맵에 매핑할 수 있으며, 임의의 수치 속성에 따라 색상으로 구분됩니다. 또한 연동된 ‘매칭된 구조-활성도( 스캐폴드 )’ 및 ‘구조-활성도( R-그룹 )’ 필터 패널을 통해 활성도 급감 구간과 아직 탐색되지 않은 치환기 조합을 쉽게 파악할 수 있습니다.

  • R-그룹 로 분해된 LiveReports 중 스캐폴드 에 R-그룹이 두 개 이상 포함된 경우, 처음 열자마자 데이터를 즉시 확인할 수 있습니다. 대시보드는 일치하는 첫 번째 스캐폴드 를 선택하고, R1과 R2를 축에 배치하며, 첫 번째 숫자 열에 따라 색상을 지정하고, 나머지 R-그룹을 (정의된) 필터로 추가하여 AND 조건으로 결합합니다.

  • 드롭다운 메뉴에서 ‘ 스캐폴드 ’ 및 ‘ R-그룹 ’와 일치하는 항목을 필터링하세요. 이 드롭다운 메뉴에는 구조 이미지가 표시되며, LiveReport 필터 적용 후에도 여전히 표시되는 행의 값만 나열됩니다. 선택한 항목은 LiveReport 전체가 아닌 사용자의 대시보드 보기에만 적용됩니다.

  • 대시보드에서 직접 축과 ‘색상 지정 기준’ 열을 변경할 수 있습니다: R-그룹 필터는 자동으로 전환되므로, 한 열이 축과 필터로 동시에 지정되는 일은 없습니다. ‘일치 항목’ 스캐폴드 을 변경하면 ‘ R-그룹 ’ 필터가 (정의됨)으로 재설정되며, ‘색상 지정 기준’ 열을 선택하면 ‘색상 지정 규칙 편집’ 대화 상자가 열립니다.

  • 히트맵, 스프레드시트, 기타 그래프 및 양식 간의 선택 항목을 ‘엔티티별 행’ 수준에서 동기화합니다.

  • 중단한 부분부터 이어가기: 동일한 LiveReport의 대시보드를 다시 열면, 같은 브라우저 탭 내에서 마지막으로 사용했던 축, ‘색상별(Color By)’, 필터 값 및 히트맵 설정이 복원됩니다. 대시보드를 새로 고치거나, 탭을 닫거나, 다른 LiveReport로 전환하면 해당 설정이 초기화됩니다.

  • 로딩, 오류 및 데이터 없음 메시지를 지우고, 필터가 일치하는 화합물이 없을 경우 필터를 업데이트하라는 안내 메시지를 표시합니다.

• 줄거리

  • 2D 히트맵 행렬 차트를 더 자세히 살펴보세요. 이 차트는 수치형 또는 범주형 속성을 X축과 Y축에 배치하고, 데이터 밀도나 세 번째 속성에 따라 격자 영역에 색상을 입히는 방식으로, 이제 확대/축소, 이동, 셀 내 값 레이블 표시/숨기기 기능을 지원합니다.

  • 동쪽 창과 양식 보기의 축 선택기 옆에 있는 ‘색상 기준’ 열을 선택하고, ‘색상 규칙 편집’ 옵션을 사용하여 2D 히트맵의 색상을 사용자 지정하세요.

  • 2D 히트맵 행렬 그래프에서 새로운 ‘선택된 엔티티만’ 옵션을 사용하여 선택한 엔티티만 그래프에 표시합니다.

  • 2D 히트맵 툴팁에서 ‘ 응결 ’ 세부 정보를 확인할 수 있으며, 여기에는 ‘ 응결 ’ 모드, 데이터 포인트 수 및 집계 값이 표시됩니다. 숫자가 아닌 열을 기준으로 색상을 지정할 경우 ‘ 응결 ’ 드롭다운 메뉴는 비활성화되며, 새로 생성된 히트맵의 이름은 기본적으로 ‘2D 히트맵’으로 지정됩니다.

  • 2D 히트맵에서 회색 셀과 셀 제한을 이해하기: ‘색상별(Color By)’ 범례 아래의 설명에는 색상 지정 범위를 벗어난 값이 회색으로 표시된다고 명시되어 있으며, 플롯이 셀 제한(기본값 2,500개, 관리자가 설정 가능)을 초과할 경우 데이터셋을 필터링하라는 메시지가 표시됩니다.

  • ‘데이터’ 탭에 새로 추가된 ‘범주형 데이터 정렬’ 옵션을 사용하면 차트를 LiveReport의 정렬 순서와 독립적으로 유지할 수 있습니다. 이 옵션은 기본적으로 활성화되어 있으며, 산점도, 선 그래프, 박스 플롯, 히스토그램, 원형 차트 및 2D 히트맵 매트릭스 차트에서 범주를 자연스럽게 정렬합니다. 이 옵션을 비활성화하면 LiveReport의 행 순서를 따르며, 원형 차트와 히스토그램의 사용자 지정 구간은 사용자가 정의한 순서를 유지합니다.

  • 1D 히트맵 플롯은 이제 언제든지 사용할 수 있으므로, 필요할 때마다 자유롭게 활용하세요.

  • 산점도의 ‘크기 기준(Size By)’ 옵션에서 ‘색상 기준(Color By)’ 및 ‘점 기준( Shape By)’과 일치하는 열을 검색합니다.

  • 산점도에서 오차 대역은 데이터 점의 색상을 변경하지 않은 채 데이터 점 뒤에 표시되며, 더 이상 bandHighError 및 bandLowError 레이블이 표시되지 않습니다.

  • 그래프 축의 열 선택기에서 표시되는 열 이름 툴팁이 더 이상 화면에 고정되거나 열 선택에 방해가 되지 않습니다.

• 시스템 상태 도구

  • 시스템 상태를 한눈에 확인하세요: ‘시스템 상태’ 도구는 ‘도구’ 패널에서 기본적으로 활성화되어 있으며, 색맹 친화적인 상태 색상을 사용하여 각 지표의 상태를 별도의 간결한 타일로 표시합니다.

  • 새로운 ‘데이터 통합’ 섹션에서 데이터 통합 상태를 모니터링할 수 있습니다. 이 섹션의 ‘DI 상태’ 타일에는 마지막 동기화가 완료된 시간과 함께 동기화 상태(동기화됨, 진행 중, 중단됨, 실패)가 표시되며, ‘보류 중인 DI 이벤트’ 타일에는 아직 처리 대기 중인 이벤트의 수가 표시됩니다. 데이터 통합 상태를 가져올 수 없는 경우, 해당 타일에는 오류 메시지가 표시되지만 도구의 나머지 기능은 정상적으로 작동합니다.

  • 작업 대기열 부하 추적: ‘대기 중’ 타일은 사용 가능한 작업자당 대기 중인 작업 수를 나타내고, ‘실행 중’ 타일은 용량 활용도를 나타내며, 각 타일에는 부하 계수와 용량 활용도 값이 표시됩니다.

  • 각 타일에서 상태 임계값을 확인하고, 현재 상태와 임계값을 설명하는 툴팁을 살펴보세요.

  • 각 작업 대기열에 대해 ‘시간별 대기열 깊이’ 차트에서 대기열 깊이 이력을 확인하고, 최대 및 평균 깊이를 표시하며, 모든 사용자가 동일한 시간 간격을 볼 수 있도록 시계와 연동된 저장된 시간 범위 선택기(지난 1, 2 또는 4시간)를 제공합니다.

  • 관리자 권한으로 도구를 사용자 지정하여 메모리 사용량 및 각 작업 대기열에 대한 ‘경고’ 및 ‘중요’ 임계값을 설정하고, 표시할 섹션과 표시 순서를 선택하십시오.

  • 도구 자체가 사용할 수 없는 경우: ‘ LiveDesign ’ 상태 타일에는 ‘다운(Down)’ 대신 ‘알 수 없음(Unknown)’이 표시되고, 다른 타일들은 회색으로 표시되며, 문제가 지속될 경우 관리자에게 문의하라는 메시지가 나타납니다.

  • 도구 제목 옆에 있는 새로운 “?” 아이콘이나 도구 메뉴의 ‘도움말’ 옵션을 통해 설명서를 열어보세요.

• 3D 시각화

  • 잔기 전하에 따른 잔기 및 원소의 색상 표시: 양전하를 띤 잔기는 파란색, 중성 잔기는 노란색, 음전하를 띤 잔기는 빨간색으로 표시됩니다. 이 색상 체계는 아미노산 잔기에만 적용되며, ‘저장된 장면’에는 반영되지 않습니다.

  • 도구 모음 아이콘의 크기를 통일하고 간격을 더 좁게 조정하여 디자인을 개선했습니다.

  • 목차 패널에서 긴 이름에 대한 툴팁은 창 안에 표시되며, 긴 텍스트는 줄바꿈되어 표시되고, 대비가 더 높은 배경을 사용합니다.

• 검색 및 필터

  • 관련된 필터 쿼리를 결합하기 위해 필터 쿼리 그룹을 생성하고, 각 그룹이 속성, 상위 항목 또는 하위 항목에 따라 일치하도록 설정한 다음, 동일한 LiveReport 필터 내에서 그룹과 개별 필터 쿼리를 혼합하여 사용할 수 있습니다.

  • GPUSimilarity 도구 (베타 버전; 서버에서 이 기능을 활성화하려면 Schrödinger 지원팀에 문의하세요)에서 하위 구조로 검색하는 방법: ‘하위 구조(Substructure)’ 탭을 열고, LiveReport에서 쿼리를 가져오거나 스케쳐에서 직접 그린 후 ‘검색(Search)’을 클릭하여 일치하는 공급업체 화합물을 찾으세요. 결과 화면에는 ‘결과 내보내기(Export results)’와 ‘결과 표시(Show results)’ 항목이 나란히 표시되며, LiveReport 이름을 지정할 수 있는 내보내기 옵션과 가능한 최대 결과 개수가 밑줄로 표시됩니다.

  • ‘데이터 및 열’ 트리의 ‘LiveReport’ 탭에서 여러 단어를 사용하여 열을 검색하고, 모든 단어와 일치하는 열만 표시합니다.

  • ‘고급 검색’의 ‘복합 쿼리’ 보기에서 새로 추가된 ‘모두 제거’ 버튼을 사용하여 모든 조건을 한 번에 지우세요.

• Maestro 통합: Maestro 에서 내보낸 3D 포즈를 LiveDesign 에 저장하고, 새로운 구조물에 대한 새로운 엔티티를 등록하거나 기존 엔티티의 새로운 포즈로 추가합니다.

• UX 개선 사항

  • 행 메뉴를 통해 LiveReport 내의 모든 복합 행을 한 번에 펼치거나 접을 수 있습니다.

  • 브라우저 탭에 현재 프로젝트 이름이 표시되도록 하여 LiveDesign 탭을 구분할 수 있게 하세요.

  • 대용량 LiveReport를 안정적으로 복제할 수 있습니다. 이제 동일한 프로젝트 내에서 LiveReport를 복사할 때 타임아웃 없이 백그라운드에서 처리되기 때문입니다.

  • ‘새 LiveReport’ 대화 상자에서 중첩된 폴더를 더 쉽게 찾을 수 있습니다. 이 대화 상자에서는 중첩된 폴더가 기본적으로 펼쳐지며, 상위 폴더 아래에 전체 폴더 이름이 표시됩니다.

  • 매트릭스 및 다중 엔티티 매트릭스 위젯에서 키보드를 사용하여 매트릭스 구성 그리드를 탐색할 수 있습니다. Tab 키와 화살표 키를 사용하면 셀 간을 이동할 수 있으며, Esc 키를 누르면 편집이 취소되고, 열을 선택하면 포커스가 바로 아래 셀로 이동합니다.

  • ‘엔티티 주석’ 열에서 기존 엔티티 주석을 확인할 수 있으며, 이 열은 ‘데이터 및 열’ 트리에서 추가할 수 있습니다. 이제 주석 열은 기본적으로 기존 주석을 대체합니다.

  • ‘용량-반응 곡선’ 도구는 선택된 행이 없을 때 빈 그래프를 표시하는 대신, 하나 이상의 행을 선택하라는 메시지를 표시합니다.

  • 리간드 최소화 기능은 결합 순서, 원자가, 또는 전하가 유효하지 않은 구조에 대해 리간드 디자이너에 단일 오류 메시지를 표시합니다.

  • LiveDesign 로 업그레이드한 후 브라우저 캐시를 지우지 않아도 ‘ 어세이 ’ 뷰어와 같은 도구는 정상적으로 로드됩니다.

• LDClient API

  • 템플릿을 생성, 나열, 조회 및 삭제하는 새로운 메서드(예: list_entity_templates, get_entity_template_by_name, create_entity_template, delete_entity_template)를 사용하여 엔티티 빌더 템플릿을 관리할 수 있습니다. create_entity_template_version은 템플릿의 정의가 변경될 때 새 버전을 생성하며, update_entity_template은 설명과 폴더 경로만 수정합니다.

  • LDClient를 통해 댓글 형식의 자유 형식 열 값을 읽고 관리하기

  • 모델 출력을 동일한 이름의 새로운 출력으로 대체할 때 update_model이 성공적으로 완료됩니다.

수정된 사항

고급 검색

• ‘고급 검색’에서, 쿼리 표현식이 유효하지 않은 상태에서 추가된 쿼리 그룹과 해당 조건은 이제 표현식이 수정되면 LiveReport가 새로 고쳐질 때 사라지지 않고 저장됩니다.

• ‘고급 검색’의 ‘복합’ 보기에서는 쿼리 간에 AND/OR 연산자가 정의되기 전이라도 빈 쿼리 그룹을 펼 수 있습니다.

• 고급 검색: 이전에는 ‘복합’ 보기에서 괄호를 추가하면 패널이 ‘간단’ 보기로 다시 전환되고 모든 검색 조건이 AND 연산으로 결합되었으나, 이제는 ‘복합’ 보기와 사용자가 설정한 AND/OR 조합이 그대로 유지됩니다.

• ‘지난 X일 이내의 등록일’로 검색하면 같은 날 더 일찍 등록된 화합물이 누락될 수 있으므로, 이제 해당 기간 내의 모든 화합물이 검색 결과에 표시됩니다.

• ‘고급 검색’ 패널의 복합 보기에서, 그룹 내의 쿼리는 쿼리 조건을 제거하고 새로운 조건을 추가한 후 정상적으로 편집 및 삭제할 수 있습니다. 이전에는 이러한 변경 사항이 반영되지 않았습니다.

• ‘자유 형식 댓글’ 열의 고급 검색 쿼리를 자동 업데이트하는 기능이, ‘로트별 행’ 모드에서 ‘실험별 행’ 모드로 다시 전환할 때 LiveReport를 업데이트하지 않는 문제가 있었으나, 이제 모드가 변경될 때마다 결과가 올바르게 새로 고쳐집니다.

• 실제(또는 가상) 화합물로 제한된 구조 쿼리를 사용한 고급 검색은, 해당 구조가 다른 유형의 화합물과도 많이 일치할 경우 예상보다 적은 검색 결과를 반환할 수 있었으나, 이제는 일치하는 모든 화합물을 반환합니다.

• ‘고급 검색’ 패널에 스크롤해야 할 만큼 많은 검색어가 포함되어 있을 때, 마지막 검색어에 대한 톱니바퀴 메뉴가 이제 완전히 표시됩니다.

• 일자 자유 형식 열에 대한 고급 검색은 일부 서버 구성에서는 엔티티를 하나도 반환하지 않았으나, 이제는 검색 범위에 해당하는 값을 가진 모든 엔티티를 반환합니다.

• ‘고급 검색’ 복합 보기에서 빈 쿼리 그룹의 + 아이콘을 클릭해도 열 옵션이 열리지 않았으나, 이제 빈 그룹에는 열 트리를 여는 + 버튼이 표시됩니다.

• ‘고급 검색’의 ‘복합 보기’에서 쿼리 그룹 내 조건들 사이에 설정된 AND/OR 논리 조건이 이전에는 LiveReports를 전환하면 사라졌으나, 이제는 LiveReports를 전환하거나 브라우저를 새로 고침해도 유지됩니다.

• 다음이 설치된 서버에서는 ENABLE_ASYNC_AUTO_UPDATE_ADVANCED_SEARCH 이 기능이 활성화된 상태에서, 자동 업데이트 기능이 포함된 고급 검색이 설정된 LiveReport를 복제할 때, 검색이 ‘ 어세이 ’ 실행 전에 완료되더라도 더 이상 고급 검색 행이 손실되지 않습니다. 이제 복사본에는 저장된 고급 검색 행이 그대로 이어집니다(엔티티 제한 복사의 경우, 복사된 엔티티로 필터링된 상태). 이 기능을 비활성화한 서버는 ENABLE_ASYNC_AUTO_UPDATE_ADVANCED_SEARCH 임시 해결책으로 해당 기능을 다시 활성화할 수 있습니다.

필터

• 쿼리에 AND 및 OR 논리가 결합된 경우, 복잡한 ‘필터’ 보기에서 편집을 할 때마다 커서가 사라지곤 했으나, 이제는 편집하는 동안에도 커서가 제자리에 유지됩니다.

• 복합 필터 편집기에서 쿼리 입력 영역 외부에 숫자를 입력해도 더 이상 기존 쿼리 조건이 식에 추가되지 않습니다. 이제 편집기에서는 영문자(A-Z, a-z)와 괄호만 입력할 수 있습니다.

• 필터 스위치를 끄는 동시에 복합 구조 필터를 제거하면 LiveReport에 강조 표시된 하위 구조 열이 하나 더 남을 수 있습니다. 이제 필터 변경 사항이 저장되는 동안 필터 스위치가 비활성화됩니다.

• '자식 항목과 일치' 조건을 사용한 필터가 적용된 LiveReport를 복제하면 몇 초 후 바닥글의 개수 표시창에 0개의 엔티티가 표시되었으나, 이제 복제된 LiveReport에는 필터링된 엔티티의 정확한 개수가 표시됩니다.

• 하위 구조 개수 계산 열의 슬라이더는 이제 해당 열이 범위 쿼리로 필터링된 상태에서도 이동할 수 있으며, 모든 행 값의 계산이 완료되면 해당 열의 범위가 재계산됩니다.

스케처스

• 기본 검색, 고급 검색 또는 필터 기능에서 스케쳐를 통해 단량체 구조를 더 이상 제출할 수 없으며, 해당 구조는 자동으로 소분자로 변환됩니다. 단량체를 스케치하면 ‘검색’ 및 ‘추가’ 버튼이 비활성화됩니다.

• 프로젝트 대시보드로 이동했다가 다시 돌아온 후에도, 브라우저를 새로 고침하지 않고도 LiveReport에서 개체를 스케쳐로 드래그할 수 있게 되었습니다. 이제 이러한 이동 과정에서 스케쳐 창이 다시 로드되면 스케쳐가 자동으로 재동기화됩니다.

• ‘디자인’ 패널과 ‘검색’ 패널 간을 전환하면 스케치된 구조가 지워지곤 했으나, 이제 스케처는 소분자 구조와 단량체 구조를 모두 유지합니다.

• 펩타이드를 마우스 오른쪽 버튼으로 클릭하고 ‘Design Sketcher에서 사용’을 선택하면 이전에는 오류가 발생했으나, 이제는 Design Sketcher에서 해당 펩타이드가 열립니다.

• Design 스케쳐를 사용하여 화합물을 추가하면 새 행이 선택되지만, 화면은 두 번째 마지막 행까지만 스크롤되었고, 이제 새 행이 화면에 표시되도록 스크롤되었습니다.

실시간 보도

• 필터링된 LiveReport에 SAR 열이 포함된 템플릿을 적용하면 ‘템플릿 적용 중’ 단계에서 응답이 멈추고 SAR 열이 추가되지 않았으나, 이제는 SAR 열이 포함된 템플릿이 즉시 적용됩니다.

• ‘엔티티’ 열에서 Shift 키를 누른 채 클릭하면 이전에는 마지막으로 클릭한 구조만 선택되었으나, 이제는 해당 구조들의 전체 범위가 선택됩니다.

• 행의 마우스 오른쪽 버튼 메뉴 하단에 있는 ‘복사’나 ‘다른 이름으로 내보내기’와 같은 옵션이 일부 행에서는 잘려 보일 수 있었는데, 이제 전체 메뉴가 표시됩니다.

• 원자 단위 렌더링으로는 표시할 수 없었던 생물학적 개체들은, 원자 단위 렌더링이 비활성화된 후에도 파일 아이콘 자리 표시자가 계속 표시되곤 했으나, 이제 정상적인 이미지로 돌아옵니다.

• 다른 곳에서 수식 값을 수정하거나 열을 추가하는 등의 변경 사항이 발생한 후 비활성 상태인 LiveReport 탭으로 다시 전환하면 이전 데이터가 표시되었으나, 이제는 최신 데이터가 표시됩니다.

• LiveReport 선택기는 특정 창 너비에서, 특히 Edge 브라우저에서 잘리거나 잘못 표시되는 문제가 있었으나, 이제 어떤 창 크기에서도 모든 열과 버튼이 정상적으로 표시됩니다.

• 타일 보기에서 3D 시각화 도구( Freeform columns )의 ‘3D로 보기’ 아이콘이 잘려서 3D 시각화 도구를 열 수 없었으나, 이제는 아이콘이 전체적으로 표시되며 구조물을 열 수 있게 되었습니다.

• LiveReport에서 긴 열 머리글 내의 텍스트를 검색하면 머리글이 여러 줄로 나누어지곤 했으나, 이제는 검색 결과가 표시되는 동안에도 머리글이 한 줄로 유지됩니다.

• 문자열 내의 구분 기호(“$”)에 대한 구문 분석 문제를 수정하여, 이로 인해 오류가 발생하거나 수식 저장이 차단되는 현상을 방지했습니다.

• 이전에는 ‘사용자’ 또는 ‘열람자’ 역할을 가진 사용자가 읽기 전용 LiveReport에서 프리폼 열의 값을 편집할 수 없었으나, 이제 프리폼 열 자체가 읽기 전용으로 설정되어 있지 않은 한 해당 값을 편집할 수 있습니다.

• 엔티티 열에 사용자 정의 구조 정렬을 설정해도 구조물의 방향은 변경되지 않으며, 이제 구조물은 지정된 코어를 기준으로 정렬됩니다.

• 어세이 로트당 한 행 모드에서 로트가 여러 개인 생물학적 제제의 경우 툴팁이 표시되지 않았으나, 이제 모든 엔티티 유형에 대해 모든 행당 모드에서 툴팁이 표시됩니다.

• 어세이 열에 대한 ‘열 세부 정보’ 대화 상자에서 ‘필드 구성’ 툴팁 링크와 프로토콜 설명이 누락되어 있었으나, 이제 두 항목 모두 다시 표시됩니다.

• 어세이 셀 툴팁에 관측 농도 값과 단위가 표시되지 않던 문제가 해결되어, 이제 ‘ 어세이 ’ 툴팁 구성에 해당 항목이 포함된 경우 그리드 뷰와 타일 뷰 모두에서 다시 표시됩니다.

MPO

• MPO 열을 제거하면 LiveReport에 새로 추가된 구성 요소의 ‘바람직성’ 열이 남아 있었지만, 이제는 MPO 열과 함께 해당 열들도 제거됩니다.

• 기존 MPO에 구성 요소를 추가할 때 처음 ‘저장’을 누르면 오류가 발생했으나, 이제는 첫 시도에서 성공적으로 저장됩니다.

• 기존 MPO에 구성 요소를 추가하면, 해당 구성 요소의 새로운 ‘바람직성’ 열이 LiveReport의 맨 오른쪽에 배치되며, 이제 해당 MPO의다른 ‘바람직성’ 열들과 함께 그룹화됩니다.

• 미게시 열을 기반으로 생성된 MPO가 포함된 LiveReport를 복사하거나 복제하거나 템플릿으로 저장할 경우, 미게시 입력값에 대한 검사가 생략되어 점수가 없는 MPO 및 적합도 열이 생성될 수 있었으나, 이제 LiveDesign 에서는 미게시된 자유 형식 또는 수식 입력 열을 게시하라는 메시지를 표시하거나, 해당 MPO가 제거될 때까지 LiveReport를 복사할 수 없다는 경고 메시지를 표시합니다.

양식 레이아웃

• 다중 엔티티 행렬 위젯: SAR 열의 글자 크기가 너무 작아 읽기 어려웠으나, 이제 셀 크기에 맞게 조정됩니다.

• 폼 레이아웃에서, 엔티티 이미지 위젯을 통해 드릴다운되도록 설정된 위젯들은 스프레드시트에서 해당 엔티티 이미지 자체를 드릴다운했을 때 데이터를 표시하지 않았으나, 이제는 선택된 엔티티에 대한 데이터를 표시합니다.

• 다중 엔티티 매트릭스 위젯에서 행이나 열 구분선을 드래그하면 이전에는 엔티티 이미지가 선택되었지만, 이제는 행이나 열의 크기가 조정되며, 크기 조정 및 스크롤 시에도 레이블과 콘텐츠의 정렬이 유지됩니다.

프로젝트 대시보드

• 프로젝트 대시보드의 ‘활동’ 탭에서 ‘자유 형식 댓글’ 열 이름을 기준으로 검색하면 결과가 표시되지 않았으나, 이제는 해당 열의 댓글로 활동이 필터링됩니다.

• 이제 초고도 제한이 적용되지 않은 비글로벌 프로젝트의 ‘활동’ 탭에서 댓글을 필터링할 때, 열 이름 드롭다운 메뉴에 ‘전체 댓글’ 열이 표시됩니다.

• 프로젝트 대시보드의 ‘엔티티’ 섹션에서는 스테레오 범주나 주석만 다른 경우처럼, 다른 등록된 화합물과 구조를 공유하는 실제 화합물을 누락할 수 있었으나, 이제는 이러한 화합물들을 모두 집계하여 나열합니다.

• 게시된 프리폼 댓글 열을 삭제해도 프로젝트 대시보드의 활동 열 선택기 및 댓글 스트림에는 여전히 표시되었으나, 이제 두 곳 모두에서 제거됩니다.

수입 및 수출

• 예를 들어 LDClient의 import_maestro_generic_entity 메서드를 사용하여 .maegz 파일에서 이미 등록된 일반 엔티티에 대한 Maestro 데이터를 가져올 때, 이전에는 3D 열만 추가되었으나, 이제 3D가 아닌 속성 열도 LiveReport에 추가됩니다.

• Data Integrator를 통해 로드된 TYPE 선언 파일(예: ADC)을 사용하는 사용자 정의 클래스의 제네릭 엔티티가 이제 LiveReports에서 성공적으로 등록되고 해당 클래스 아이콘이 표시됩니다. 처리된 구조체에 직렬화된 구조체가 없는 경우, 등록 과정에서 더 이상 ld_generic_entity_structure 행이 작성되지 않으며, 클래스 아이콘은 ld_generic_entity_type을 통해 렌더링됩니다.

• 단일 ‘자유 형식 주석’ 열 셀에 여러 개의 주석이 포함된 경우처럼 셀 텍스트가 긴 LiveReports를 PDF로 내보내면, 텍스트가 셀 경계를 벗어나 페이지 밖으로 넘쳐나며 겹쳐 보이던 현상이 발생했으나, 이제는 텍스트가 셀 경계에서 잘려 나가도록 수정되어 텍스트가 셀 내부에 머물게 됩니다.

• “해당 행의 엔티티를 처리할 파일이 없다”는 오류 메시지가 표시되던 일반 엔티티 가져오기 오류에서, 이전에는 ‘Entry’ 열보다 한 줄 낮은 행 번호가 표시되었으나, 이제는 1을 기준으로 한 동일한 행 번호가 표시됩니다.

잔류물 치환 및 단량체

• 이제 잔기 치환 시 돌연변이 위치 값이 텍스트로 저장되므로, 단일 치환의 정수 위치가 더 이상 소수 값으로 표시되지 않습니다.

• ‘잔여량 대체’ 도구에서 다른 LiveReport로 전환한 후 엔티티를 다시 불러오면 ‘체인’ 드롭다운 메뉴가 비활성화되던 문제가 수정되었습니다. 이제 LiveReport를 전환할 때마다 도구가 초기화되어 체인을 선택할 수 있습니다.

• 배치 내의 어떤 치환이라도 유효하지 않은 경우, 잔기 치환은 전체 작업에서 실패로 처리되었으며, 이제 유효한 돌연변이를 추가하고 거부된 각 치환을 해당 개체에 대한 실패로 보고합니다.

• 잔기 치환 작업에 단량체 데이터베이스에 없는 단량체 ID가 지정될 경우, 이제 작업 오류 메시지에 단순히 작업 실패 사실만 보고하는 대신 해당 알 수 없는 단량체의 이름을 명시하며, LDClient 역시 이 메시지를 AsyncServiceTaskFailedError에 포함합니다.

• 여러 돌연변이가 포함된 잔기 치환 결과에서, 이제 ‘부모(Parent)’ 열이 ‘돌연변이 사슬(Mutation Chain)’, ‘돌연변이 위치(Mutation Position)’, ‘시작 위치(Mutation From)’ 및 ‘종료 위치(Mutation To)’ 값과 함께 셀 내에 정렬되므로, 각 돌연변이 행에서 해당 돌연변이가 파생된 부모를 확인할 수 있습니다.

• '일반 사용자' 역할을 가진 사용자는 이전에는 '잔류물 대체' 도구를 열어 오류 내용을 확인할 수 있었으나, 이제 '잔류물 대체' 및 '모노머 데이터베이스' 도구는 일반 사용자에게 숨겨져 있으며, '열람자'는 해당 도구를 사용할 수 없습니다.

• ‘잔기 치환’ 도구에서 치환 대상 잔기와 동일한 단량체를 선택하면 작업이 실패하게 되며, 이제 해당 단량체는 치환 목록에서 사용이 비활성화되었습니다.

• 잔여량 대체 기능으로 단일 엔티티가 생성될 때, 알림 메시지가 “1개의 엔티티가 추가되었습니다” 대신 “LiveReport에 1개의 엔티티가 추가되었습니다”로 표시됩니다.

반응 열거

• ‘반응 열거’ 패널의 반응 미리보기에서 텍스트가 겹쳐서 읽기 어려웠으나, 이제는 선명하게 표시됩니다.

• 반응 열거 기능은 구조를 한 번에 하나씩 처리하는 대신 병렬 배치로 사전 처리함으로써 생성물을 더 빠르게 등록하며, 내부 테스트 결과 1,000개 생성물 실행 시 약 18% 더 빠른 속도를 보였습니다. 등록 동작(별칭, 중복 제거, 오류 보고)은 변경되지 않았습니다.

• ‘반응 열거’에서 ‘New Sketch’로 그린 반응물은 생성물과 함께 LiveReport에 표시되지 않았으나, 이제 LiveReport에 추가됩니다.

R-그룹 분해

• LiveReport에 ‘ 스캐폴드 ’을 추가하면, 브라우저를 새로 고침할 때까지 많은 ‘ R-그룹 ’ 분해 셀이 보류 상태로 남아 있었지만, 이제는 새로 고침 없이도 분해 결과가 표시되며, 새로 추가된 ‘ R-그룹 ’ 열에서도 마찬가지입니다.

• R-그룹 의 분해 도구에서, ‘사용 위치 > SAR 분석’을 선택해도 ‘ 스캐폴드 ’ 스케쳐가 열리지 않았고, ‘LiveReport Scaffolds’ 섹션이 접혀 있을 때 엔티티를 도구로 드래그해도 드롭 대상이 나타나지 않았던 문제가 수정되었습니다. 이제 해당 섹션의 상태와 관계없이 스케쳐가 열리며, 엔티티를 드래그하기 시작하면 섹션이 펼쳐집니다.

• R-그룹 새로운 스캐폴드 에 추가된 열은 이제 ‘ 스캐폴드 ’과 ‘ 스캐폴드 ’ 이름의 일치 순서대로 표시되며, 그 다음에는 R-그룹이 오름차순으로 나열됩니다.

• ‘프로젝트 스캐폴드 사용’을 활성화하면 새로 추가된 ‘ R-그룹 ’ 열이 브라우저를 새로 고칠 때까지 ‘보류 중’ 상태로 남아 있는 경우가 있었는데, 이제 이러한 열에는 ‘ R-그룹 ’ 이미지가 즉시 표시됩니다.

• 이전에는 하나의 LiveReport에서 게시된 프로젝트 스캐폴드에 변경 사항이 발생해도 브라우저를 새로 고침하기 전까지는 다른 열려 있는 LiveReport의 그리드가 업데이트되지 않았으나, 이제는 자동으로 업데이트됩니다.

• LiveReport에서 소분자 일반 엔티티(Generic Entity)를 ‘화합물 구조 편집기( R-그룹 )’ 분해 패널로 드래그해도 구조 객체( 스캐폴드)가 생성되거나 편집되지 않으며, 이제 화합물의 경우와 마찬가지로 ‘화합물 구조 편집기( 스캐폴드 )’ 편집을 위한 스케쳐가 열립니다.

• R-그룹 LiveReport에 새로 추가된 화합물에 대한 분해 셀은 브라우저를 새로 고칠 때까지 처리 대기 상태로 남아 있을 수 있었으나, 이제는 새로 고침 없이도 결과가 표시됩니다.

• 관리자가 입체화학, 타우토머 또는 방향성에 대한 하부 구조 검색 설정을 변경한 후에도, ‘ R-그룹 ’ 분해 기능에서 잘못된 입체이성질체와 매칭된 화합물과 같은 이전의 스캐폴드 매칭 결과가 계속 표시될 수 있었습니다. 이제 이러한 설정이 변경되면 캐시된 매칭 결과가 지워지고 재계산됩니다.

• R-그룹 의 분해 패널에서 스캐폴드의 순서를 재정렬하는 동안 스캐폴드를 편집하거나 추가할 수 있었으며, 목록에 표시하지 않고 저장할 수도 있었지만, 이제 순서 재정렬 중에는 편집 기능이 비활성화됩니다.

줄거리

• 그래프 축에 사용된 이미지가 축 위에 마우스를 올렸을 때 잘리거나 끊겨 보이던 문제가 수정되어, 이제 모든 그래프 유형에서 정상적으로 표시됩니다.

• R-그룹 나 엔티티 이미지를 축에 사용하는 플롯의 경우, 이전에는 축 주변에 많은 여백이 남았으나, 이제는 이미지와 플롯이 사용 가능한 공간을 모두 채웁니다.

• 데이터 포인트에서 커서를 떼어도 그래프 툴팁이 화면에 남아 있던 현상이 수정되어, 이제 정상적으로 사라집니다.

• 박스 플롯에서 Y축 열을 변경하면 사용자 지정 X축 범위가 재설정되었으나, 이제는 각 축의 열이 변경되지 않는 한 해당 축의 사용자 지정 범위가 유지됩니다.

• 내보낸 PNG 및 SVG 그래프에서는 고정된 툴팁 연결선이 잘못된 위치를 가리키곤 했으나, 이제 해당 선들이 올바른 데이터 포인트를 가리킵니다.

• 폼 보기에서 차트 빠른 옵션의 긴 열 이름이 화면 밖으로 넘쳐나면서 두 번째 열 선택기가 화면 밖으로 밀려나곤 했으나, 이제는 내용이 잘려서 두 선택기 모두 계속 사용할 수 있게 되었습니다.

• 다른 LiveReport의 데이터 시리즈를 사용한 박스 플롯, 히스토그램 및 산점도는 이전에는 탭을 전환할 때까지 활성화된 LiveReport의 데이터만 표시되었으나, 이제는 새로 고침 후 즉시 두 LiveReport의 데이터를 모두 표시합니다.

• 차트 옵션에서, ‘색상별(Color By)’ 열 이름이 길 경우 툴팁이 ‘색상 지정 규칙 편집’ 버튼을 가리던 문제가 해결되어, 이제 툴팁이 해당 버튼 아래에 표시됩니다.

• ‘용량-반응 곡선(Dose Response Curve)’ 도구의 ‘오버레이 열(Overlay Columns)’ 드롭다운 메뉴는 이전에는 관리자가 설정한 ‘ 어세이 ’ 열 필터를 무시하고 이름에 ‘Curve)’가 포함된 열만 나열했으나, 이제는 설정된 필터를 적용합니다. 기본 설정은 여전히 ‘Curve)’ 열만 표시하지만, 대소문자를 구분하지 않고 일치하는 열을 표시합니다.

• ‘양식’ 보기에서 히트맵 플롯의 열 드롭다운 메뉴에 있는 검색 상자의 색상 테마가 다른 플롯 유형과 달랐으나, 이제 다른 플롯 유형과 일치하도록 변경되었습니다.

• 2D 히트맵 응결 의 ‘합계’ 및 ‘중앙값’과 같은 모드에서는 소수점 이하 10자리 이상의 값이 표시되던 것이, 이제 반올림된 값으로 표시됩니다.

• 여러 개체가 포함된 2D 히트맵 셀 위에 마우스를 올리면 이전에는 첫 번째 개체에 대한 툴팁만 표시되었으나, 이제는 수치 열을 기준으로 색상을 지정할 때 집계된 값이 표시됩니다.

Ligand Designer

• Ligand Designer: 선택된 두 원자 중 하나를 선택 해제하고 나서 원자나 단편을 추가하면 세션이 중단되고, 세션을 다시 열 때 리간드가 사라지는 문제가 있었으나, 이제 리간드 편집 기능이 예상대로 작동합니다.

• ‘리간드 디자이너’와 ‘리간드 최소화’ 기능에서는 리간드 이름의 화합물 ID 자리에 ‘undefined’가 표시되던 것이, 이제는 화합물 ID 뒤에 참조 리간드 또는 포즈 이름이 표시됩니다.

• Ligand Designer: 포즈 예측 후 팝아웃 모드로 세션을 열면 캔버스와 오버레이가 간헐적으로 깜빡이는 현상이 발생하곤 했으나, 이제 팝아웃이 정상적으로 표시됩니다.

• 리간드 디자이너: 최소화 워크플로로 전환한 직후 리간드를 최소화하면 리간드가 포켓( 결합 포켓) 밖으로 빠져나갈 수 있었으나, 이제는 최소화된 자세가 포켓 안에 유지됩니다.

3D 시각화 도구

• 빈 파일 등 3D 첨부 파일의 내용이 동일한 모델 출력물의 경우, 3D 비주얼라이저에서 동일한 엔티티의 첨부 파일이나 다른 엔티티의 첨부 파일이 로드되곤 했으나, 이제 각 구조체는 자체 첨부 파일을 로드합니다.

• 3D 비주얼라이저 계층 구조에서, 3D Freeform columns 및 Generic Entities의 구조체들이 이제 모델 출력 결과와 일관성을 유지하기 위해 엔티티 ID 헤더 아래로 그룹화됩니다.

• 한 엔티티에 대한 여러 포즈가 동일한 3D 첨부 파일을 공유할 경우, 3D 시각화 도구에서는 이전에는 모든 포즈에 대해 하나의 공통된 이름을 표시했으나, 이제는 각 포즈의 사용자 지정 이름을 표시합니다.

시퀀스 뷰어

• 이전에는 하나의 서열 뷰어에서 번호 매기기 방식을 변경하면 해당 뷰어에서만 선택된 잔기가 지워졌지만, 이제는 동기화된 모든 서열 뷰어 및 3D 시각화 도구 인스턴스에서 선택 내용이 지워집니다.

• SEQUENCE_VIEWER_CUSTOM_MATRIX_FILE_UPLOAD_LIMIT로 설정된 제한보다 약간 큰 사용자 정의 매트릭스 파일도 시퀀스 뷰어에 업로드될 수 있었으나, 이제 다른 파일 업로드와 마찬가지로 제한이 10진수 메가바이트(1 MB = 1,000,000 바이트) 단위로 측정되므로, 제한을 초과하는 파일은 거부됩니다.

• 시퀀스 뷰어: 열려 있는 드롭다운 메뉴 뒤에 떠 있는 잔기 툴팁이 가려져 보이던 문제가 해결되어, 이제 드롭다운 메뉴가 열려 있지 않을 때만 표시됩니다.

• 시퀀스 뷰어는 선택된 엔티티를 불러오는 동안 처리 상태 표시줄 옆에 라이선스 오류가 표시되곤 했으나, 이제는 ‘스위트 라이선스 확인 중’이라는 메시지가 표시되고 라이선스 확인이 완료될 때까지 기다린 후 엔티티를 불러옵니다.

• 시퀀스 뷰어에서 고정된 참조 서열이 이전에는 처리 상태 표시줄 위로 스크롤되었으나, 이제는 그 뒤에 고정되어 표시됩니다.

• 사이드 체인 의 ‘Chemistry’, ‘Helix’, ‘Strand’, ‘Turn Propensity’, ‘Exposure Tendency’ 및 ‘Steric Group’ 색상 구성에 대한 시퀀스 뷰어 범례에서는 이제 별도의 ‘Default’ 항목을 표시하는 대신, ‘No propensity’와 같이 기본 색상을 설명적으로 표기합니다.

• 잔기 특성에 따라 시퀀스 뷰어를 색상 지정할 때, 유효하지 않거나 JSON 형식이 아닌 파일이 포함된 열을 사용하면 이전에는 로딩 아이콘이 무한정 표시되었으나, 이제는 오류 아이콘이 나타나며 툴팁에 유효하지 않은 파일이 있는 엔티티 목록이 표시됩니다.

• 시퀀스 뷰어(Sequence Viewer) 로고 플롯의 보존 툴팁에는 핵산 잔기가 다음과 같이 표시되었습니다. UNK로 표시되었으나, 이제는 해당 잔기 코드로 표시됩니다. 단, 우라실은 여전히 X로 표시됩니다.

LDClient & API

• LDClient: input_format을 생략하면 bbchem_convert가 400 오류로 실패했으나, 이제 문서에 명시된 대로 입력 형식을 자동으로 감지합니다.

• LDClient API 참조 문서에서, 사이드바에 표시되는 긴 메서드 이름이 더 이상 메인 콘텐츠 영역으로 넘치지 않고 줄바꿈되어 표시됩니다.

• LDClient의 update_monomer 메서드를 사용하여 사용자 정의 모노머의 별칭만 업데이트했을 때, 해당 모노머의 UPDATED_AT 타임스탬프가 변경되지 않았습니다. 이제 UPDATED_AT는 별칭 변경 사항을 반영합니다.

• API 엔티티 표현식에서 MOL 또는 MOL V3000 형식의 소분자 제네릭 엔티티를 요청했을 때 이전에는 빈 응답이 반환되었으나, 이제는 MOL V3000 형식의 구조가 반환됩니다.

인증

• 로그아웃했다가 다시 로그인하면 어떤 브라우저 탭에서든 가장 최근에 새로 고침된 LiveReport가 열렸지만, 이제는 해당 탭에서 열려 있던 LiveReport로 돌아갑니다.

• Firefox 에서 리프레시 토큰 생성 페이지를 열면 프로젝트 페이지로 리디렉션되거나 구문 오류가 표시되곤 했으나, 이제는 토큰이 정상적으로 표시됩니다.

관리자 패널

• 관리자 패널에서 프로토콜이나 모델에서 프로젝트를 제거해도 하위 모델 및 매개변수화 모델에서는 제거되지 않아 일관성이 없는 상태가 발생했으나, 이제 프로젝트가 하위 모델 및 매개변수화 모델에서도 함께 제거됩니다. 또한 관리자는 모델에서 프로젝트를 제거할 때 경고 메시지를 확인하게 됩니다.

시스템 상태 도구

• 도구 창의 크기를 조정할 때 ‘시스템 상태’ 도구의 툴팁이 잘리곤 했으나, 이제는 전체가 표시됩니다.