소분자 신약 개발
플랫폼 환경
Maestro 그래픽 사용자 인터페이스
- 새롭게 디자인된 Surface Manager – 표면 스타일, 색상 및 투명도를 실시간으로 비모달 방식으로 편집할 수 있는 현대적이고 지속적 인터페이스를 통해 복잡한 시각화도 손쉽게 제어할 수 있습니다.
- 지속적인 측정값 – 이제 기하학적 측정값이 항목과 함께 유지되므로, 여러 컨포머와 상태에 걸쳐 중단 없이 구조 비교를 수행할 수 있습니다.
- 독립형 밀도 맵 가져오기 – 직접적이고 독립적인 밀도 맵 가져오기 기능을 통해 극저온 전자현미경(Cryo-EM) 및 결정학 워크플로우를 가속화하세요
- Maestro 어시스턴트 모드(오픈 베타) – 상황에 따라 ‘질문’, ‘실행’, ‘자동’ 모드를 지능적으로 전환하여 문서화와 직접적인 실행을 매끄럽게 연결해 주는 AI 파트너
결합 부위 및 구조 분석
혼합 용매 MD (MxMD)
- 명령줄 MxMD 드라이버에, MxMD와 SiteMap을 결합한 난해한 포켓 식별 워크플로우의 모든 시뮬레이션을 원활하게 실행하고 결과를 컴파일할 수 있는 기능을 추가했습니다.
WaterMap
- WaterMap은 이제 OPLS_2005 힘장 및 TIP4P 물 모델의 사용을 지원합니다.
Hit Identification & 온라인 상영
도킹
- 새로운 ‘도킹 보고서’를 통해 네이티브 재도킹 실험을 파악, 최적화 및 문제 해결하여 도킹 성능을 극대화하세요
Lead Optimization
FEP+
- GraphDB/웹 서비스는 선택에 따라 FMPdb는 제외하고 기본 FMP 파일만 다운로드할 수 있어 결과 분석에 소요되는 시간을 단축할 수 있습니다.
- FEP+ 워크플로가 이제 비용 효율적인 선점형 노드에서의 실행을 지원합니다.
- 2D Sketcher 를 사용하여 다음의 Core SMARTS 를 정의하십시오. FEP+
- FEP+ 통계 분석에서 범주형 데이터 어세이 의 처리 기능 개선
FEP+ 프로토콜 빌더
- 프로토콜 최적화를 위해 세 가지 농도의 염 용액을 채취한다
- 프로토콜 최적화를 위한 자동 막 배치 예시
FEP+ 포즈 빌더
- FEP+ Pose Builder를 사용하여 정확하고 충돌을 고려한 FEP 준비 완료 포즈를 자동으로 생성하세요: 편향 없는 선택과 견고한 원자 매핑을 위해 설계된 자동화된 워크플로를 통해 고품질 리간드 정렬을 더 빠르게 생성함으로써, 대규모로 ‘ FEP+ ’를 실행할 수 있습니다.
- LiveDesign FEP+ Pose Builder 프로토콜이 이제 사이클 클로저 FEP 계산을 위한 FMP 파일 생성을 지원합니다.
양자역학
- 명령줄에서 AutoTS에 xTB 및 QRNN, MPNICE, UMA를 포함한 MLFF를 적용하여 계산 시간을 단축하십시오.
- 모든 멀티스레드 방식의 Jaguar 일괄 계산에 대해 CPU 코어 할당을 최적화하여 일괄 계산 속도를 높입니다.
분광학
- 13C NMR 스펙트럼에서 C-Br 및 C-I 결합에 대한 새로운 보정값
데 노보 디자인
AutoDesigner – R-그룹 Design
- 기능 플래그를 설정하여 이제 사용할 수 있는 새로운 AutoDesigner R-그룹 설계 패널을 통해 방대한 화학 공간을 탐색하여 최적의 R-기를 식별하세요.
- AutoDesigner R-그룹 의 설계 아이디어에 선택 사항인 QED 점수(약물 유사성 정량적 평가)를 추가했습니다.
AutoDesigner – 핵심 설계
- 기능 플래그를 설정하여 이제 사용할 수 있게 된 새로운 ‘AutoDesigner 코어 설계 패널’을 통해 방대한 화학 공간을 탐색하고 최적의 코어 대체 물질을 찾아보세요.
- AutoDesigner Core 설계 아이디어에 선택 사항인 QED 점수(약물 유사성 정량적 평가)를 추가했습니다.
교육 콘텐츠
- 사용자가 튜토리얼 내에서 바로 워크플로우의 각 단계를 직관적으로 클릭하며 진행할 수 있는, 더욱 상호작용적인 새로운 튜토리얼 경험을 소개합니다. 이 방식은 현재 두 개의 튜토리얼에서 시범 운영 중입니다.
- 업데이트된 튜토리얼: 다음을 이용한 구조 기반 가상 스크리닝 Glide
- 업데이트된 튜토리얼: 구조 준비 및 시각화 개요
- 항체 모델링에 관한 학습 콘텐츠를 전면 개편했습니다:
“BioLuminate에서의 항체 시각화 및 모델링” 튜토리얼은 다른 유용한 자료들과 함께 학습 경로로 구성된 새로운 튜토리얼 모음으로 대체되었습니다.- 새로운 학습 과정: 항체 모델링
- 새로운 튜토리얼: BioLuminate를 활용한 항체 구조 예측 및 시각화
- 새로운 튜토리얼: BioLuminate를 활용한 항체 구조의 인간화
- 새로운 튜토리얼: PIPER를 이용한 항체-항원 도킹
- 새로운 튜토리얼: MM-GBSA 잔기 스캐닝을 활용한 항체 결합력( 안정성)/친화도 향상
- 새로운 튜토리얼: 표적 단백질 분해제의 합리적 설계를 가능하게 하는 3원 복합체 구조 생성
- 업데이트된 튜토리얼: 자유 에너지 섭동을 이용한 BACE1 억제제 설계
- 새로운 빠른 참조 가이드: 포스 필드 빌더
- 새로운 빠른 참조 자료: 리간드 상호작용 다이어그램
생물학적 제제 신약 개발
- MacroMolecular Pose Filter 출시 – 생성된 다양한 가능성 중에서 고분자 복합체의 가장 타당하거나 관련성이 높은 구조 모델을 선택합니다.
- 새로운 단백질 묘사자 – ASPmax – 추가: 묘사자 세트에 ASPmax(최대 평균 표면 특성)를 추가했습니다. 이는 소수성 상호작용 크로마토그래피(HIC) 컬럼에서 단백질의 유지 시간을 예측하고, 응결 위험도를 예측하는 데 사용됩니다.
- 비표준 잔기 검색 및 필터링 – ‘이름’, ‘코드’ 및 ‘설명’ 열의 레이블을 기반으로 비표준 잔기에 대한 텍스트 기반 검색 및 필터링 기능 지원
- MMGBSA 잔기 스캔 패널의 잔기 조회 – 돌연변이를 도입할 잔기를 빠르게 검색하고 찾을 수 있습니다
- 잔기 스캐닝 결과의 분류 – 에너지 점수 기준값을 바탕으로 양성, 중성 또는 음성 돌연변이 변이를 지정하기 위해 잔기 스캐닝 결과에 색상을 할당합니다.
재료 과학
다음에 대한 GUI Quantum ESPRESSO
제품: Quantum ESPRESSO (QE) 인터페이스
- 결함 형성 에너지: 결정 내 점결함을 분석하기 위한 워크플로우 솔루션
- Phonon DOS 뷰어에서 주파수 컷오프/고조파 임계값을 설정하는 옵션
- TB09 밀도 함수법 지원 (명령줄)
- rVV10-SCAN 밀도 함수법 지원 (명령줄)
- QE BOMD 시뮬레이션에서 NpT 앙상블 지원 (명령줄)
- (+MATSCI_NEB_MLFF) NEB에서의 MLFF 통합
MS 서피스
제품: MS SurfChem
- 탈착 열거: WAM을 이용한 흡착 에너지 결과 도출
마이크로키네틱스
제품: MS Microkinetics
- 선택성과 선택성 제어 정도를 확인하는 옵션
- 보관된 MKM 출력 파일 불러오기/저장하기 옵션
- 반응 보기를 이미지(PNG) 파일로 내보내는 옵션
- 분석 패널에서 개별 단계별 결과를 확인할 수 있습니다.
광전자공학 유전적 최적화
제품: 유전적 최적화(GA)
- ML Property Prediction의 모델을 기반으로 목표 속성을 설정하는 기능 지원
액티브 러닝 광전자공학
제품: 액티브 러닝 광전자 제품
- 최적화 대상에서 제외할 목표값을 설정하는 옵션
반응성
제품: MS 반응성
- 나노리액터: 드라이버와 서브잡에 대해 별도의 호스트를 지정할 수 있는 옵션
- 나노리액터: (+NANOREACTOR_AUTOTS) AutoTS를 통한 기본 반응 네트워크 계산용 자동 전이 상태 검색
- 나노리액터: 궤적 파일 생성을 건너뛸 수 있는 옵션
- 나노리액터: 궤적 프레임 간 시간 간격을 사용자가 제어할 수 있음
- Reaction Network Profiler: UMA(MLFF)를 사용하여 콘포머 기하 구조를 정교하게 조정하는 옵션
- 반응 네트워크 프로파일러: 반응물에 대한 화학량론적 배수를 할당하는 옵션
분자 동역학(MD) 시뮬레이션을 통한 수송 계산
제품: MS Transport
- 이온 전도도: MLFF 지원
유전 특성
제품: MS 유전체
- 복소 유전율: 다성분 시스템 지원
Coarse-Grained (CG) 분자동역학
제품: MS CG
- CG FF Builder: 비이소모픽 잔기의 탐지 및 매핑 기능 개선
- CG FF Builder: 화학적 맥락을 반영한 자동 입자 명명 체계
- CG FF 과제: 입자 유형이 많은 모델의 경우 최대 15배의 속도 향상
- Coarse-Grained 매핑: 매핑 과정에서 잔기 번호 및 이름 유지
- Coarse-Grained 매핑: 이전에 사용했던 ‘ SMARTS ’ 패턴을 가져오는 옵션
- 컷오프 마진 개선을 통해 DPD 시뮬레이션 속도를 최대 30%까지 향상
복합 이중층 형성제
제품명: MS Complex 이중층 형성제
- 복합 이중층: (+COMPLEX_BILAYER_BUILDER_EXTENDED_LIPID_LIB) 기본 지질 목록 확장
- 복합 이중층: 물 패딩 깊이의 상한을 5000 Å로 확대
- 복합 이중층: 사용자 정의로 훈련된 OPLS 지원
- 멤브레인 분석: (+MEMBRANE_ANALYSIS_PREP_FOR_FEP) FEP 계산과 호환되는 PoseViewer 형식 파일 생성 지원
- 막 분석: 다중 리플렛 탐지 알고리즘 적용 지원
재료 정보학
제품: MS Informatics
- 머신러닝 기능: 모델 선택을 위한 패널 인터페이스 개선
- MD 표현자: 시뮬레이션 시스템 규모(최대 원자 수)에 대한 사용자 제어
- MD 표현자: 구조 파일에 경로가 지정된 경우의 공식 입력 지원
- MLFF 계산: 원자 위치에 제약 조건을 설정하는 옵션
- MLFF 계산: GPU 노드에서 실행 지원
처방 ML
제품명: MS Formulation ML
- 머신러닝 모델 구축: 특징 공간의 새로운 대안으로서의 ‘학습된 지문’
- ML 모델 구축: 일부 값이 누락된 훈련 데이터셋을 처리(‘보완’)하기 위한 고급 옵션 표현자
- ML 모델링: 패리티 플롯의 사용자 인터페이스 개선
- Formulation ML: 화학 정보(SMILES)가 누락된 훈련 데이터셋을 사용하여 머신러닝 모델을 구축할 수 있도록 지원
- 제형 ML: ‘성능’ 탭에 표시되는 목표 특성
- ML 모델 구축: 특징 간 상관관계 임계값에 대한 사용자 제어
- 제형 ML 최적화: 맞춤형 성분 지원 표현자
- 처방 ML 최적화: 다중 CPU 병렬화 지원
- 제형 기계학습 최적화: 제형 최적화를 위해 유전 알고리즘을 사용할 수 있는 옵션
계층형 디바이스 머신러닝
제품: MS 레이어드 디바이스 ML
- OLED 소자 기계학습: 특징 간 상관관계 임계값에 대한 사용자 제어
- OLED 디바이스 ML: ‘성능’ 탭에 표시되는 대상 속성
MS Maestro 빌더 및 도구
- 흡착 열거: WAM, ‘흡착 부위 찾기’ 및 ‘흡착 에너지’ 결과 공개 예정
- 흡착 부위 탐색기: WAM, 흡착 에너지 결과 표시
- 흡착 열거: 프로젝트 테이블 내 출력 구조의 체계적 정리 개선
- 흡착 부위 탐색기: MLFF를 사용하는 작업의 처리 속도 최대 200배 향상
- 구조물 정리: MLFF 지원
- 불규칙 시스템: 구성 요소의 잔기 이름을 정의하는 옵션
- *.vis 파일을 *.cub 형식의 파일로 변환하는 기능 지원 (명령줄)
- 폴리머: CSV 형식 파일에서 결합 확률 가져오기
- 다당류: (+POLYSACCHARIDE_BUILDER) 선형 사슬 다당류를 위한 간소화된 모델 구축 솔루션
- 단일 복합체: 가교 리간드 최신 목록
- 쿼리 본즈: 분자 결정의 다면체 표시
- 결합 쿼리: 비결합 원자 쌍의 검색 및 수정
고전 역학
- 드롭렛: 미리 조립된 드롭렛 모델 사용 지원
- Droplet: 수화물 표면의 접촉각 계산 지원
- 탄성 상수: MLFF 지원
- (+ALLOW_OLD_FORCEFIELD_PARAMETERS) 하위 호환성(2025-4 및 그 이전 버전)을 유지하면서 OPLS4/OPLS5 매개변수를 사용하여 MD를 실행할 수 있도록 지원
- MD 다단계: 패널에 표시된 입력 구조용 FF 유형
- 응력-변형률: MLFF 지원
- 응력-변형률: 이전 변형률 단계의 속도를 사용할 수 있는 옵션
- 표면 장력: 블록 평균화 기법을 활용한 분석 개선
- Tg: (+THERMOPHYSICAL_PROPERTIES_MLFF) MLFF 지원
- 엄브렐라 샘플링: 지질 및 계면활성제 이중층 근처의 소분자에 대해 엄브렐라 샘플링 알고리즘을 실행하기 위한 워크플로 솔루션
- 엄브렐라 샘플링: 창 간의 중복 정도 표시
- 점성: MLFF 시뮬레이션을 위해 기본 시간 단계(0.5 fs)를 조정함
양자역학
- 흡착 에너지: MLFF를 이용한 구조 사전 최적화 옵션
- 흡착 에너지: MLFF를 이용한 원자 위치 제약 조건 지원
- Crest: (+MATSCI_CREST_QCG) CREST 양자 클러스터 성장 유틸리티
- QM 다단계: 이론 목록에서 GFN2-xTB를 선택할 수 있는 옵션
- 광전자 필름의 특성: 분자 종류별 굴절률 비율 표시
- Reaction Network Viewer: Reaction Network Profiler 및 Nanoreactor로 생성된 네트워크를 확인하기 위한 종합 분석 뷰어 GUI
교육 콘텐츠
- 새로운 튜토리얼: 미세동역학 모델링을 통한 촉매 선택성 분석
- 업데이트된 튜토리얼: 결함 형성 에너지 계산
- 업데이트된 튜토리얼: 나노리액터
- 간편 참조 자료: 구조물 정리
교육 콘텐츠
생명과학
- 사용자가 튜토리얼 내에서 바로 워크플로우의 각 단계를 직관적으로 클릭하며 진행할 수 있는, 더욱 상호작용적인 새로운 튜토리얼 경험을 소개합니다. 이 방식은 현재 두 개의 튜토리얼에서 시범 운영 중입니다.
- 업데이트된 튜토리얼: 다음을 이용한 구조 기반 가상 스크리닝 Glide
- 업데이트된 튜토리얼: 구조 준비 및 시각화 개요
- 항체 모델링에 관한 학습 콘텐츠를 전면 개편했습니다:
“BioLuminate에서의 항체 시각화 및 모델링” 튜토리얼은 다른 유용한 자료들과 함께 학습 경로로 구성된 새로운 튜토리얼 모음으로 대체되었습니다.- 새로운 학습 과정: 항체 모델링
- 새로운 튜토리얼: BioLuminate를 활용한 항체 구조 예측 및 시각화
- 새로운 튜토리얼: BioLuminate를 활용한 항체 구조의 인간화
- 새로운 튜토리얼: PIPER를 이용한 항체-항원 도킹
- 새로운 튜토리얼: MM-GBSA 잔기 스캐닝을 활용한 항체 결합력( 안정성)/친화도 향상
- 새로운 튜토리얼: 표적 단백질 분해제의 합리적 설계를 가능하게 하는 3원 복합체 구조 생성
- 업데이트된 튜토리얼: 자유 에너지 섭동을 이용한 BACE1 억제제 설계
- 새로운 빠른 참조 가이드: 포스 필드 빌더
- 새로운 빠른 참조 자료: 리간드 상호작용 다이어그램
재료 과학
- 새로운 튜토리얼: 미세동역학 모델링을 통한 촉매 선택성 분석
- 업데이트된 튜토리얼: 결함 형성 에너지 계산
- 업데이트된 튜토리얼: 나노리액터
- 간편 참조 자료: 구조물 정리
LiveDesign
2026-1 버전의 새로운 기능
- 생물제제
- 천연 단량체를 이용하여 점 돌연변이를 가진 새로운 생물학적 제제를 설계한다
- API 에 접속하여 사용자 정의 단량체를 업로드하고, 서열 뷰어에서 해당 단량체를 확인하세요.
- 사전 입력된 드롭다운 메뉴에서 주석 및 번호 체계를 선택하여, 생물학적 제제 엔티티의 주석이 달린 영역 내에서 부분 시퀀스를 검색합니다.
- 이제 사용자는 지정된 형식으로 잔기별 속성 및 색상 구성 매핑(선택 사항)을 출력하는 모든 모델이나, 해당 출력값을 포함하는 모든 Freeform 열을 사용하여 서열 뷰어에서 잔기를 속성별로 색상 지정할 수 있습니다.
- 고급 검색 패널의 “유형” 드롭다운 메뉴에 있던 “생물학적 제제” 및 “제네릭 의약품” 옵션이 “생물학적 제제/기타”로 통합되었습니다.
- 서열 뷰어에서 분지형 및 순환 펩타이드를 확인하세요
- LiveDesign AI 어시스턴트: AI 어시스턴트를 통해 LiveDesign 과 연동하여 프리폼(Freeform) 및 수식(Formula) 열을 생성하고, 색상 지정 규칙을 생성 및 업데이트하며, 어시스턴트 내에서 데이터 분석을 수행하고 데이터를 그래프로 표시할 수 있을 뿐만 아니라 도움말 문서를 즉시 찾을 수 있습니다. 이 기능을 사용하려면 ‘ LiveDesign ’ ML 플러그인이 필요합니다.
- 프로젝트 대시보드
- 새로운 “활동” 섹션을 통해 새로 추가된 어세이 데이터 및 댓글에 대한 프로젝트 활동 스트림을 확인하세요.
- 이제 프로젝트 대시보드에 표시되는 엔티티 수 통계 및 최근 추가된 엔티티에는 해당 프로젝트에 특별히 가져온 엔티티뿐만 아니라, 프로젝트에서 검색 가능한 모든 엔티티(예: 제한이 없는 프로젝트로 가져온 화합물)가 포함됩니다.
- 모델: 3D 기둥을 입력으로 사용하는 ‘기둥 매개변수 모델’의 경우, 이제 즐겨찾기한 포즈와 LiveReport에 표시되는 포즈 순서를 사용할 수 있습니다.
- UX 개선 사항
- LiveReport에서 실행되지 않은, 실패한, 보류 중인 모델 셀을 필터링하세요
- 패널을 먼저 열지 않고도 메인 스프레드시트에서 화합물 구조를 ‘설계’, ‘검색’ 또는 ‘고급 검색’ 패널로 직접 드래그할 수 있습니다.
- 마우스 가운데 버튼으로 LiveReport 탭을 클릭하여 닫습니다.
- 3D 시각화 도구: 선택한 원자/잔기/사슬에 입체 라벨, 원소 라벨 및 원자 번호 라벨을 적용합니다.
수정된 사항
- ‘로트 등록일’ 열을 입력값으로 사용하는 수식은 계산이 실패하고 LiveReport에 빨간색 오류 막대가 표시되곤 했습니다. 이제 해당 수식은 올바르게 계산되며 오류가 발생하지 않습니다.
- 3D 시각화 도구 또는 Maestro 에서 포즈를 확인하기 위한 메인 스프레드시트 셀 내의 아이콘은 셀 크기를 조정하면 사라지곤 했으나, 이제는 계속 표시됩니다.
- 매트릭스 위젯에 클릭 투 런(click-to-run) 모델 열을 추가하면 위젯이 충돌하여 데이터가 표시되지 않았으나, 이제 클릭 투 런 모델이 매트릭스 위젯에 정상적으로 표시됩니다.
- if() 문을 사용하는 수식은, if() 문에서 여러 값을 포함하는 실험용 어세이 셀을 사용했을 때, 그 값 중 하나가 Null인 경우 계산이 실패했습니다. 이제 해당 수식은 올바르게 계산됩니다.
- “새 레이아웃 만들기” 대화 상자에는 기존 레이아웃을 복사하는 옵션이 표시되지 않았으나, 이제 해당 옵션이 올바르게 표시됩니다.
- “LiveReport 편집 대화 상자”를 사용하여 LiveReport의 제목을 편집하면 LiveReport가 프로젝트 홈 폴더로 이동되었으나, 이제 해당 대화 상자를 통해 LiveReport를 편집하더라도 LiveReport가 다른 폴더로 이동되지 않습니다.
- ‘매트릭스 위젯 구성’ 대화 상자의 서식 옵션 버튼들이 겹쳐져 있어 일부 서식 옵션에 접근할 수 없던 문제가 해결되었으며, 이제 버튼들이 겹치지 않습니다.
- 어세이 의 실험 데이터는 스프레드시트 셀 내 실험값 아래에 점선으로 표시되곤 했으나, 이제는 점선이 표시되지 않습니다.
- aggregateMax() 및 aggregateMin() 수식 함수가 이제 날짜 열에서도 작동합니다.
- 이제 멀티체인 또는 분지형 펩타이드의 식별자에는 순서 뷰어에서 순차적인 펩타이드 번호가 부여되어 정확하게 식별됩니다.
- 이제 시퀀스 뷰어에서는 지원되지 않는 번호 매기기 방식을 사용하는 TCR이 있을 경우 메시지가 표시되며, 시퀀스 뷰어 내에서 해당 TCR을 지원되는 번호 매기기 방식으로 변경할 것을 제안합니다.
- 3D 시각화 도구가 서열 뷰어에서 세부 정보를 탐색 중일 때, 서열 뷰어에서 다른 엔티티를 선택하더라도 서열 뷰어와 3D 시각화 도구에서 기존에 선택된 잔기 선택 상태가 재설정되지 않습니다.
- 다른 모델의 이미지 열을 입력으로 사용하는 매개변수화 모델은 결과를 계산하지 못했으나, 이제는 올바르게 계산합니다.
- 삭제된 모델 신고서를 재계산하면 해당 셀이 계속 깜빡이게 되던 문제가 해결되어, 이제 해당 셀에 ‘실패’ 메시지가 올바르게 표시됩니다.
- 모델이 “기타” 유형의 3D 출력을 반환했을 때, 해당 3D 출력은 다른 매개변수화 모델에서 접근할 수 없었으나, 이제는 접근할 수 있게 되었습니다.
- LDClient: get_models_by_name 메서드에 이제 아카이브된 모델을 제외하는 옵션이 추가되었습니다.
릴리스 2025-4