APR 28, 2026
通过引导式分子实验教学《基于结构的药物设计 》分子对接
通过引导式分子分子对接 工作流教授基于结构的药物设计
分子识别、非共价相互作用和蛋白质结构等概念是化学和生物化学课程的基础。然而，学生通常只是孤立地接触这些主题，未能充分理解它们如何在基于结构的药物设计 中相互融合。本环节将介绍一种引导式的分子分子对接 工作流程，旨在通过将理论知识转化为结构化的分子推理，从而弥合这一差距。
该教学框架将经过精心筛选的蛋白质数据银行（PDB）结构与可免费使用的工具（UCSF Chimera 和 AutoDock Vina）相结合，构建了一个以概念为导向的学习流程。学生将逐步学习受体和配体结构准备 ，执行分子对接 ，并对预测的结合姿态进行系统评估。
本课程的重点不在于计算的复杂程度，而在于分析性
解读，即将氢键网络、疏水作用、空间互补性以及预测的结合亲和力与已确立的化学原理联系起来。 本模块的一个核心特征是批判性评估。学生不应将分子对接 的输出结果视为最终答案，而是应被鼓励对评分函数进行质询、评估构象的合理性、识别潜在的伪影，并区分计算预测与实验验证。这种方法将分子分子对接 定位为一种结构化的探究工具，而非程序化的或“黑箱”式的练习。
参与者将获得一套可直接投入使用的教学资料包，其中包括经过精心筛选的结构文件、详细的教学指南，以及旨在促进分析性讨论和独立解读的结构化练习题。该模块适用于本科高年级或研究生低年级的课程，仅需具备化学或生物化学的基础知识。
幻灯片|PDF
我们的演讲嘉宾
伊莎贝拉·维尔曼
博士研究生
伊莎贝拉·维尔曼（Isabela Wiermann）拥有巴西圣若昂德雷伊联邦大学（Federal University of São João del-Rei）的生物技术理学学士学位，以及生物工程理学硕士学位，研究方向为生物信息学和分子模拟（分子建模 ）。她的研究主要集中在计算药物发现领域，包括基于结构的药物设计、分子分子对接 、分子力学模拟（分子动力学 (MD) ）以及结合自由能分析。 她目前是生物工程专业的博士研究生，其研究工作整合了化学信息学、药效团建模和分子模拟 方法，旨在为神经退行性疾病筛选潜在的治疗候选药物。除研究工作外，她特别致力于推动计算分子建模 方法在化学与生物化学教育中的整合，并在课堂上培养学生对预测模型的分析推理与批判性解读能力。