PyMOL课程用的阿司匹林分子背景图片

使用 PyMOL 3 进行科学可视化

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可用语言
中文、英语、日语、韩语
时长
3周内最多15小时
级别
简介
成本
只要安装了可正常运行的 PyMOL 3 并拥有有效许可证,任何人都可以免费参加本课程
课程时间安排
为期三周的自助游
在注册课程时,您将选择为期三周的课程班的开课日期。课程班开始后,您将能够异步访问课程内容,因此可以在三周内根据自己的时间安排,在最合适的时候完成实践教程、检查点以及影片制作作业。

概述

参加我们的“使用 PyMOL 3 可视化科学”在线认证课程,让您的生物化学学习焕发活力,并学习如何利用 PyMOL 释放电影制作的力量。

在我们的“使用 PyMOL 3 可视化科学”施罗丁格在线课程中,您将逐步掌握如何操作更新后的 PyMOL 3 分子可视化系统,创建高质量的图像和引人入胜的动画,甚至能够将您在施罗丁格平台上的科研成果直接导入 PyMOL 3。

为期3周的 自学 课程 旨在向PyMOL的新用户和有经验的用户介绍PyMOL 3。

要求
本课程要求您使用自己安装的 PyMOL 3 并持有有效的许可证。

点击此处查看 PyMOL 3 的安装和授权信息。
 

建议
  • 为了获得最佳的实践体验,建议使用三键鼠标和一台大屏幕显示器或额外显示器。这样,您在观看课程视频教程的同时,也能更方便地使用自己安装的 PyMOL 3 进行操作练习。
  • 了解化学和高分子结构——例如DNA结构、氨基酸结构和蛋白质结构——以及掌握一些化学键和化学反应的知识会有所帮助,但并非必需。
认证
  • 由薛定谔课程负责人签发的证书,可添加至您的简历中
  • 一枚可以发布到社交媒体(例如领英)上的徽章
背景图案

您将学到什么

学习 PyMOL 3 界面操作的基础知识

面向新老 PyMOL 用户介绍 PyMOL 3:内容涵盖从导入结构和保存会话文件,到创建和操作选区及对象、自定义预设,以及通过光线追踪生成适合发表的图像

在 PyMOL 3 中快速轻松地制作基于场景的动画

将Schrodinger套件中的结果直接导入PyMOL,以可视化方式呈现您的研究成果。了解如何保存工作区视图并在它们之间进行插值,只需点击几下,即可讲述引人入胜的科学故事。

亲身体验先进的电影制作功能

利用全新的 PyMOL 3 时间轴上的多个时间线,对结构对象进行变换、创意调整摄像机视角,并修改样式设置。通过结合动态摄像机程序和多状态对象(如核磁共振(NMR)结构和分子动力学(MD)轨迹),制作引人入胜、以运动为驱动的动画影片。

利用课程工作流,讲述一个引人入胜的、属于你自己的视觉科学故事

运用您掌握的 PyMOL 3 技能和课程中的最佳实践,通过一项富有创意的视频制作作业,以您自选的结构和风格来展示您的科研成果。

模块

第1模块
1 小时

《使用 PyMOL 3 进行科学可视化》课程简介

视频
视频
  • 课程范围认证与荣誉守则
  • PyMOL 3 简介
作业
指导
  • PyMOL 3 和 Maestro 的安装与授权
  • 课程帮助与常见问题解答
结束检查点
荣誉守则协议与检查点
第2模块
5小时

PyMOL 3 界面操作基础

视频教程
视频教程
  • PyMOL 3 会话入门
  • 定义和设置对象及选区的样式
  • 通过考察结构来讲述科学故事
  • 结合位点的选择、相互作用和标记
  • 创建和编辑预设
  • 保存视图、图像和光线追踪结果
结束检查点
模块结束检查点
第3模块
3小时

在 PyMOL 3 中快速轻松地制作动画

视频教程
视频教程
  • 在Maestro中创建场景以讲述科学故事
  • 将Maestro中的场景发送至PyMOL 3以制作动画
  • 在 PyMOL 3 中保存场景并将其添加到时间轴以制作动画
结束检查点
模块结束检查点
第4模块
6小时

PyMOL 3 中的高级动画制作

视频教程
视频教程
  • 使用操作柄变换对象并保存摄像机视图
  • 时间线项目与透明度子议题
  • 创建多状态动画
  • 利用分子动力学轨迹制作电影
课程结业
认证

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我们自豪地支持新一代科学家,并致力于为资源有限的人士提供机会。无论您是学生、博士后还是行业科学家,都可以了解我们在线认证课程的资助方案,并立即报名!

校友心声

“《使用 PyMOL 3 可视化科学》这门课程的内容非常引人入胜,我学得十分愉快;各模块讲解通俗易懂,并且详细介绍了 PyMOL 3 的新功能。”
约书亚·费尔南德斯,纽约市立技术学院学生
“这门课程对我很有帮助,不仅提升了我在PyMOL 3上的分子可视化技能,还让我接触到了更多可在研究中运用的工具。PyMOL 3生成的视频和图像质量令人印象深刻,因此我今后会在工作中定期使用PyMOL 3。”
陈安敏,维也纳农业大学(BOKU Wien)博士后研究员
“这是一门关于电影制作的绝佳速成课程,无论对PyMOL初学者还是专家来说,都能真正受益。”
赖利·奥萨切伊·布朗,波士顿大学研究生
“在课程中,我注意到 PyMOL 3 取得了显著进步。新增的‘场景’和‘时间轴’选项卡让创建高质量的图像和视频变得更加容易。”
哈吉·阿斯兰·奥努尔·伊什奇尔,阿克地中海大学学生
“这门课程非常实用。我学到了PyMOL中的许多功能,还学会了如何利用分子动力学轨迹制作动画。”
辛杜·坦加拉杰,Jubilant Biosys高级研究科学家

通过课程徽章和证书,展示你新掌握的技能

当您完成我们提供的分子建模课程,并准备将所学知识分享给同事和雇主时,可以在您的 LinkedIn 个人资料中展示您的证书和徽章。

常见问题

PyMOL 在线课程的费用是多少?

该课程对 PyMOL 许可证持有者免费。您必须拥有自己的 PyMOL 3 安装版本和许可证,才能参加本课程、完成作业并获得证书。

如何安装 PyMOL 3?

请参阅此处的说明:

为什么我需要 PyMOL 3 许可证?如何获取?

PyMOL 是一个基于开源基础、由用户赞助的分子可视化系统,由 Schrödinger 负责维护和分发。它是一款商业产品(通常称为 Incentive PyMOL),但 Schrödinger 根据一项宽松的许可协议(称为 Open Source PyMOL)免费开放了大部分 PyMOL 源代码。

该开源项目由 Schrödinger 维护,其资金最终来源于所有购买 PyMOL 许可证的用户。成为赞助用户后,订阅者在订阅期内可获得软件升级、英语技术支持以及官方在线文档的访问权限。PyMOL 3 是近期开发并发布的最新版本,因此其许多新功能目前仅对 Incentive 订阅用户开放。 例如,PyMOL 3 中的“时间轴”(用于制作动画)仅在检测到有效许可证时才会生效。如需成为赞助商并获取您的 Incentive PyMOL 许可证:

如何安装 PyMOL 3 许可证?

下载许可证文件。将其保存到您的工作站上,然后在 PyMOL 提示您输入许可证时,选择该文件。如需了解更多信息,请按照此处的指引操作:

如果我的 Incentive PyMOL 许可证已过期,我该怎么办?

如需成为赞助商并获取用于商业或全站点许可证续期的Incentive PyMOL 3许可证,请联系 sales@schrodinger.com。

要修读这门课程,我需要具备多少科学知识?

本课程侧重于科学可视化。了解化学和 macromolecule 结构(如 DNA 结构、氨基酸结构和蛋白质结构),以及掌握一些化学键、化学反应和静电相互作用的相关知识将有所帮助,但课程重点在于如何使用 PyMOL 3。 若想进一步了解众多分子、靶点及工作流背后的科学原理,请查阅我们提供的其他施罗丁格在线认证课程,包括生命科学课程和材料科学课程。我们鼓励用户使用施罗丁格平台开展科学研究,并通过 PyMOL 向全世界展示研究成果。

我为什么要选修这门课程?

本课程旨在帮助新老 PyMOL 用户通过 PyMOL 3 获得科学可视化和视频制作的实践经验。

通过我们的课程平台学习本课程,您将享有以下资源:结构化的学习资料、视频教程、输入文件和 PyMOL 会话示例文件、互动式检查点测验,以及一项由 Schrödinger 科学家评审的最终视频制作作业。 完成所有课程内容后,您将获得“使用 PyMOL 3 进行科学可视化”课程证书和虚拟徽章,可将其展示在您的 LinkedIn 和社交媒体个人资料中。

施罗丁格在线课程的证书和虚拟徽章常被我们的学员用于展示其对施罗丁格软件及最佳实践的掌握和理解。您可以在下方进一步了解我们的在线课程,并查看部分学员的评价。 在您的简历、履历或职业发展成就中列出课程证书,向大家展示您的新技能吧!

如何获得课程证书?

您需要完成所有课程课时、进度测试和作业(完成率:100%),才有资格获得课程证书和虚拟徽章。 检查点测验采用自动评分,您可以不限次数重考。第4模块末尾的视频制作作业要求您使用PyMOL 3,以自选的结构或研究成果为内容,制作一部讲述科学故事的视频。您上传的视频将由Schrödinger的科学家进行人工审核,一旦通过审核,该作业即视为“完成”,您将有资格获得课程证书。

我的课程注册有效期有多长?

您对本课程的注册资格(即通过 courses.schrodinger.com 平台访问学习资料的权限)将自您收到注册确认邮件及课程平台登录凭证之日起有效期为三周。虽然完成本课程预计耗时不超过15小时,但请合理安排时间,并务必在注册资格到期前完成所有学习内容,并复习您希望重温的任何资料。 如果您需要更多时间,可在课程平台内选择申请延期。

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