OCT 31, 2025
Schrödinger デジタル創薬セミナー 20:
In silico cryptic binding site detection and prioritization
インシリコ手法を活用した潜在的結合部位の探索と評価
クリプティック結合部位探索の新戦略 ― MxMD×SiteMap による革新的ワークフロー
従来のオルソステリックアプローチでは、選択性や耐性、開発適合性などの問題から攻略が難しい創薬ターゲットに対し、クリプティック結合部位（通常の構造では見えない潜在的部位）を狙う戦略が注目を集めています。しかし特に、アポ構造からは観測できないクリプティック部位の検出と評価は、初期創薬における大きな課題のひとつです。
本ウェビナーでは、混合溶媒分子動力学法（MxMD）とSiteMapを組み合わせた新しい計算ワークフローをご紹介します。この統合的アプローチにより、61ターゲットからなるベンチマークセットにおいて、83％という高い成功率でクリプティック結合部位を検出することに成功しました。新しいワークフローが、クリプティック結合部位の同定を支援し、新規ターゲットに対する構造ベース創薬をどのように加速させるのか、ぜひご参加のうえご確認ください。
ウェビナーハイライト
- MxMD法の概要
- MxMD＋SiteMapワークフローによるクリプティック結合部位の同定
- 機械学習手法やSiteMap標準検出モードとの性能比較
Our Speakers
Da Shi
Principal Scientist I, Life Science Software, Schrödinger
Hit Discoveryチームで、難解な結合部位の同定とFEPリガンドポーズ生成に関するワークフローの開発に取り組んでいます。
Dima Lupyan
Senior Principal Scientist, Life Science Software, Schrödinger
DesmondおよびFEP解析ツールの開発を主導し、分子動力学分野における専門知識を発揮しています。特に、Schrödinger社のMD、MxMD、FEP+製品群の基盤となるシミュレーション解析用Python APIの開発に携わっています。