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ConfGen

准确高效的构象 搜索解决方案

生命科学:ConfGen

探索配体构象 的构象空间,以生成合理且热力学上可行的结构

ConfGen 是一种基于知识的方法,它结合了经验推导出的启发式算法和基于物理理论 力场计算,能够高效生成高质量、多样化且低能的小分子三维构象。该方法提高了生成的构象中生物活性构象的检出率,并极大地加快了基于配体的虚拟筛选 中的构象生成速度。

核心能力

生成数量较少但高效的构象,从而在下游应用中实现更快的搜索速度,并在不牺牲准确性的前提下提高富集效率
根据具体情况,利用单点能量计算准确识别局部扭转极小值
从多种经过充分验证的预设选项中进行选择,以完全掌控各项设置,或者根据项目需求在速度与准确性之间选择一个合适的折中方案
以卓越的速度和能力重现RMSD值较低的生物活性构象
精选使用 ConfGen 准确、快速地生成构象

使用 ConfGen 准确、快速地生成构象

凭借其卓越的速度以及再现低RMSD生物活性构象的能力,ConfGen是基于配体的虚拟筛选 生成构象的理想解决方案。本白皮书概述了ConfGen在虚拟筛选 应用中的速度和准确性。

阅读白皮书

文档与教程

了解常见问题的解答,并掌握使用Schrödinger软件的最佳实践。

生命科学 教程

学习路径:环肽建模

关于药物发现中环肽 所用工具和工作流的系统性概述。

生命科学 教程

生成三元复合结构,以实现靶向蛋白降解剂的理性设计

生成并评估靶点-PROTAC(蛋白降解靶向嵌合体)-连接酶复合物的结构,以便构建连接子优化 。

生命科学 文档

ConfGen

ConfGen 文档,包括在线帮助和用户手册。

生命科学 文档

学习路径:虚拟筛选

关于如何构建虚拟筛选 管道的结构化概述。

生命科学 教程

构象 使用 MacroModel 和 ConfGen 对小分子进行分析

研究相关小分子的扭转分布,以及构象如何影响分子内和分子间相互作用。

相关产品

进一步了解可用于推进您研究项目的相关计算技术。

FEP+

用于药物发现的高性能自由能计算

Phase

一款易于使用的药效团建模解决方案,适用于配体导向和结构导向的药物设计

Shape 筛选

基于配体的、针对数百万至数十亿个分子的高效虚拟筛选

出版物

浏览采用Schrödinger 技术、发表在相关应用领域的经同行评审的出版物列表。

生命科学 出版物

商用Conformer集合生成器的基准测试

生命科学 出版物

探索基于配体的虚拟筛选 和3D QSAR建模中的构象 搜索协议

生命科学 出版物

优化, 作为乳腺癌迁移和增殖抑制剂的西福兰类化合物的药效团建模与3D-QSAR研究

生命科学 出版物

基于生物引导的发现及药效团建模:作为乳腺癌增殖、迁移和侵袭抑制剂的真菌毒素吲哚二萜类生物碱——佩尼特雷姆类化合物

生命科学 出版物

通过以下方法改善多肽的分子对接 :Glide

生命科学 出版物

利用数据融合增强虚拟筛选 富集分析:整合来自二维指纹、形状和分子对接

生命科学 出版物

利用LigPrep/ConfGen套件分析药物样生物活性结构及构象 覆盖率:与MOE和Catalyst程序的比较

生命科学 出版物

ConfGen:一种基于构象 的搜索方法,用于高效生成生物活性构象异构体

培训与资源

在线认证课程

通过分子建模 的实践性在线课程,提升您的技能水平。这些可自主安排学习进度的课程涵盖了广泛的科学主题,并提供Schrödinger 软件的使用权限及技术支持。

教程

了解如何将Schrödinger 软件的技术和最佳实践应用于您的项目,以确保项目成功。查找培训资源、教程、快速入门指南、视频等内容。