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Shape 筛选

基于配体的、针对数百万至数十亿个分子的高效虚拟筛选

快速筛选超大规模文库

概述

Shape 筛选 这是一种基于配体的工作流程,可高效地筛选 超大规模的可购买或可合成的化合物库。系统会根据与参考配体的形状重叠质量,对符合化学直觉的配体对齐结果进行评分。Shape 筛选 能够识别出具有活性的潜在苗头化合物 分子,即使这些分子在拓扑结构上与已知的参考配体不同,这也使其成为一种强大的基于配体的筛选 方法。

通过单一访问许可证访问多个Shape 筛选 工作流

快Shape

以比Shape GPU性能高出30%的速度存储和筛选数百亿至数千亿个分子,同时将硬盘需求降低100倍

Shape GPU

对数百万个分子进行基于GPU加速的高通量虚拟筛选,每秒可进行约11,000次比对

Shape CPU

在多核CPU上快速筛选数十万至数百万个分子

核心能力

生成直观、信息丰富且高质量的常见支架三维对齐图
从包含1个至超过10亿种化合物的化合物库中识别真正的命中结果
借助Enamine、Mcule、Molport、WuXi、Millipore Sigma和Sigma-Aldrich等供应商提供的现成化合物库,快速启动您的筛选 项目
通过单一访问许可证访问多个Shape 筛选 工作流

Shape 筛选 工作流说明

工作流程 描述 库大小 筛选时间 4.0B(天) 筛选时间 6.5B(天) 6.5B(TB)的存储空间
快Shape 1D-SIM*预滤波器与Shape 处理器的组合 筛选 > 40亿 5.2 5.5‡ 0.4
Shape GPU GPU加速的3D筛选 < 5.0 billion 4.6 7.5‡ 33
Shape CPU 基于CPU的3D筛选 < 10 million NA简体中文(大陆) NA简体中文(大陆) NA简体中文(大陆)

超大规模库时代的 QuickShape筛选

了解 QuickShape——这是一种结合了 1D 和 3D 方法的自动化分阶段工作流程,能够对规模达数百亿分子的化合物库进行高效的 3D-Shape 筛选。

利用现成的商用库,节省计算时间和精力,用于Shape 筛选

Schrödinger 已与多家领先供应商建立合作,助您访问包含数百万至数十亿种化合物的商业数据库,其中涵盖片段、先导化合物 类、近药物样及药物样化合物,涉及范围极为广泛化学空间 。

MCule
PWuXi-AppTec
西格玛-阿尔德里奇
MolPort
烯胺

文档与教程

了解常见问题的解答,并掌握使用Schrödinger软件的最佳实践。

生命科学 文档

Shape 筛选

一种基于配体的工作流程,用于高效地筛选 超大规模的可购买或可合成的化合物库。

生命科学 文档

学习路径:虚拟筛选

关于如何构建虚拟筛选 管道的结构化概述。

生命科学 教程

基于配体的筛选 技术,适用于超大规模文库,配合QuickShape 和苗头化合物 分析仪使用

对一个包含20000种化合物的化合物库执行快速Shape (筛选 )分析,并分析结果。

生命科学 教程

利用GPU对化学库进行快速筛选 Shape

利用 GPUShape 对包含 20,000 种化合物的化学库进行基于形状的快速筛选 。

相关产品

进一步了解可用于推进您研究项目的相关计算技术。

Phase

一款易于使用的药效团建模解决方案,适用于配体导向和结构导向的药物设计

ConfGen

准确高效的构象 搜索解决方案

现成的商业库

已完全准备好的可购买化合物数据库

出版物

浏览采用Schrödinger 技术、发表在相关应用领域的经同行评审的出版物列表。

生命科学 出版物

Shape-基于十亿次虚拟筛选 的化合物库 技术,成功鉴定出分枝杆菌脂酰胺脱氢酶抑制剂-

生命科学 出版物

探索基于配体的虚拟筛选 和3D QSAR建模中的构象 搜索协议

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利用数据融合增强虚拟筛选 富集分析:整合来自二维指纹、形状和分子对接

生命科学 出版物

基于结构的MT2褪黑素受体虚拟筛选 :模板选择与结构精修的影响

培训与资源

在线认证课程

通过分子建模 的实践性在线课程,提升您的技能水平。这些可自主安排学习进度的课程涵盖了广泛的科学主题,并提供Schrödinger 软件的使用权限及技术支持。

教程

了解如何将Schrödinger 软件的技术和最佳实践应用于您的项目,以确保项目成功。查找培训资源、教程、快速入门指南、视频等内容。