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Phase

一款易于使用的药效团建模解决方案,适用于配体导向和结构导向的药物设计

建立并验证药效团假说

利用药效团识别新型候选化合物筛选

Phase 这是一款直观的药效团建模工具,可基于已知具有生物活性的分子的空间位阻和电子特性对化合物进行评估。Phase 采用了一种独特的通用药效团感知算法,该算法专为在先导化合物 优化 和虚拟筛选 环境中使用而设计,并有助于在缺乏蛋白质结构的情况下理解未知化合物结合位点 。

核心能力

借助直观的用户界面,轻松设置、执行和分析药理基团筛选
筛选并确定与受体相互作用的化学特征的空间排列,并利用结合信息更好地识别可能与靶点 受体结合的新化合物和化学类型
基于蛋白质-配体复合物、无配体蛋白质或配体生成假设,并有选择地合并假设特征以构建混合模型 
对药效团的构建、生成和筛选
快速、全面地采样构象 、电离态和互变异构态,并可选配使用业界领先的OPLS4力场进行最小化计算,以构建phase 数据库 
利用来自Enamine、MilliporeSigma、MolPort和Mcule的、已完全准备好的可购买化合物数据库,实现开箱即用筛选

利用现成的商用库,节省计算时间和精力,用于Phase

Schrödinger 已与多家领先供应商建立合作,助您访问包含数百万至数十亿种化合物的商业数据库,其中涵盖片段、先导化合物 类、近药物样及药物样化合物,涉及范围极为广泛化学空间 。

MCule
PWuXi-AppTec
西格玛-阿尔德里奇
MolPort
烯胺
案例研究案例研究_Nimbus-ACC

通过计算指导的设计以及对水能态的评估,发现了一种新型、强效的ACC抑制剂,该发现源于结合位点

了解Nimbus如何利用以水合能为指导的虚拟筛选 工作流程,筛选出高效、高选择性的抑制剂。

阅读案例研究

文档与教程

了解常见问题的解答,并掌握使用Schrödinger软件的最佳实践。

生命科学 文档

Phase

一款直观的药效团建模工具,可根据已知具有生物活性的分子的空间位阻和电子特性对化合物进行评估。

生命科学 教程

基于配体的筛选 技术,适用于超大规模文库,配合QuickShape 和苗头化合物 分析仪使用

对一个包含20000种化合物的化合物库执行快速Shape (筛选 )分析,并分析结果。

生命科学 教程

基于配体的虚拟筛选 ,采用Phase

基于同属及多样化的配体集,构建并分析药效团假说。

生命科学 教程

基于结构的虚拟筛选 ,使用Phase

基于蛋白质-配体复合物生成的药效团模型进行构建和分析。

生命科学 教程

利用GPU对化学库进行快速筛选 Shape

利用 GPUShape 对包含 20,000 种化合物的化学库进行基于形状的快速筛选 。

相关产品

进一步了解可用于推进您研究项目的相关计算技术。

Shape 筛选

基于配体的、针对数百万至数十亿个分子的高效虚拟筛选

Glide

业界领先的配体-受体分子对接 解决方案

Epik

pKa 及质子化状态快速预测工具

ConfGen

准确高效的构象 搜索解决方案

出版物

浏览采用Schrödinger 技术、发表在相关应用领域的经同行评审的出版物列表。

生命科学 出版物

ePharmaLib:一个功能多样的电子药效团库,用于研究小分子(多)药理学

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基于配体的“2受体结合口袋”综合映射

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用于快速体外评估hERG K+通道的计算工具亲和力

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鉴定出可抑制朊病毒病中PrPSc复制的全新荧光探针

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基于结构的虚拟发现:一种高度选择性丁酰胆碱酯酶抑制剂的发现及其结构活性关系筛选

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基于克霉唑的药效团探索:3D-QSAR研究及新型抗疟药的合成

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基于结构的虚拟筛选发现噻吩喹诺酮衍生物作为选择性且非竞争性ATP的CDK5/p25抑制剂筛选

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优化, 作为乳腺癌迁移和增殖抑制剂的西福兰类化合物的药效团建模与3D-QSAR研究

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结合多重电子药效团建模与高通量虚拟筛选 和分子对接 ,以筛选“-Secretase(BACE1)”的潜在抑制剂

生命科学 出版物

IDSite:一种预测P450介导的药物代谢的精确方法

培训与资源

在线认证课程

通过分子建模 的实践性在线课程,提升您的技能水平。这些可自主安排学习进度的课程涵盖了广泛的科学主题,并提供Schrödinger 软件的使用权限及技术支持。

教程

了解如何将Schrödinger 软件的技术和最佳实践应用于您的项目,以确保项目成功。查找培训资源、教程、快速入门指南、视频等内容。