MacroModel
功能多样、功能齐全的分子建模 程序
功能多样、功能齐全的分子建模 程序
MacroModel 是一款基于力场的分子建模 工具,具备一系列先进的功能和方法,用于研究分子构象、分子运动以及分子间相互作用。这款灵活的程序可应用于多种研究领域,包括有机和无机分子及寡聚体、有机金属配合物以及复杂的生物系统。
结合高质量力场和GB/SA隐式溶剂化模型,获得可靠的能量学估计
充分利用构象 提供的多种搜索方法,该软件能够处理从小分子到完整蛋白质的各类系统,并支持设置约束条件,将计算范围聚焦于特定区域,从而提高计算速度
应用约束条件,将计算范围限定在较小区域内,以提高速度
对许多不同的输入分子自动分别进行计算
提高构象 中调查和最小化操作的效率与准确性,以用于分子力学(MM) 、分子动力学 (MD) 和量子力学(QM) 的计算
利用多种力场,包括 MM2、MM3、AMBER、AMBER94、MMFF、MMFFs、OPLS、OPLS_2005 和 OPLS4,以支持广泛的研究应用
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