2025年4月23日
RNAおよびDNAを標的とする分子の発見と最適化に向けた計算戦略
核酸とリガンド との結合を正確に予測することは、現在の計算手法にとって依然として大きな課題となっている。この制約により、抗がん、抗ウイルス、抗菌作用を持つものを含め、RNAやDNAの活性を調節する低分子医薬品の開発において、インシリコ手法の応用が制限されてきた。
本ウェビナーでは、Schrödingerの先進的な計算ソリューションが、低分子によるRNAおよびDNAシステムへの正確かつ効率的な標的化をいかに実現しているかをご紹介します。 RNA受容体を標的とした構造 に基づく創薬を実現する、in silicoヒット発見ワークフローにおける最近の改良点についてご紹介します。さらに、相対結合自由エネルギーの摂動を活用し、RNAおよびDNAを標的とする創薬プログラムにおけるリード化合物の最適化を確実に導く別の研究についても取り上げます。この研究では、多様なリガンド および受容体 のクラス、ならびに様々なリガンド-核酸結合様式について、遡及的 を用いた体系的な評価を解説します。
ウェビナーの見どころ
- Glide 、SiteMap、および絶対結合法を用いた、低分子とRNAおよびDNAとのドッキング手法について理解を深め、その最新の結果を確認するFEP+
- 相対結合能を用いたRNAおよびDNA標的分子の最適化戦略を探るFEP+
登壇者
アラ・アブラミャン
アプリケーションサイエンス部門、主任研究員I、Schrödinger
アラ・アブラミヤンは、アプリケーションサイエンス部門（グループ ）に所属し、顧客が創薬活動においてSchrödingerの創薬スイートを活用できるよう支援しています。カスタマーサポート業務以外では、IFD-MD（Desmond ）やFEP+ をはじめとするワークフローを用いて、核酸および膜トランスポーターを基盤とするシステムに関する社内外の共同プロジェクトを主導しています。Schrödinger に入社する前は、NIHでポスドク研究員として、分子動力学（MD）シミュレーションやマルコフ状態モデルを用いて、神経伝達物質トランスポーターシステムに結合する化合物に関するプロジェクトを主導していました。 それ以前は、フィラデルフィアのユニバーシティ・オブ・ザ・サイエンシズで博士号を取得し、フォールダマーおよびフォールダマー-DNA系について、MDおよびメタダイナミクスシミュレーションを用いた研究を行うとともに、フォールダマーを正確に記述するための力場のパラメータ化にも取り組んだ。
ゲイリー・チャン
ヒット・ディスカバリー ディレクター、Schrödinger
ゲイリー・チャン博士は、Schrödinger のドッキング技術担当プロダクトマネージャーです。ゲイリーは、Schrödinger のドッキングツールの性能向上と適用領域の拡大に取り組むチームを率いています。デューク大学で、生物系における電荷移動経路の工学的研究を行い、博士号を取得した後、スクリプス研究所でポスドク研究員として、ペプチドドッキングの性能向上に取り組んできました。