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WaterMap

リガンド の最適化に向けた、水溶媒化されたリガンド 結合部位のエネルギー特性を評価するための、構造 を用いた最先端の手法

背景画像 WaterMap

リガンド デザインの新たな可能性を発見しましょう

WaterMapは、タンパク質の結合ポケット内における溶媒化水の位置とエネルギーを確実に算出するための高度なソリューションです。リガンド の設計および最適化を導く重要な知見を提供することで、WaterMapは構造 を用いた創薬において極めて影響力の大きいソリューションであり、現在臨床開発段階にあるいくつかの成功した創薬プログラムでもその有効性が実証されています。

主な機能

結合部位における高エネルギーの可動性水分子の位置と熱力学的ポテンシャルを予測し、創薬設計に役立てる
低分子の結合を促進するポケットの特性や疎水性力に関する知見を得る
水和部位を可視化することで、SARの解釈を容易にし、活性 および選択性を向上させるための知見を得る
WaterMapを、酵素、GPCR、ブロモドメイン、核酸、タンパク質間相互作用界面など、幅広いシステムに適用する
事例研究WaterMapを用いた新規かつ強力なACC阻害剤の発見

結合部位における水のエネルギー動態の、計算機支援による設計と評価

WaterMapを用いた新規かつ強力なACC阻害剤の発見

Nimbus Therapeutics社が、水和エネルギクスに基づくバーチャルスクリーニングワークフローを用いて、強力かつ選択性の高い阻害剤をどのように特定したかをご覧ください。

ケーススタディを読む

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15-PGDH阻害剤に関する知見および構造 を用いた創薬

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構造-ドメイン選択性ブロモドメインおよび末端外N末端ブロモドメイン化学プローブの設計指針

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非ヌクレオシド系阻害剤による呼吸器合胞体ウイルスポリメラーゼの阻害に関する構造的・機構的知見

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初のATP競合型III型c-MET阻害剤の発見と最適化

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タンパク質分解における三元複合体の安定性について:インシリコによる分子接着剤の結合親和性の計算

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ドキュメントとチュートリアル

Schrödingerのソフトウェアに関するよくある質問への回答や、その活用におけるベストプラクティスをご確認ください。

ライフサイエンス ドキュメント

WaterMap

水分子を明示的に導入して効率的に収束させた分子動力学(MD)シミュレーションを実行し、得られた軌跡を解析して水和部位をクラスタリングする。

ライフサイエンス ドキュメント

学習パス:計算機を用いたターゲット 解析

生体高分子の構造 (構造)と柔軟性を理解するためのツールとワークフローに関する体系的な概要。

ライフサイエンス チュートリアル

WaterMapを用いた結合部位の要件の特定とリード化合物の最適化

WaterMapおよびWM/MMスコアリングの結果を同定 の不安定な水和物について検討し、リガンド の結合を評価する。

ライフサイエンス チュートリアル

ターゲット SiteMapとWaterMapを用いた分析

同定 受容体 上の潜在的な活性部位。

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Glide

業界をリードするリガンド-受容体 ドッキングソリューション

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創薬のための高性能な自由エネルギー計算

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デジタル分子設計のための総合ラボ

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分子探索のための包括的なモデリング環境

トレーニングとリソース

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チュートリアル

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