Desmond
高いスケーラビリティ、スループット、および科学的精度を備えた高性能分子動力学（MD）エンジン
高速かつ高精度な分子動力学シミュレーションを用いて、システムの主要な特性を理解・予測する
Desmond これは、GPUを活用した高性能分子動力学（MD）エンジンであり、小分子タンパク質、ウイルスカプシド、タンパク質-リガンド 複合体、混合溶媒中の低分子、有機固体、および合成高分子複合体といった生物学的システムのシミュレーションを行うためのものです。
メリットDesmond
GPUによる高速化
一般的なネットワークおよびハイエンドネットワークを備えた汎用Linuxクラスタ上で卓越したスループットを実現し、単一CPUと比較して汎用GPU（GPGPU）の演算速度を100倍向上させます。
抜群の精度
数値的精度、安定性、および厳密性に重点を置いて構築されたDesmondの性能により、ナノメートルからマイクロメートル規模の大規模な構造を、ピコ秒からマイクロ秒の時間スケールでシミュレーションすることが可能となります。
信頼できるエネルギー技術
原子レベル力場モデルにおけるエネルギーおよび力の計算のための堅牢なフレームワークを提供し、生体分子研究で一般的に用いられる化学反応と互換性がある
現実的なシミュレーション
長距離静電相互作用の計算に細心の注意を払いながら、シミュレーションボックスを用いて周期境界条件下の明示的溶媒シミュレーションを実行し、明示的な脂質膜を持つタンパク質および核酸系のモデル化に利用することができる。
使いやすいインターフェース
インテリジェントなデフォルト設定を提供し、直感的なインターフェースで計算実験を迅速にセットアップできるほか、システム構築、解析ツール、力場の割り当てを含むシミュレーション設定の自動化もサポートしています。
強力な分析ツール
同一の Maestro モデリング環境内で、量子力学から機械学習に至るまで、包括的なモデリングツール群と連携して、計算結果の可視化と検証が可能になります
用途
左右の矢印キーを使って、スライド間を移動してください。
混合溶媒分子動力学（MxMD）
サンプリングの強化によるクリプティックポケットの同定精度の向上。MxMDと当社の新しいインターフェースを組み合わせることで、タンパク質表面上のクリプティック結合ポケットの設定、解析、およびカスタマイズ可能な可視化を簡素化します。
解離速度論
解離速度解析を用いて、リガンド と受容体 との相互作用を解明する。拡張サンプリング法を用いて同定 への解離経路を可視化し、解離速度に基づいて有望なリード化合物を最適化する。
NVIDIAの公式パートナー
Schrödinger NVIDIA社と戦略的パートナーシップを締結し、当社の計算機支援創薬プラットフォームをNVIDIAのGPU技術に合わせて最適化しています。
ドキュメントとチュートリアル
Schrödingerのソフトウェアに関するよくある質問への回答や、その活用におけるベストプラクティスをご確認ください。
事例紹介とウェビナー
Schrödinger の技術が、現実の研究課題の解決にどのように活用されているかをご覧ください。
出版物
関連する応用分野において、Schrödinger 技術を採用した査読付き論文の一覧をご覧ください。